Global epidemiology of Equine Influenza viruses: "A possible emerging zoonotic threat in future" an extensive systematic review with evidence / Epidemiologia global dos vírus da Gripe Equina: "Uma possível ameaça zoonótica emergente no futuro" uma extensa revisão sistemática com evidências

There are different opinions around the World regarding the zoonotic capability of H3N8 equine influenza viruses. In this report, we have tried to summarize the findings of different research and review articles from Chinese, English, and Mongolian Scientific Literature reporting the evidence for equine influenza virus infections in human beings. Different search engines i.e. CNKI, PubMed, ProQuest, Chongqing Database, Mongol Med, and Web of Knowledge yielded 926 articles, of which 32 articles met the inclusion criteria for this review. Analyzing the epidemiological and Phylogenetic data from these articles, we found a considerable experimental and observational evidence of H3N8 equine influenza viruses infecting human being in different parts of the World in the past. Recently published articles from Pakistan and China have highlighted the emerging threat and capability of equine influenza viruses for an epidemic in human beings in future. In this review article we have summarized the salient scientific reports published on the epidemiology of equine influenza viruses and their zoonotic aspect. Additionally, several recent developments in the start of 21st century, including the transmission and establishment of equine influenza viruses in different animal species i.e. camels and dogs, and presumed encephalopathy associated to influenza viruses in horses, have documented the unpredictable nature of equine influenza viruses. In sum up, several reports has highlighted the unpredictable nature of H3N8 EIVs highlighting the need of continuous surveillance for H3N8 in equines and humans in contact with them for novel and threatening mutations.

Existem diferentes opiniões em todo o mundo a respeito da capacidade zoonótica dos vírus da influenza equina H3N8. Neste relatório, tentamos resumir os resultados de diferentes pesquisas e artigos de revisão da literatura científica chinesa, inglesa e mongol relatando as evidências de infecções pelo vírus da influenza equina em seres humanos. Diferentes mecanismos de busca, como CNKI, PubMed, ProQuest, Chongqing Database, Mongol Med e Web of Knowledge geraram 926 artigos, dos quais 32 atenderam aos critérios de inclusão para esta revisão. Analisando os dados epidemiológicos e filogenéticos desses artigos, encontramos uma considerável evidência experimental e observacional de vírus da influenza equina H3N8 infectando seres humanos em diferentes partes do mundo no passado. Artigos publicados recentemente no Paquistão e na China destacaram a ameaça emergente e a capacidade dos vírus da influenza equina para uma epidemia em seres humanos no futuro. Neste artigo de revisão, resumimos os relatórios científicos relevantes publicados sobre a epidemiologia dos vírus da influenza equina e seu aspecto zoonótico. Além disso, vários desenvolvimentos recentes no início do século 21, incluindo a transmissão e estabelecimento de vírus da influenza equina em diferentes espécies animais, ou seja, camelos e cães, e presumida encefalopatia associada aos vírus da influenza em cavalos, documentaram a natureza imprevisível dos vírus da influenza equina. Em suma, vários relatórios destacaram a natureza imprevisível de H3N8 EIVs destacando a necessidade de vigilância contínua para H3N8 em equinos e humanos em contato com eles para novas mutações ameaçadoras.

Global epidemiology of Equine Influenza viruses; A possible emerging zoonotic threat in future an extensive systematic review with evidence

Abstract There are different opinions around the World regarding the zoonotic capability of H3N8 equine influenza viruses. In this report, we have tried to summarize the findings of different research and review articles from Chinese, English, and Mongolian Scientific Literature reporting the evidence for equine influenza virus infections in human beings. Different search engines i.e. CNKI, PubMed, ProQuest, Chongqing Database, Mongol Med, and Web of Knowledge yielded 926 articles, of which 32 articles met the inclusion criteria for this review. Analyzing the epidemiological and Phylogenetic data from these articles, we found a considerable experimental and observational evidence of H3N8 equine influenza viruses infecting human being in different parts of the World in the past. Recently published articles from Pakistan and China have highlighted the emerging threat and capability of equine influenza viruses for an epidemic in human beings in future. In this review article we have summarized the salient scientific reports published on the epidemiology of equine influenza viruses and their zoonotic aspect. Additionally, several recent developments in the start of 21st century, including the transmission and establishment of equine influenza viruses in different animal species i.e. camels and dogs, and presumed encephalopathy associated to influenza viruses in horses, have documented the unpredictable nature of equine influenza viruses. In sum up, several reports has highlighted the unpredictable nature of H3N8 EIVs highlighting the need of continuous surveillance for H3N8 in equines and humans in contact with them for novel and threatening mutations.

Resumo Existem diferentes opiniões em todo o mundo a respeito da capacidade zoonótica dos vírus da influenza equina H3N8. Neste relatório, tentamos resumir os resultados de diferentes pesquisas e artigos de revisão da literatura científica chinesa, inglesa e mongol relatando as evidências de infecções pelo vírus da influenza equina em seres humanos. Diferentes mecanismos de busca, como CNKI, PubMed, ProQuest, Chongqing Database, Mongol Med e Web of Knowledge geraram 926 artigos, dos quais 32 atenderam aos critérios de inclusão para esta revisão. Analisando os dados epidemiológicos e filogenéticos desses artigos, encontramos uma considerável evidência experimental e observacional de vírus da influenza equina H3N8 infectando seres humanos em diferentes partes do mundo no passado. Artigos publicados recentemente no Paquistão e na China destacaram a ameaça emergente e a capacidade dos vírus da influenza equina para uma epidemia em seres humanos no futuro. Neste artigo de revisão, resumimos os relatórios científicos relevantes publicados sobre a epidemiologia dos vírus da influenza equina e seu aspecto zoonótico. Além disso, vários desenvolvimentos recentes no início do século 21, incluindo a transmissão e estabelecimento de vírus da influenza equina em diferentes espécies animais, ou seja, camelos e cães, e presumida encefalopatia associada aos vírus da influenza em cavalos, documentaram a natureza imprevisível dos vírus da influenza equina. Em suma, vários relatórios destacaram a natureza imprevisível de H3N8 EIVs destacando a necessidade de vigilância contínua para H3N8 em equinos e humanos em contato com eles para novas mutações ameaçadoras.

Occurrence of Hymenolepis diminuta: a potential helminth of zoonotic importance in murid rodents / Ocorrência de Hymenolepis diminuta: um helminto potencial de importância zoonótica em roedores murídeos

The study reveals the prevalence of a potential rodent-borne zoonotic helminth species, Hymenolepis diminuta in commensal rodents caught from irrigated and rain-fed areas of Swat, Pakistan. Three hundred and fifty rodents (269 rats and 81 mice) trapped during vegetative, flowering/fruiting and mature/harvesting stages of crops were studied from 2011-2013. Hymenolepisdiminuta eggs were identified on the basis of their shape, size, colour and markings on the surface of the egg shell and three pairs of embryonic hook-lets. Overall prevalence of H. diminuta was 3.14% (n=11/350). The highest prevalence 3.49% (n=5/143) of H. diminuta was noted at harvesting stages of the crops whereas the lowest 2.59% (n=2/77) during vegetative stage. Infection was higher in males 3.25% (n=7/215) than females 2.96% (n=4/135). Adult rodents were highly infected while no sub-adult was found infected. Infection was higher in mice 3.70% (3/81) than rats 2.69% (8/269) while no significance (p=1.0000:0.1250 to 32.00 CI). Rats and mice appears to show the most suitable reservoirs by hosting H. diminuta a zoonotic helminth. The presence of these rodents in all possible habitats can act as a main channel of transferring parasites through various habitats and can pose a hazard to humans in the area.

O estudo revela a prevalência de uma espécie potencial de helmintos zoonóticos transmitidos por roedores, Hymenolepis diminuta, em roedores comensais capturados em áreas irrigadas e alimentadas pela chuva de Swat, Paquistão. Trezentos e cinquenta roedores (269 ratos e 81 camundongos) presos durante os estágios vegetativo, floração/frutificação e maturidade/colheita das safras foram estudados de 2011-2013. Ovos de Hymenolepis diminuta foram identificados com base em sua forma, tamanho, cor e marcações na superfície da casca do ovo e três pares de anzóis embrionários. A prevalência geral de H. diminuta foi de 3,14% (n = 11/350). A maior prevalência 3,49% (n = 5/143) de H. diminuta foi observada na fase de colheita das lavouras, enquanto a menor 2,59% (n = 2/77) durante a fase vegetativa. A infecção foi maior nos homens 3,25% (n = 7/215) do que nas mulheres 2,96% (n = 4/135). Roedores adultos foram altamente infectados, enquanto nenhum subadulto foi encontrado infectado. A infecção foi maior em camundongos 3,70% (3/81) do que em ratos 2,69% (8/269), embora sem significância (p = 1,0000: 0,1250 a 32,00 CI). Ratos e camundongos parecem mostrar os reservatórios mais adequados hospedando H. diminuta um helmintos zoonótico. A presença desses roedores em todos os habitats possíveis pode atuar como um canal principal de transferência de parasitas através de vários habitats e pode representar um perigo para os humanos na área.

Occurrence of Hymenolepis diminuta: a potential helminth of zoonotic importance in murid rodents / Ocorrência de Hymenolepis diminuta: um helminto potencial de importância zoonótica em roedores murídeos

The study reveals the prevalence of a potential rodent-borne zoonotic helminth species, Hymenolepis diminuta in commensal rodents caught from irrigated and rain-fed areas of Swat, Pakistan. Three hundred and fifty rodents (269 rats and 81 mice) trapped during vegetative, flowering/fruiting and mature/harvesting stages of crops were studied from 2011-2013. Hymenolepisdiminuta eggs were identified on the basis of their shape, size, colour and markings on the surface of the egg shell and three pairs of embryonic hook-lets. Overall prevalence of H. diminuta was 3.14% (n=11/350). The highest prevalence 3.49% (n=5/143) of H. diminuta was noted at harvesting stages of the crops whereas the lowest 2.59% (n=2/77) during vegetative stage. Infection was higher in males 3.25% (n=7/215) than females 2.96% (n=4/135). Adult rodents were highly infected while no sub-adult was found infected. Infection was higher in mice 3.70% (3/81) than rats 2.69% (8/269) while no significance (p=1.0000:0.1250 to 32.00 CI). Rats and mice appears to show the most suitable reservoirs by hosting H. diminuta a zoonotic helminth. The presence of these rodents in all possible habitats can act as a main channel of transferring parasites through various habitats and can pose a hazard to humans in the area.

O estudo revela a prevalência de uma espécie potencial de helmintos zoonóticos transmitidos por roedores, Hymenolepis diminuta, em roedores comensais capturados em áreas irrigadas e alimentadas pela chuva de Swat, Paquistão. Trezentos e cinquenta roedores (269 ratos e 81 camundongos) presos durante os estágios vegetativo, floração/frutificação e maturidade/colheita das safras foram estudados de 2011-2013. Ovos de Hymenolepisdiminuta foram identificados com base em sua forma, tamanho, cor e marcações na superfície da casca do ovo e três pares de anzóis embrionários. A prevalência geral de H. diminuta foi de 3,14% (n = 11/350). A maior prevalência 3,49% (n = 5/143) de H. diminuta foi observada na fase de colheita das lavouras, enquanto a menor 2,59% (n = 2/77) durante a fase vegetativa. A infecção foi maior nos homens 3,25% (n = 7/215) do que nas mulheres 2,96% (n = 4/135). Roedores adultos foram altamente infectados, enquanto nenhum subadulto foi encontrado infectado. A infecção foi maior em camundongos 3,70% (3/81) do que em ratos 2,69% (8/269), embora sem significância (p = 1,0000: 0,1250 a 32,00 CI). Ratos e camundongos parecem mostrar os reservatórios mais adequados hospedando H. diminuta um helmintos zoonótico. A presença desses roedores em todos os habitats possíveis pode atuar como um canal principal de transferência de parasitas através de vários habitats e pode representar um perigo para os humanos na área.

Occurrence of Hymenolepis diminuta: a potential helminth of zoonotic importance in murid rodents

Abstract The study reveals the prevalence of a potential rodent-borne zoonotic helminth species, Hymenolepis diminuta in commensal rodents caught from irrigated and rain-fed areas of Swat, Pakistan. Three hundred and fifty rodents (269 rats and 81 mice) trapped during vegetative, flowering/fruiting and mature/harvesting stages of crops were studied from 2011-2013. Hymenolepisdiminuta eggs were identified on the basis of their shape, size, colour and markings on the surface of the egg shell and three pairs of embryonic hook-lets. Overall prevalence of H. diminuta was 3.14% (n=11/350). The highest prevalence 3.49% (n=5/143) of H. diminuta was noted at harvesting stages of the crops whereas the lowest 2.59% (n=2/77) during vegetative stage. Infection was higher in males 3.25% (n=7/215) than females 2.96% (n=4/135). Adult rodents were highly infected while no sub-adult was found infected. Infection was higher in mice 3.70% (3/81) than rats 2.69% (8/269) while no significance (p=1.0000:0.1250 to 32.00 CI). Rats and mice appears to show the most suitable reservoirs by hosting H. diminuta a zoonotic helminth. The presence of these rodents in all possible habitats can act as a main channel of transferring parasites through various habitats and can pose a hazard to humans in the area.

Resumo O estudo revela a prevalência de uma espécie potencial de helmintos zoonóticos transmitidos por roedores, Hymenolepis diminuta, em roedores comensais capturados em áreas irrigadas e alimentadas pela chuva de Swat, Paquistão. Trezentos e cinquenta roedores (269 ratos e 81 camundongos) presos durante os estágios vegetativo, floração/frutificação e maturidade/colheita das safras foram estudados de 2011-2013. Ovos de Hymenolepisdiminuta foram identificados com base em sua forma, tamanho, cor e marcações na superfície da casca do ovo e três pares de anzóis embrionários. A prevalência geral de H. diminuta foi de 3,14% (n = 11/350). A maior prevalência 3,49% (n = 5/143) de H. diminuta foi observada na fase de colheita das lavouras, enquanto a menor 2,59% (n = 2/77) durante a fase vegetativa. A infecção foi maior nos homens 3,25% (n = 7/215) do que nas mulheres 2,96% (n = 4/135). Roedores adultos foram altamente infectados, enquanto nenhum subadulto foi encontrado infectado. A infecção foi maior em camundongos 3,70% (3/81) do que em ratos 2,69% (8/269), embora sem significância (p = 1,0000: 0,1250 a 32,00 CI). Ratos e camundongos parecem mostrar os reservatórios mais adequados hospedando H. diminuta um helmintos zoonótico. A presença desses roedores em todos os habitats possíveis pode atuar como um canal principal de transferência de parasitas através de vários habitats e pode representar um perigo para os humanos na área.

Antibiotic resistance and virulence factors among Escherichia coli isolates from avian organic fertilizer / Resistência a antibióticos e fatores de virulência entre isolados de Escherichia coli provenientes de fertilizante orgânico aviário

ABSTRACT: Brazilian poultry industry generates large amounts of organic waste, such as chicken litter, which is often used in agriculture. Among the bacteria present in organic fertilizer are members of the Enterobacteriaceae family, such as Escherichia coli. The aim of this study was to analyze the profile of virulence factors and antimicrobial resistance of E. coli isolates from avian organic fertilizer. A total of 47 E. coli strains were tested through Polymerase chain reaction to detect virulence genes (hlyF, iss, ompT, iutA and iroN). Fourteen antimicrobials were used to test antimicrobial susceptibility in the strains. Genes characteristic of Avian Pathogenic E. coli (APEC) were reported among the strains, with the hlyF, iss and ompT genes being the most prevalent. The isolates showed high resistance (˃50%) to tetracycline, gentamicin, cefotaxime, nitrofurantoin, trimethoprim-sulfamethoxazole and ampicillin. Multidrug resistance was reported in a great number of strains (>70%). The results showed the presence of APEC cells with virulence genes and antimicrobial resistance after 15 days of the windrowing process in poultry houses, it means this process should be improved to eliminate these cells.

RESUMO: A indústria avícola brasileira gera grandes quantidades de resíduos orgânicos, como a cama de frango, utilizada frequentemente na agricultura. Entre as bactérias presentes neste fertilizante orgânico estão os membros da família Enterobacteriaceae, entre eles a Escherichia coli. O objetivo deste estudo foi analisar o perfil de fatores de virulência e resistência antimicrobiana de isolados de E. coli provenientes do fertilizante orgânico aviário. Um total de 47 cepas de E. coli foram testadas por meio da reação em cadeia da polimerase para detectar genes de virulência (hlyF, iss, ompT, iutA e iroN). Quatorze antimicrobianos foram utilizados para testar a susceptibilidade antimicrobiana nos isolados. Genes característicos de E. coli Patogênica Aviária (APEC) foram encontrados entre os isolados, sendo os genes hlyF, iss e ompT os mais prevalentes. Os isolados apresentaram alta resistência (˃50%) à tetraciclina, gentamicina, cefotaxima, nitrofurantoína, trimetoprima-sulfametoxazole e ampicilina. Múltipla resistência a drogas antimicrobianas foi encontrada em grande número de isolados (>70%). Os resultados obtidos mostraram a presença de células APEC portando genes de virulência e resistência a antimicrobianos após 15 dias de processo de empilhamento nas granjas, indicando que o processo necessita de um aperfeiçoamento para eliminar estas células.

Identificación de bacterias y parásitos asociados a la materia fecal de diferentes ejemplares de Equus ferus caballus de Salento, departamento del Quindío / Identification of bacteria and parasites associated with fecal matter from different specimens of Equus ferus caballus from Salento, department of Quindío

Las enfermedades de origen zoonótico han sido gravemente descuidadas en países en vía de desarrollo, sin tener en cuenta que esto puede tener graves implicaciones a nivel de salud pública, particularmente para Colombia, en las últimas décadas se han dado fuertes cambios sociales que han implicado, entre otras cosas, el aumento de la tendencia a la posesión de animales de compañía incluyendo a Equus ferus caballus, para el cual, la microbiota asociada ha sido mal estudiada en comparación con otros animales. Por lo anterior, se planteó como objetivo identificar la microbiota bacteriana y parasitaria asociada a la materia fecal de Equus ferus caballus, para cumplir dicho objetivo, se tomaron muestras independientes para cada uno de los fines, realizando la concentración de parásitos mediante la técnica de Ritchie y cultivo de bacterias para su posterior identificación mediante el Kit BD BBL CRYSTAL E/NF y GP. Para el análisis de los datos se realizó regresión logística mediante Statgraphics. Se lograron aislar 19 bacterias de las cuales seis fueron explicadas por al menos uno de las variables tenidas en cuenta. Nueve de las bacterias aisladas no se habían reportado con anterioridad para equinos. Se reportan tres géneros de parásitos nuevos para la especie (Balantidium sp, Cyclospora sp. y Taenia sp.) y cuatro nuevos para el país (Allantosoma sp, Blepharocorys sp, Cycloposthium sp. y Bundleia sp.) Se concluye que las variables tenidas en cuenta si tienen influencia en la incidencia de algunos microorganismos aislados, de igual manera se reportan nuevas especies de bacterias para Equus ferus caballus así como de parásitos.

Diseases of zoonotic origin have been seriously neglected in developing countries, without taking into account that this may have serious public health implications, particularly for Colombia, in recent decades there have been strong social changes that have involved, among other things, the increase of the tendency to the possession of companion animals including Equus ferus caballus, for which, the associated microbiota has been poorly studied in comparison with other animals. Therefore, we set ourselves the objective of identifying the bacterial and parasitic diversity associated with fecal matter of Equus ferus caballus. For this, independent samples were taken for each of the purposes, making the concentration of parasites using the Ritchie technique; Samples for bacterial isolation were processed and identified with the BD BBL CRYSTAL E / NF and GP Kit. For the analysis of the data, logistic regression was performed using Statgraphics. We were able to isolate 19 bacteria, of which six were explained by at least one of the variables taken into account. Nine of the isolated bacteria had not been previously reported for equines. Three genera of new parasites are reported for the species (Balantidium sp, Cyclospora sp and Taenia sp.) And four new for the country (Allantosoma sp, Blepharocorys sp, Cycloposthium sp. and Bundleia sp.) It is concluded that the variables taken into if they have influence on the incidence of some isolated microorganisms, in the same way new species of bacteria for Equus ferus caballus as well as parasites are reported.

Virus orf en humanos, confirmación molecular de un caso clínico en Chile / Orf virus in human, confirmation in case report from Chile

Resumen La infección por el virus orf, también conocida como ectima contagioso, es reconocida una zoonosis ocupacional. Se diagnostica por lesiones cutáneas que evolu cionan rápidamente desde máculas a pápulas, vesículas y pústulas. Se presenta el caso clínico de una estudiante de medicina veterinaria que había tenido contacto con caprinos, clínicamente sanos y sin lesiones aparentes, hacía 19 días. Presentó dos lesiones vesiculares que coalescieron hasta formar una lesión de mayor tamaño rodeada por un halo eritematoso. Las lesiones fueron compatibles con la presentación clásica de las producidas por el virus orf en humanos. Se confirmó la presencia del virus orf mediante una RPC anidada del tejido de biopsia. Es uno de los primeros casos confirmados mediante técnicas moleculares en seres humanos en Chile.

Infection with the orf virus, also known as contagious ecthyma, is recognized as an occupational zoonosis worldwide. It is diagnosed by cutaneous lesions that progress rapidly from macules to papules, vesicles and pustules. The clinical case of a student of veterinary medicine who had had contact with goats, clinically healthy and without apparent lesions, which occured 19 days ago, is reported. She presented two vesicular lesions that coalesced to form a larger lesion surrounded by an erythematous halo. The lesions were compatible with the classical presentation of those produced by the orf virus in humans. The presence of the orf virus was confirmed by a nested PCR from biopsy tissue. It is one of the first cases confirmed by molecular techniques in humans in Chile.