Variability in indigenous Pakistani tomato lines and worldwide reference collection for Tomato Mosaic Virus (ToMV) and Tomato Yellow Leaf Curl Virus (TYLCV) infection

Abstract Local and exotic germplasm of tomato remains a major source for genetic improvement. Assessment of such lines for biotic stresses particularly viral diseases are the most important criteria for selection in Pakistan, where Tomato Yellow Leaf Curl Virus (TYLCV) and Tomato Mosaic Virus (ToMV) are the major diseases/viruses. A set of 40 accessions (including indigenous Pakistani lines and exotic germplasm from Europe, the United States, and Asia) were evaluated for their resistance/infection response to ToMV with artificial inoculation under greenhouse conditions. Infection response was quantified through disease scoring and DAS-ELISA test (for ToMV). A subset of 24 lines, was further screened for TYLCV using disease scoring and TAS-ELISA. The tested lines showed significant variability for resistance to ToMV. Only one accession (Acc-17878) was resistant to the ToMV whereas seven accessions i.e. Acc-17890, AVR-261, CLN-312, AVR-321, EUR-333, CLN-352, and CLN-362 expressed resistance to TYLCV. Correlation between phenotypic evaluation was confirmed by the ELISA results in both diseases, although both tools complemented to assess the viral infection status. In future, tomato breeding programs must consider breeding for ToMV and TYLCV resistance (using identified germplasm in our study) so as to deliver virus resistant tomato varieties.

RESUMO O germoplasma local e exótico do tomate continua sendo uma importante fonte de melhoramento genético. A avaliação de linhagens para estresses bióticos, particularmente as doenças virais, é o critério mais importantes para seleção no Paquistão, onde o vírus da folha amarela do tomate (TYLCV) e o vírus do mosaico do tomateiro (ToMV) são as principais doenças/vírus. Um conjunto de 40 acessos (incluindo linhagens indígenas do Paquistão e germoplasma exótico da Europa, dos Estados Unidos e da Ásia) foi avaliado quanto à resistência/resposta à infecção ao ToMV com inoculação artificial em casa de vegetação. A resposta à infecção foi quantificada por meio de pontuação da doença e de teste DAS-ELISA (para ToMV). Um subconjunto de 24 linhas foi posteriormente rastreado para TYLCV usando pontuação de doença e TAS-ELISA. As linhas testadas apresentaram variabilidade significativa para resistência ao ToMV. Apenas um acesso (Acc-17878) foi resistente ao ToMV, enquanto sete acessos (Acc-17890, AVR-261, CLN-312, AVR-321, EUR-333, CLN-352 e CLN-362) expressaram resistência ao TYLCV. A correlação entre a avaliação fenotípica foi confirmada pelos resultados do ELISA nas duas doenças, embora ambas as ferramentas tenham se complementado para avaliar o estado da infecção viral. No futuro, os programas de melhoramento de tomate devem considerar aperfeiçoamentos para resistência ao ToMV e TYLCV (usando germoplasma identificado em nosso estudo) de modo a fornecer variedades de tomate resistentes a vírus.

Variability in indigenous Pakistani tomato lines and worldwide reference collection for Tomato Mosaic Virus (ToMV) and Tomato Yellow Leaf Curl Virus (TYLCV) infection / Variabilidade em linhagens indígenas de tomate do Paquistão e coleção de referência global para infecção por vírus do mosaico do tomateiro (ToMV) e vírus da folha amarela do tomate (TYLCV)

Local and exotic germplasm of tomato remains a major source for genetic improvement. Assessment of such lines for biotic stresses particularly viral diseases are the most important criteria for selection in Pakistan, where Tomato Yellow Leaf Curl Virus (TYLCV) and Tomato Mosaic Virus (ToMV) are the major diseases/viruses. A set of 40 accessions (including indigenous Pakistani lines and exotic germplasm from Europe, the United States, and Asia) were evaluated for their resistance/infection response to ToMV with artificial inoculation under greenhouse conditions. Infection response was quantified through disease scoring and DAS-ELISA test (for ToMV). A subset of 24 lines, was further screened for TYLCV using disease scoring and TAS-ELISA. The tested lines showed significant variability for resistance to ToMV. Only one accession (Acc-17878) was resistant to the ToMV whereas seven accessions i.e. Acc-17890, AVR-261, CLN-312, AVR-321, EUR-333, CLN-352, and CLN-362 expressed resistance to TYLCV. Correlation between phenotypic evaluation was confirmed by the ELISA results in both diseases, although both tools complemented to assess the viral infection status. In future, tomato breeding programs must consider breeding for ToMV and TYLCV resistance (using identified germplasm in our study) so as to deliver virus resistant tomato varieties.

O germoplasma local e exótico do tomate continua sendo uma importante fonte de melhoramento genético. A avaliação de linhagens para estresses bióticos, particularmente as doenças virais, é o critério mais importantes para seleção no Paquistão, onde o vírus da folha amarela do tomate (TYLCV) e o vírus do mosaico do tomateiro (ToMV) são as principais doenças/vírus. Um conjunto de 40 acessos (incluindo linhagens indígenas do Paquistão e germoplasma exótico da Europa, dos Estados Unidos e da Ásia) foi avaliado quanto à resistência/resposta à infecção ao ToMV com inoculação artificial em casa de vegetação. A resposta à infecção foi quantificada por meio de pontuação da doença e de teste DAS-ELISA (para ToMV). Um subconjunto de 24 linhas foi posteriormente rastreado para TYLCV usando pontuação de doença e TAS-ELISA. As linhas testadas apresentaram variabilidade significativa para resistência ao ToMV. Apenas um acesso (Acc-17878) foi resistente ao ToMV, enquanto sete acessos (Acc-17890, AVR-261, CLN-312, AVR-321, EUR-333, CLN-352 e CLN-362) expressaram resistência ao TYLCV. A correlação entre a avaliação fenotípica foi confirmada pelos resultados do ELISA nas duas doenças, embora ambas as ferramentas tenham se complementado para avaliar o estado da infecção viral. No futuro, os programas de melhoramento de tomate devem considerar aperfeiçoamentos para resistência ao ToMV e TYLCV (usando germoplasma identificado em nosso estudo) de modo a fornecer variedades de tomate resistentes a vírus.

A standard area diagram set for assessing severity of eucalyptus bacterial blight caused by Erwinia psidii / Uma escala diagramática para a avaliação da severidade da seca-de-ponteiros do eucalipto causada por Erwinia psidii

This study aimed to develop and validate a standard area diagram (SAD) set to estimate the severity of bacterial blight of eucalyptus caused by Erwinia psidii. For this purpose, an eight-level SAD was developed and validated by ten inexperienced raters. Accuracy and precision of the estimates by each rater, with and without the SAD, were determined based on Lin's concordance correlation coefficient. The proposed SAD improved the accuracy and precision of the estimates. The SAD set studied here is a useful tool in assessments of bacterial blight of eucalyptus for epidemiological research and breeding programs.(AU)

Este trabalho objetivou o desenvolvimento de uma escala para estimar a severidade da seca-de-ponteiros do eucalipto causada por Erwinia psidii. Para isso, uma escala de oito níveis foi desenvolvida e validada por dez avaliadores inexperientes. A acurácia e precisão das estimativas de cada avaliador, com e sem a escala, foram determinadas baseadas no coeficiente de correlação concordante de Lin. A escala proposta melhorou a acurácia e a precisão das estimativas. A escala estudada se mostrou uma ferramenta útil na avaliação da seca-de-ponteiros do eucalipto para estudos epidemiológicos e em programas de melhoramento.(AU)

Associação entre carga de trabalho de enfermagem e comorbidades em pacientes críticos / Association between nursing workload and comorbidities in critically ill patients

Introdução: O emprego de indicadores que avaliem a condição clínica do paciente, bem como a necessidade de cuidados, tornou-se indispensável nas Unidades de Terapia Intensiva (UTIs). A interação do conjunto de comorbidades com o motivo de internação na UTI parece ser um preditor de maior carga de trabalho de Enfermagem. Objetivo: Investigar a associação entre a carga de trabalho de Enfermagem e as comorbidades dos pacientes nas primeiras 24 horas de internação em UTI clínica e cirúrgica. Método: Estudo transversal, realizado em uma UTI com 59 leitos, de março a maio/2018, incluindo 280 pacientes de ambos os sexos, com idade igual ou superior a 18 anos nas primeiras 24 horas de UTI. Para a carga de trabalho de Enfermagem, foi utilizado o Nursing Activities Score (NAS) e para as comorbidades, o Índice de Comorbidades de Charlson (ICC). Resultados: A média do NAS durante as primeiras 24 horas de admissão na UTI foi de 85.97 ± 9,1. Os escores NAS e ICC não apresentam correlação estatisticamente significativa (P= 0,9). Houve correlação significativa perfeita (P=000) entre o NAS e o tempo de internação dos pacientes na UTI. Conclusão: Para este estudo as comorbidades/risco de óbito dos pacientes não influenciaram no aumento da carga de trabalho de Enfermagem, estando esta associada ao tempo de internação. (AU)

Can the leaf age influence the susceptibility to bacterial-leaf-spot and bacterial-halo-blight on coffee seedlings? / A idade das folhas pode influenciar na suscetibilidade de cafeeiros à macha-foliar-bacteriana e à mancha-aureolada?

Pseudomonas syringae van Hall, 1902, causes yield losses in innumerous economic important crops. On coffee trees, P. syringae pv. garcae causes the bacterial-halo-blight (BHB) and P. syringae pv. tabaci the bacterial-leaf-spot (BLS). Recently, these diseases incidence has increase in occurrence areas and aggressiveness in Brazil. Although leaf age plays a role in the severity response of BHB, it is not known yet if this phenomenon also occurs in coffee-BLS interaction, and with highly virulent strains. So, we examined differences in the diseases severity by inoculation of P. syringae pv. garcae and P. syringae pv. tabaci strains on coffee leaves with different ages, to compare this aspect with coffee-BLS interaction. Our results showed that, for both pathovars, the severity was greater at the first internodes leaves, although for the most aggressive strains it was quite similar on any leaf age.(AU)

Bactérias da espécie Pseudomonas syringae van Hall, 1902, causam perdas na produção em inúmeras culturas de importância econômica. Em cafeeiros, P. syringae pv. garcae provoca a mancha-aureolada e P. syringae pv. tabaci ocasiona a mancha-foliar-bacteriana, doenças cuja ocorrência e agressividade têm aumentado nos últimos anos no Brasil. Embora a idade das folhas influencie na expressão da severidade de mancha-aureolada, não se sabe ainda se essa influência se mantém em plantas infectadas por estirpes altamente virulentas da bactéria. Desse modo, o presente estudo foi realizado com a finalidade de examinar diferenças na severidade de mancha-aureolada em folhas de cafeeiro com diferentes idades, bem como estudar comparativamente tais aspectos na interação entre cafeeiro e mancha-foliar-bacteriana, empregando-se isolados altamente virulentos. Os resultados evidenciaram que, assim como a mancha-aureolada, a severidade da mancha-bacteriana também é maior em folhas jovens do primeiro internódio, entretanto, as estirpes mais agressivas de P. syringae pv. garcae e P. syringae pv. tabaci provocaram danos de magnitude semelhantes em folhas de diferentes idades, do primeiro ao quinto internódio.(AU)

Muscle strength and executive function as complementary parameters for the assessment of impairment in Parkinson's disease / Forca muscular e funcao executiva como parametros complementares para a avaliacao do comprometimento da doenca de Parkinson

Objective To evaluate the relationship between the quantitative results of functional and cognitive performance of patients with Parkinson's disease (PD) and disease severity; and to study the relationship between patients' functional and cognitive capacity and motor impairment (Unified Parkinson's Disease Rating Scale - UPDRS III). Method Twenty-nine subjects clinically diagnosed with PD were classified into three groups according to disease severity using the modified Hoehn and Yahr Scale (H&Y). They were submitted to functional (Senior Fitness Test) and neuropsychological tests. Stepwise regression analysis showed a significant association between H&Y and upper limb strength (r 2 =0.30; p=0.005) and executive function (r 2 =0.37; p=0.004). In relation to UPDRS III, there was a significant association between lower limb strength (r 2 =0.27; p=0.010) and global cognitive status (r 2 =0.24; p=0.024). Conclusion The implementation of simple tests of functional capacity associated with neuropsychological testing can help to assess disease severity and motor impairment, and can be used to monitor the response to treatment in PD. .

Objetivo Avaliar a relação entre resultados quantitativos do desempenho funcional e cognitivo de pacientes com doença de Parkinson (DP) e a gravidade da doença; estudar a relação entre a capacidade funcional e cognitiva dos pacientes e o comprometimento motor (Unified Parkinson's Disease Rating Scale - UPDRS III). Método Vinte e nove sujeitos diagnosticados clinicamente com DP foram classificados em três grupos de acordo com a gravidade da doença através da Escala de Hoehn & Yahr (H&Y) modificada, e submetidos a testes funcionais (Senior Fitness Test) e neuropsicológicos. As análises de regressão Stepwise mostraram associação significativa entre a gravidade da doença e a força de membros superiores (r 2 =0,30; p=0,005) e a função executiva (r 2 =0,37; p=0,004). Em relação ao comprometimento motor, houve associação significativa com a força de membros inferiores (r 2 =0,27; p=0,010) e com o estado cognitivo global (r 2 =0,24; p=0,024). Conclusão Testes simples de capacidade funcional associados a testes neuropsicológicos podem contribuir para a avaliação da gravidade e do comprometimento motor e podem ser utilizados para o acompanhamento da resposta ao tratamento da DP. .

Efeito de óleos essenciais de plantas medicinais sobre a antracnose do sorgo / Effect of essential oils of medicinal plants on the anthracnose of sorghum

Objetivou-se avaliar a fungitoxicidade in vitro dos óleos essenciais de capim-limão, citronela, erva-cidreira e hortelã-pimenta sobre o fungo Colletotrichum graminicola (Ensaio I) e o efeito in vivo desses óleos e do óleo comercial de nim sobre a antracnose do sorgo (Ensaio II). No Ensaio I avaliou-se, em cinco épocas (dois, quatro, seis, oito e dez dias de incubação), o crescimento micelial do C. graminicola sob cinco concentrações dos óleos essenciais (C1= 0,25 µL mL-1; C2= 0,50 µL mL-1; C3= 0,75 µL mL-1; C4= 1,0 µL mL-1; C5= 1,25 µL mL-1). No Ensaio II, para avaliar o efeito preventivo, utilizou-se cinco tipos de óleos (capim-limão, citronela, erva-cidreira, hortelã-pimenta e nim) em quatro concentrações (2,5, 5,0, 7,5 e 10,0 µL mL-1). Para o efeito curativo, foram utilizados os mesmos óleos do efeito preventivo em duas concentrações (2,5 e 5,0 µL mL-1). Os óleos essenciais de C. nardus e C. citratus foram os mais eficientes na redução do crescimento micelial de C. graminicola (Ensaio I). No Ensaio II, no efeito preventivo, tanto os óleos essenciais quanto as concentrações reduziram significativamente a severidade da doença, destacando-se os óleos de capim-limão, erva-cidreira e nim. No efeito curativo, os tratamentos reduziram a severidade, porém não apresentaram diferença significativa entre si.

The objective was to evaluate the in vitro fungitoxicity of essential oils of lemongrass, citronella, lemongrass and peppermint on the fungus Colletotrichum graminicola (Test I) and in vivo effects of these oils and neem oil trade on the anthracnose sorghum (Test II). In Test I was evaluated in five seasons (two, four, six, eight and ten days of incubation), the mycelial growth of C. graminicola under five concentrations of essential oils (C1= 0,25 µL mL-1; C2= 0,50 µL mL-1; C3= 0,75 µL mL-1; C4= 1,0 µL mL-1; C5= 1,25 µL mL-1). In Test II, to assess the preventive effect, we used five types of oils (lemongrass, citronella, lemon balm, peppermint and neem) at four concentrations (2,5, 5,0, 7,5 e 10,0 µL mL-1). For curative effect, we used the same oils of preventive effect in two concentrations (2,5 e 5,0 µL mL-1). The essential oils of C. nardus and C. citratus were the most effective in reducing mycelial growth of C. graminicola (Test I). In Test II, the preventive effect, essential oils and concentrations significantly reduced the severity of the disease, especially oils of lemongrass, lemon balm and neem. In the curative effect, treatments reduced the severity, but no significant differences between them.