Characterization of clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis from indigenous peoples of Colombia / Caracterización de aislamientos clínicos de Mycobacterium tuberculosis de pueblos indígenas de Colombia

ABSTRACT Introduction: Tuberculosis continues to be a public health priority. Indigenous peoples are vulnerable groups with cultural determinants that increase the risk of the disease. Objective: To determine molecular epidemiology and phenotypical features and of Mycobacterium tuberculosis isolates from indigenous people in Colombia during the period from 2009 to 2014. Materials and methods: We conducted an analytical observational study; we analyzed 234 isolates to determine their patterns of sensitivity to antituberculosis drugs and their molecular structures by spoligotyping. Results: The isolates came from 41 indigenous groups, predominantly the Wayúu (13.10%) and Emberá Chamí (11.35%). We found 102 spoligotypes distributed among seven genetic families (37.2% LAM, 15.8% Haarlem, 8.1% T, 3.4% U, 2.6% S, 2.1% X, and 0.9%, Beijing). The association analysis showed that the non-clustered isolates were related to prior treatment, relapse, orphan spoligotypes, and the Beijing family. The H family presented an association with the Arhuaco and Camëntŝá indigenous groups, the U family was associated with the Wounaan group, and the T family was associated with the Motilón Barí group. Conclusions: This is the first national study on M. tuberculosis characterization in indigenous groups. The study evidenced that diagnosis in indigenous people is late. We described 53% of orphan patterns that could be typical of the Colombian indigenous population. The high percentage of grouping by spoligotyping (62%) could indicate cases of active transmission, a situation that should be corroborated using a second genotyping marker. A new Beijing spoligotype (Beijing-like SIT 406) was identified in Colombia.

RESUMEN Introducción. La tuberculosis es prioridad de salud pública. Los pueblos indígenas son vulnerables debido a los factores culturales determinantes que aumentan el riesgo de tuberculosis. Objetivo. Determinar la epidemiologia molecular y las características fenotípicas de los aislamientos de Mycobacterium tuberculosis de pueblos indígenas de Colombia entre 2009 y 2014. Materiales y métodos. Se hizo un estudio observacional analítico; se analizaron 234 aislamientos para determinar la sensibilidad a los fármacos antituberculosos y la estructura molecular usando spoligotyping. La información epidemiológica se recolectó utilizando el formato único de vigilancia de micobacterias. Resultados. Los aislamientos provenían de 41 grupos indígenas, principalmente los wayúu (13,10 %) y emberá chamí (11,35 %). Se encontraron 102 genotipos distribuidos en siete familias genéticas (37,2 %, LAM; 15,8 %, Haarlem; 8,1 %, T; 3,4 %, U; 2,6 %, S; 2,1 %, X, y 0,9%, Beijing). El análisis de asociación mostró que los aislamientos no agrupados se asociaron con el tratamiento previo, las recaídas, los genotipos huérfanos y la familia Beijing. La familia H presentó una asociación con los grupos indígenas arhuaco y camëntŝá, la familia U se asoció con el grupo wounaan y la familia T con el grupo motilón barí. Conclusiones. Este es el primer estudio nacional de caracterización de M. tuberculosis en grupos indígenas. Se evidenció que el diagnóstico en indígenas es tardío, y que 53 % de los patrones huérfanos podrían ser típicos de la población indígena colombiana. El alto porcentaje de agrupamiento por spoligotyping (62%) podría indicar casos de transmisión activa, una situación que debe ser corroborada usando un segundo marcador de genotipificación. Se identificó un nuevo genotipo (Beijing-like SIT 406) en Colombia.

Aspectos gerais da tuberculose: uma atualização sobre o agente etiológico e o tratamento / General aspects of tuberculosis: an update on the etiologic agent and treatment

A tuberculose (TB) é uma doença infecto-contagiosa, transmitida de pessoa a pessoa através de gotículas de aerossóis, tem como agente etiológico o microrganismo Mycobacterium tuberculosis, também chamado de bacilo de Koch (BAAR). O trabalho faz um relato parcial da tuberculose, apresentando algumas informações, como: epidemiologia, fisiopatologia, diagnóstico, prevenção e tratamento. Podemos observar que, apesar de ter tido uma queda de incidência nos últimos anos, ainda é considerada um problema de saúde pública mundial. No Brasil, entre os anos de 2001 e 2014 foram confirmados 70 mil óbitos. Observa-se também que dentre os estados brasileiros, o Amazonas é o que possui maior número de casos, cerca de 68,4/100 mil habitantes. A Organização Mundial da Saúde (OMS) classifica essa doença como infecciosa de agente único que mais mata, chegando a superar o HIV. Embora seja uma doença curável e evitável, a maioria dos óbitos ocorre nas regiões metropolitanas e em unidades hospitalares. A tuberculose ainda é considerada uma doença grave de saúde pública mundial, que atinge todas as faixas etárias; devido às suas complicações, principalmente quando associada a condições sociais e econômicas precárias, a doença ainda causa muitas mortes. A identificação precoce e o tratamento adequado dos casos existentes é a medida mais eficaz para interromper a cadeia de transmissão da TB, daí a importância da busca ativa de novos casos através da avaliação dos contactantes.

Determinants of tuberculosis in Brazil: from conceptual framework to practical application / Determinantes de la tuberculosis en el Brasil: del marco conceptual a la aplicación práctica

OBJECTIVE: To leverage a conceptual analytical model for TB determination to identify factors that influence emergence of new cases of tuberculosis (TB) and poor TB treatment outcomes in Brazil. METHODS: This was a cross-sectional study based on data from Brazil's Notifiable Disease Surveillance System database (SINAN). It included all confirmed, incident TB cases reported in Brazil in 2007 - 2011: a total of 432 958 TB cases, of which 318 465 cases with complete data on treatment outcomes were included. Analysis to explain the causal network that influences TB treatment outcomes was based on a theoretical model for determining TB. Adjusted analyses were used to assess the model fit. Hierarchical logistic regression was used to model the dichotomous TB outcome; hierarchical polytomous regression was used for multinomial TB outcome. RESULTS: Of the 318 465 TB cases included, 222 186 (69.8%) were classified as "cured" and 96 279 (30.2%) as "treatment failure." Among the latter, 37 604 (11.8%) abandoned treatment; 13 193 (4.1%) died due to TB; 15 440 (4.8%) died due to causes other than TB; 28 848 (9.1%) were transferred to another municipality; and 1 194 (0.4%) developed multidrug-resistant TB. The dichotomous models were more likely to show spurious associations when compared with the polytomous model. In the polytomous model, individuals assigned to Directly Observed Treatment Short-course were more likely to be cured than others. CONCLUSIONS: Theoretical models are dynamic structures that need ongoing re-evaluation according to new findings; therefore, this is not a definitive proposal for a TB determination model or analysis plan, but rather a proposal that, at present, is adequate in Brazil and has the potential to be extrapolated or adapted to other areas.

OBJETIVO: Hacer uso de un modelo analítico conceptual para la determinación de la tuberculosis con objeto de establecer los factores que influyen en la aparición de nuevos casos de tuberculosis (TB) y en los resultados deficientes del tratamiento antituberculoso en Brasil. MÉTODOS: Se llevó a cabo un estudio transversal con base en los datos de la base de datos del Sistema de Vigilancia de Enfermedades de Notificación Obligatoria del Brasil (SINAN). Incluyó a todos los nuevos casos de tuberculosis confirmados y notificados en Brasil del 2007 al 2011: un total de 432 958 casos de tuberculosis, 318 465 de los cuales contaban con datos completos sobre los resultados del tratamiento. El análisis para explicar la red causal que influye en los resultados del tratamiento antituberculoso se basó en un modelo teórico para la determinación de la tuberculosis. Se usaron análisis ajustados para evaluar el ajuste del modelo. Mediante regresión logística jerárquica se modeló el resultado dicotómico de la tuberculosis; y se utilizó la regresión jerárquica politómica para el resultado polinómico de la tuberculosis. RESULTADOS: De los 318 465 casos de tuberculosis incluidos, 222 186 (69,8%) se clasificaron como "curados" y 96 279 (30,2%) como "fracasos terapéuticos". De estos últimos, 37 604 (11,8%) abandonaron el tratamiento; 13 193 (4,1%) murieron como consecuencia de la tuberculosis; 15 440 (4,8%) murieron por causas diferentes a la tuberculosis; 28 848 (9,1%) fueron trasladados a otro municipio; y 1 194 (0,4%) contrajeron tuberculosis multirresistente. Los modelos dicotómicos mostraron asociaciones espurias con mayor probabilidad que el modelo politómico. En el modelo politómico, los pacientes asignados a un tratamiento breve bajo observación directa mostraron mayores probabilidades de curación que otros. CONCLUSIONES: Los modelos teóricos son estructuras dinámicas que requieren una permanente reevaluación según los nuevos resultados; por consiguiente, esta no es una propuesta definitiva de un modelo de determinación de la tuberculosis o un plan de análisis, sino que más bien es una propuesta que, actualmente, resulta adecuada en Brasil y puede ser extrapolada o adaptada a otras zonas.

Desigualdades sociais e tuberculose: analise segundo raca/cor, Mato Grosso do Sul / Desigualdades sociales y tuberculosis: analisis de acuerdo a raza/color, Mato Grosso do Sul, Brasil / Social inequalities and tuberculosis: an analysis by race/color in Mato Grosso do Sul, Brazil

OBJETIVO Analisar características sociodemográficas e clínico-epidemiológicas dos casos de tuberculose e fatores associados ao abandono e ao óbito na vigência do tratamento. MÉTODOS Estudo epidemiológico baseado em dados notificados de tuberculose em indígenas e não indígenas, segundo raça/cor, em Mato Grosso do Sul, entre 2001 e 2009. Realizou-se análise descritiva dos casos de acordo com as variáveis sexo, faixa etária, zona de residência, exames empregados para o diagnóstico, forma clínica, tratamento supervisionado e situação de encerramento, segundo raça/cor. Utilizou-se análise univariada e múltipla por meio de regressão logística para identificar preditores de abandono e óbito, e odds ratio como medida de associação. Foi construída série histórica de incidência, segundo raça/cor. RESULTADOS Registraram-se 6.962 casos novos de tuberculose no período, 15,6% entre indígenas. Houve predomínio em homens e adultos (20 a 44 anos) em todos os grupos. A maior parte dos doentes indígenas residia na zona rural (79,8%) e 13,5% dos registros nos indígenas ocorreram em < 10 anos. A incidência média no estado foi 34,5/100.000 habitantes, 209,0; 73,1; 52,7; 23,0 e 22,4 entre indígenas, amarelos, pretos, brancos e pardos, respectivamente. Doentes de 20 a 44 anos (OR = 13,3; IC95% 1,9;96,8), do sexo masculino (OR = 1,6; IC95% 1,1;2,3) e de raça/cor preta (OR = 2,5; IC95% 1,0;6,3) mostraram associação com abandono de tratamento, enquanto doentes > 45 anos (OR = 3,0; IC95% 1,2;7,8) e com a forma mista (OR = 2,3; IC95% 1,1;5,0) apresentaram associação com óbito. Apesar de representarem 3,0% da população, os indígenas foram responsáveis por 15,6% das notificações no período. ...

OBJETIVO Analizar características sociodemográficas y clínico-epidemiológicas de los casos de tuberculosis y factores asociados con el abandono y el óbito en la vigencia del tratamiento. MÉTODOS Estudio epidemiológico basado en datos notificados de tuberculosis en indígenas y no indígenas, de acuerdo a la raza y el color, en Mato Grosso do Sul, entre 2001 y 2009. Se realizó análisis descriptivo de los casos de acuerdo con las variables sexo, grupo etario, zona de residencia, exámenes empleados para el diagnóstico, forma clínica, tratamiento supervisado y situación de conclusión, de acuerdo a raza/color. Se utilizó análisis univariado y múltiple por medio de regresión logística para identificar predictores de abandono y óbito, y odds ratio como medida de asociación. Se construyó serie histórica de incidencia, de acuerdo a raza/color. RESULTADOS Se registraron 6.962 casos nuevos de tuberculosis en el período, 15,6% entre indígenas. Hubo predominio en hombres y adultos (20 a 44 años) en todos los grupos. La mayor parte de los indígenas enfermos residía en la zona rural (79,8%) y 13,5% de los registros en los indígenas ocurrieron en < 10 años. La incidencia promedio en el estado fue 34,5/100.000 habitantes, 209,0; 73,1; 52,7; 23,0 y 22,4 entre indígenas amarillos, negros, blancos y pardos, respectivamente. Enfermos de 20 a 44 años (OR=13,3; IC95% 1,9;96,8), del sexo masculino (OR = 1,6; IC95% 1,1;2,3) y de raza/color negra (OR= 2,5; IC95% 1,0;6,3) mostraron asociación con abandono del tratamiento, mientras que los enfermos > 45 años (OR= 3,0; IC95% 1,2;7,8) y con la forma mixta (OR= 2,3; IC95% 1,1;5,0) presentaron asociación con óbito. A pesar de representar 3,0% de la población, los indígenas fueron responsables por 15,6% de las ...

OBJECTIVE To describe the sociodemographic and clinical-epidemiological characteristics of tuberculosis cases and identify associated factors with abandoning treatment and death whilst undergoing treatment. METHODS Epidemiological study based on cases of tuberculosis recorded in indigenous and non-indigenous individuals according to race/color in Mato Grosso do Sul, Midwestern Brazil, between 2001 and 2009. Descriptive analysis of the cases was carried out according to the variables of sex, age group, residence, type of test used in the diagnosis, clinical form, supervised treatment and final status, according to race/color. Univariate/multivariate logistic regression analyses were used to identify predictors of abandoning treatment and death, using odds ratio as a measure of association. A time series of incidence according to race/color was constructed. RESULTS In the period, 6,962 new cases of tuberculosis were registered, 15.6% being among indigenous. The illness was predominantly found in men and adults (20-44 years old) in all groups. Most of the indigenous patients lived in rural areas (79.8%) and 13.5% of the records in indigenous occurred in children aged < 10 years. The average incidence in the state was 34.5/100,000 inhabitants, being 209.0, 73.1, 52.7, 23.0 and 22.4 in indigenous, and those with yellow, black, white and brown skin, respectively. Patients aged 20 to 44 years (OR = 13.3, 95%CI 1.9;96.8), male (OR = 1.6, 95%CI 1.1;2.3) and of black race/color (OR = 2.5, 95%CI 1.0;6.3) were associated with abandoning treatment, while patients aged > 45 years (OR = 3.0, 95%CI 1.2;7.8) and with the mixed form (OR = 2.3, 95%CI 1.1;5.0) showed association with death. Although they only account for 3.0% of the population, the indigenous were responsible for 15.6% of cases recorded during the period. CONCLUSIONS Major inequalities in the tuberculosis illness process were found between the categories studied. Incidence in ...

Tuberculosis in indigenous children in the Brazilian Amazon / Tuberculose em crianças indígenas da Amazônia brasileira / Tuberculosis en niños indígenas en el Amazonas Brasileño

OBJECTIVE: Assess the epidemiological aspects of tuberculosis in Brazilian indigenous children and actions to control it. METHODS: An epidemiological study was performed with 356 children from 0 to 14 years of age in Rondônia State, Amazon, Brazil, during the period 1997-2006. Cases of TB reported to the Notifiable Diseases Surveillance System were divided into indigenous and non-indigenous categories and analyzed according to sex, age group, place of residence, clinical form, diagnostic tests and treatment outcome. A descriptive analysis of cases and hypothesis test (χ²) was carried out to verify if there were differences in the proportions of illness between the groups investigated. RESULTS: A total of 356 TB cases were identified (125 indigenous, 231 non-indigenous) of which 51.4% of the cases were in males. In the indigenous group, 60.8% of the cases presented in children aged 0-4 years old. The incidence mean was much higher among indigenous; in 2001, 1,047.9 cases/100,000 inhabitants were reported in children aged < 5 years. Pulmonary TB was reported in more than 80% of the cases, and in both groups over 70% of the cases were cured. Cultures and histopathological exams were performed on only 10% of the patients. There were 3 cases of TB/HIV co-infection in the non-indigenous group and none in the indigenous group. The case detection rate was classified as insufficient or fair in more than 80% of the indigenous population notifications, revealing that most of the diagnoses were performed based on chest x-ray. CONCLUSIONS: The approach used in this study proved useful in demonstrating inequalities in health between indigenous and non-indigenous populations and was superior to the conventional analyses performed by the surveillance services, drawing attention to the need to improve childhood TB diagnosis among the indigenous population.

OBJETIVO: Avaliar os aspectos epidemiológicos da tuberculose em crianças indígenas brasileiras e as ações para seu controle. MÉTODOS: Estudo epidemiológico com 356 crianças de 0 a 14 anos de idade, em Rondônia, Amazônia, Brasil, de 1997 a 2006. Os casos, registrados no Sistema de Informação de Agravos de Notificação, foram classificados em indígenas e não indígenas, e analisados segundo sexo, faixa etária, local de residência, forma clínica, exames diagnósticos e resultado do tratamento. Foi realizada análise descritiva dos casos e teste de hipótese (χ²) para verificar se houve diferenças nas proporções de adoecimento entre os grupos investigados. RESULTADOS: Foram identificados 356 casos de tuberculose (125 indígenas e 231 não indígenas), dos quais 51,4% em meninos. Nos indígenas, 60,8% dos casos foram notificados em < 5 anos. A incidência média foi maior entre os indígenas: 1.047,9 casos/100.000 habitantes < 5 anos, no ano de 2001. A forma pulmonar foi registrada em mais de 80,0% dos casos e a cura ultrapassou 70,0% em ambos os grupos. Cultura e exame histopatológico foram utilizados em apenas 10,0% dos pacientes. Houve três casos de coinfecção com HIV em não indígenas e nenhum em indígenas. A detecção dos casos foi classificada como insuficiente e/ou regular em mais de 80,0% das notificações em indígenas, mostrando que a maioria dos diagnósticos foi baseada na radiografia de tórax. CONCLUSÕES: A abordagem empregada mostrou-se útil para ilustrar desigualdades em saúde entre indígenas e não indígenas, demonstrando-se superior às análises convencionais realizadas nos serviços de vigilância. Fica evidente a necessidade de um aprimoramento da investigação diagnóstica entre as crianças indígenas.

OBJETIVO: Evaluar los aspectos epidemiológicos de la tuberculosis en niños indígenas brasileños y las acciones para su control. MÉTODOS: Estudio epidemiológico con [356] niños de 0 a 14 años de edad, en Rondonia, Amazonas, Brasil, de 1997 a 2006. Los casos registrados en el Sistema de Información de Agravios de Notificación, se clasificaron en indígenas y no indígenas, y se analizaron según sexo, grupo etario, lugar de residencia, forma clínica, exámenes diagnósticos y resultado del tratamiento. Se realizó análisis descriptivo de los casos y prueba de hipótesis (χ²) para verificar si hubo diferencias en las proporciones de la enfermedad entre los grupos investigados. RESULTADOS: Se identificaron 356 casos de tuberculosis (125 indígenas y 231 no indígenas), de los cuales, 51,4% en niños varones. En los indígenas, 60,8% de los casos fueron notificados en < 5 años. La incidencia promedio fue mayor entre los indígenas: 1.047,9 casos/100.000 habitantes < 5 años, en el año de 2001. La forma pulmonar fue registrada en más de 80,0% de los casos y la cura ultrapasó 70,0% en ambos grupos. Cultivo y examen histopatológico fueron utilizados en sólo 10,0% de los pacientes. Hubo tres casos de coinfección con VIH en no indígenas e ninguno en indígenas. La detección de los casos fue clasificada como insuficiente y/o regular en más de 80,0% de las notificaciones en indígenas, mostrando que la mayoría de los diagnósticos estuvo basada en la radiografía de tórax. CONCLUSIONES: El abordaje empleado se evidenció útil para ilustrar desigualdades en salud entre indígenas y no indígenas, demostrándose superior a los análisis convencionales realizados en los servicios de vigilancia. Se hace incuestionable la necesidad de perfeccionar la investigación diagnóstica entre los niños indígenas.

La tuberculosis en la zona norte del pais. Predicciones epidemiologicas y estrategias operativas. / Tuberculosis in the Northern xone of the country.Epidemiological predictions and operative strategies

La tuberculosis presenta en las entidades fronterizas del norte de Mexico un problema superior al promedio observado para las otras entidades. Aunque es evidente un descenso en la mortalidad por tuberlosis, particularmente en las formas meningeas en menores de 15 anos, no se puede asegurar que tal efecto obedeza a la vacunacion con BCG ya que se conoce la insuficiente cobertura de inmunizados en el medio rural y en menores de cuatro anos. Se propone integrar en el area un programa de control de la tuberculosis con la participacion de todas las instituciones de salud, con la fijacion de metas epidemiologicas hasta en las localidades mas pequenas y con los cambios y decisiones administrativas antituberculosas en calidad y cantidad verdaderamente utiles. La experiencia que se obtenga en el area con el cambio de estrategia pude extenderse en corto plazo a otras areas del pais, con preferencia a las zonas de alta prevalencia y mortalidad por tuberculosis