Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina / Caracterización de aislamientos clínicos de Escherichia coli resistente a cefalosporinas de tercera generación de Ushuaia, Argentina

Abstract Escherichia coli is one of the main human pathogens causing different hospital- and community-acquired infections. During the period from January 2013 to March 2015, 1.96% (32/1632) of E. coli isolates recovered at the Hospital Regional de Ushuaia, Tierra del Fuego province, were resistant to third-generation cephalosporins (TGCs). These isolates were resistant to cefotaxime (91%) and/or ceftazidime (28%). No resistance to carbapenems was detected. Twenty-six isolates were positive for blaCTX-M gene, grouped as CTX-M-1/15 (54%); CTX-M-9/14 (25%); CTX-M-2 (17%); and CTX-M-1/15 plus CTX-M-9/14 (4%). Five TGC-resistant strains were positive for blaCMY gene, while one strain harbored TEM-19 ESBL. Twelve isolates were identified as ST131 E. coli hyperepidemic clone, and one as ST69. Genome sequence analysis of seven blaCTX-M-15 E. coli selected isolates confirm the circulation of ST131, ST617 and ST405 international high-risk clones in the city of Ushuaia.

Resumen Escherichia coli es uno de los principales patógenos humanos causantes de diferentes infecciones de inicio hospitalario y comunitario. Se determinó que el 1,96% (32/1.632) de los aislamientos de E. coli recuperados entre enero de 2013 y marzo de 2015 en el Hospital Regional de Ushuaia, provincia de Tierra del Fuego, fueron resistentes a cefalosporinas de tercera generación (CTG). Estos aislamientos fueron resistentes a cefotaxima (91%) y/o a ceftazidima (28%). No se detectó resistencia a los carbapenemes. Veintiséis aislamientos fueron positivos para el gen blaCTX-M, agrupados como CTX-M-1/15 (54%), CTX-M-9/14 (25%), CTX-M-2 (17%) y CTX-M-1/15 más CTX-M-9/14 (4%). Cinco cepas resistentes a CTG dieron positivo para el gen blaCMY, mientras que un aislamiento presentó la BLEE TEM-19. Doce aislamientos se identificaron como clon hiperepidémico E. coli ST131 y uno como ST69. El análisis de las secuencias del genoma de siete aislamientos seleccionados de E. coli blaCTX-M-15 confirmó la circulación de los clones internacionales de alto riesgo ST131, ST617 y ST405 en la ciudad de Ushuaia.

Resistencia antibiótica de Escherichia coli, según producción de beta lactamasas de espectro extendido, en urocultivos. Hospital III-1. Chiclayo, Perú 2020

Objetivo: determinar la resistencia antibiótica de Echerichia coli, en urocultivos, según produccion de BLEE, en pacientes hospitalizados. El estudio: Diseño descriptivo - retrospectivo. La identificación bacteriana se hizo con VITEK XL, la susceptibilidad, con las pautas del CLSI M100. 30 edicion. Hallazgos. E. coli BLEE positivo, presento resistencia de 0% a: Meropenem, ertapenem, tigeciclina y colistina. Piperacilina/tazobactam, nitrofurantoina, imipenem, amicacina con 16.7%, 6.2%, 5% y 1% respectivamente. E. Coli BLEE negativo, presento resistencia de 0% a: cefotaxima, cefuroxime, tigeciclina y piperacilina/tazobactam. Ceftriaxona, cefepime, gentamicina, cefazolina, ceftazidima, nitrofurantoina, meropenem, amicacina, imipenem y ertapenem con 14.7%, 13%, 13%, 10.7%, 9.7%, 9.1%, 9.1%, 8%, 5%, 2.7%, respectivamente. Conclusion: Meropenen, ertapenem, tigeciclina, colestina, piperacilina/tazobactam, nitrofurantoina, amicacina y imipenem, con resistencia menor de 20%, fueron los mismos, para E. coli BLEE positivo, y E. coli, sin considerar la produccion de BLEE.

ABSTRAC Objective: to determine the antibiotic resistance of Echerichia coli, in urine cultures, according to ESBL production, in hospitalized patients. The study: Descriptive-retrospective design. Bacterial identification was done with VITEK XL, susceptibility, with the CLSI M100 guidelines. 30 edition. Findings: E. coli ESBL positive, presented 0% resistance to: Meropenem, ertapenem, tigecycline and colistin. Piperacillin/tazobactam, nitrofurantoin, imipenem, amikacin with 16.7%, 6.2%, 5% and 1% respectively. E. Coli ESBL negative, presented 0% resistance to: cefotaxime, cefuroxime, tigecycline and piperacillin/tazobactam. Ceftriaxone, cefepime, gentamicin, cefazolin, ceftazidime, nitrofurantoin, meropenem, amikacin, imipenem, and ertapenem with 14.7%, 13%, 13%, 10.7%, 9.7%, 9.1%, 9.1%, 8%, 5%, 2.7%, respectively. Conclusion: Meropenen, ertapenem, tigecycline, cholesterol, piperacillin/tazobactam, nitrofurantoin, amikacin and imipenem, with less than 20% resistance, were the same for ESBL-positive E. coli, and E. coli, without considering ESBL production.

Impacto de infecciones y enterobacterias productoras de betalactamasa de espectro extendido en la supervivencia del injerto y del paciente en un programa de trasplante renal en México / Impact of infections and extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae on graft and patient survival in a kidney transplantation program in Mexico

Resumen Introducción: Los tratamientos inmunosupresores han mejorado las tasas de supervivencia del injerto y del paciente, pero pueden incrementar las infecciones postrasplante. Objetivos: Analizar los datos de pacientes con trasplante renal y describir las bacterias responsables de las infecciones que presentan. Métodos: Estudio observacional, longitudinal y analítico de 103 pacientes sometidos a trasplante renal. El periodo de seguimiento fue de 5.07 ± 1.28 años. Resultados: La tasa de mortalidad fue de 10.68 % y la de pérdida del injerto de 14.56 %. Respecto al riesgo de muerte del receptor, el modelo de regresión de Cox mostró un cociente de riesgo (HR, hazard ratio) de 5.66 en los pacientes con cultivo bacteriano positivo y de 2.22 en aquellos con cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE); en cuanto a la pérdida del injerto, el HR fue de 4.59 en quienes tuvieron cultivo bacteriano positivo y de 4.25 en aquellos con cepas productoras de BLEE. Conclusiones: Se encontró riesgo significativo de muerte en receptores de trasplante renal con cultivo bacteriano positivo y mayor riesgo de pérdida del injerto en aquellos con cultivo bacteriano positivo y aislamiento de cepas productoras de BLEE. La tasa de enterobacterias productoras de BLEE es alta, por ello son necesarias estrategias más estrictas para controlar del uso de antibióticos.

Abstract Introduction: Immunosuppressive treatments have improved graft and patient survival rates, but can increase the incidence of post-transplant infections. Objectives: To analyze data from kidney transplant patients and describe the pathogens responsible for the infections they experience. Methods: Longitudinal, analytical, observational study of 103 patients who underwent kidney transplantation. The follow-up period was 5.07 ± 1.28 years. Results: Overall mortality rate was 10.68% and graft loss rate was 14.56%. Regarding recipient risk of death, the Cox regression model showed a hazard ratio (HR) of 5.66 for positive bacterial cultures and 2.22 for positive extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing strains; as for graft loss, HR was 4.59 in those with positive bacterial cultures and 4.25 in those who were positive for ESBL-producing strains Conclusions: Significant death risk was found in kidney transplant recipients with positive bacterial cultures and an increased risk of graft loss in those with positive bacterial cultures and in those who were positive for ESBL-producing Enterobacteriaceae isolates. The rate of ESBL-producing Enterobacteriaceae is high, and stricter strategies are therefore necessary to control the use of antibiotics.

Risk factors for ESBL-positive Escherichia coli urinary tract infections / Factores de riesgo para infección urinaria por Escherichia coli BLEE positiva

Abstract Objective: to determine the association of prior antibiotic use, prior hospitalizations, prior urinary tract infections, age, sex and comorbidities in adult patients hospitalized with urinary tract infections caused by extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli. Materials and methods: a case-control study carried out in the hospital setting of private clinics in Lima. Thirty cases and 30 controls were included, with cases defined as hospitalized patients with an ESBL-producing E. coli urinary tract infection diagnosed by urine culture, and controls defined as hospitalized patients without ESBL-producing E. coli infection. Data were taken from incident cases. A bivariate analysis was performed followed by multivariate logistic regression using the significant variables from the bivariate analysis. Results: the associated factors were: prior antibiotic use OR: 261 (22.5-11,017.4), prior hospitalization OR: 4.6 (1.39-16.1), and prior urinary tract infection OR: 36 (6.9-227.2). After adjusting for potential confounding factors using logistic regression, the main statistically significant associated factor was prior antibiotic use, OR: 97.7 (8.4-1,128.3, p<0.000). Conclusion: evidence was found that prior antibiotic use is a risk factor significantly associated with ESBL E. coli urinary tract infections. (Acta Med Colomb 2022; 47. DOI:https://doi.org/10.36104/amc.2022.2131).

Resumen Objetivo: establecer la asociación del uso previo de antibióticos, hospitalizaciones previas, infección urinaria previa, edad, sexo y comorbilidades en pacientes adultos hospitalizados con infección urinaria por Escherichia coli productora de beta lactamasas de espectro extendido (BLEE). Material y métodos: estudio caso control, realizado en clínicas privadas de Lima en ámbito hospitalario. Se incluyeron 30 casos y 30 controles, definiéndose como caso al paciente hospitalizado que cuente con diagnóstico de infección urinaria por urocultivo de E. coli productora de BLEE y como control al paciente hospitalizado sin infección por E. coli BLEE. Se recolectó la información de casos incidentes. Se realizó un análisis bivariado y regresión logística multivariable con las variables que fueron significativas en el análisis bivariado. Resultados: los factores asociados fueron: uso previo de antibióticos OR: 261 (22.5-11017.4), hospitalización previa OR: 4.6 (1.39-16.1), infección urinaria previa OR: 36 (6.9-227.2). Al ajustar por variables potencialmente confusoras mediante regresión logística, se observó que el principal factor asociado con significación estadística fue el uso previo de antibióticos, OR: 97.7 (8.4-1128.3, p<0.000). Conclusión: se encontró evidencia de que el uso previo de antibióticos es un factor de riesgo asociado significativamente a infección urinaria por E. coli BLEE. (Acta Med Colomb 2022; 47. DOI:https://doi.org/10.36104/amc.2022.2131).

Caracterización clínica-microbiológica y factores de riesgo de las bacteriemias por enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido en el hospital universitario / Clinical-microbiological characterization and risk factors of bacteremia caused by extended-spectrum beta-lactamase-producing enterobacteria at the university hospital

INTRODUCCIÓN: Las infecciones del torrente sanguíneo se asocian con alta morbi- mortalidad, siendo frecuentemente causadas por enterobacterias, y cuando éstas producen ß-lactamasas de espectro extendido (BLEEs), la morbi-mortalidad, duración internación y costos sanitarios son aún mayores. OBJETIVO: Caracterizar los episodios de bacteriemia por enterobacterias en el Hospital Universitario en un período de 2 años. METODOLOGÍA: Estudio observacional, analítico, casos controles (1:1), con recolección de datos retrospectiva. Población: pacientes ≥18 años atendidos en el Hospital Universitario en período 01/01/2014 - 30/11/2015, con hemocultivo positivo por enterobacteria. Recolección datos clínicos-epidemiológicos: revisión registros médicos. Estudio microbiológico: Identificación y susceptibilidad - equipo automatizado Vitek® 2 system (bioMérieux, Marcy l'Etoile, France). Sensibilidad a fosfomicina: disco-difusión (E. coli) y dilución en agar (resto de las enterobacterias). Ceftazidime-avibactam: disco-difusión. Aislamientos BLEE+ según Vitek: confirmación y caracterización de BLEE: reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y secuenciación. Investigación mecanismos transferibles de resistencia a quinolonas (TMQR) qnrB y aac(6')-Ib-cr: PCR. Caracterización molecular enterobacterias BLEE más prevalentes: MultiLocus Sequence Typing (MLST) y Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). Análisis casos y controles: I)Factores de riesgo bacteriemia BLEE: Casos - pacientes con bacteriemia por enterobacteria BLEE(+). Controles - pacientes con bacteriemia por enterobacteria BLEE (-) sensible a cefalosporinas tercera generación. II) Factores de riesgo mortalidad intrahospitalaria: Casos - pacientes con mortalidad hospitalaria por cualquier causa. Controles ­ pacientes egresados vivos. Análisis estadístico: paquete estadístico IBM SPSS Statistics 23. Análisis casos y controles: cálculo de odd ratios (OR) e intervalo de confianza al 95% (IC95%). Variables con p ≤0.05 en análisis univariado incluídas en análisis multivariado (regresión logística). Proyecto aprobado por Comité Ética del Hospital de Clínicas y financiado por ANII (FMV_3_2016_1_126580, Fondo María Viña ­ 2016). RESULTADOS: Principales resultados microbiológicos: 174 episodios de bacteriemia y 178 enterobacterias recuperadas, con confirmación molecular de producción BLEE en 41 enterobacterias (23%): 29 Klebsiella pneumoniae, 7 Escherichia coli, 2 Serratia marcescens, 1 Enterobacter cloacae, 1 Citrobacter freundii y 1 Morganella morganii. E. coli enterobacteria más recuperada (n=69), pero K. pneumoniae la enterobacteria BLEE más prevalente (56 aislamientos y 29/56 BLEE+), seguida de E. coli (7/69). Distribución de las enterobacterias BLEE+ según enzima detectada: CTX- M-15: 32 aislamientos, CTX-M-15 + CTX- M-14: 3 aislamientos, CTX-M-2: 3, CTX-M-8: 2, SHV-5: 1. Susceptibilidad enterobacterias BLEE: meropenem 100%, ceftazidime-avibactam 100%, fosfomicina 100%, imipenem 98%, ertapenem 97,6%, colistin 92,7%, amikacina 85,4%, gentamicina 36,6%, tigeciclina 29,3%, piperacilina-tazobactam 26,8%, trimetoprim-sulfametoxazol 19,5%, ciprofloxacina 12,2%. Detección de mecansimos transferibles de resistencia a quinolonas (TMQR) en 33/41 aislamientos (80,5%): aac(6')-Ib-cr: 22 aislamientos, qnrB: 2 aislamientos, y aac(6')-Ib-cr + qnrB: 9 aislamientos. Detección de secuenciotipos "exitosos" en principales enterobacterias BLEE: E. coli ST 73 (1), ST 95(1) y ST 38 (2) y ST 258 en K. pneumoniae (12/29=41,4%). También detección ST 258 en un aislamiento de K. pneumoniae BLEE (-). Principales resultados clínicos ­ epidemiológicos: Se revisaron 98 registros médicos; 60 bacteriemias nosocomiales, 29 comunitarias, 8 asociadas a los cuidados de la salud, 1 sin dato. 41 BLEE(+) y 57 BLEE(-). 80 pacientes vivos al egreso, 17 fallecidos y 1 sin dato. Factores de riesgo bacteriemia BLEE(+) (análisis multivariado) : presencia de dispositivo médico a permanencia previo (p 0,001, OR 55,2, IC 95%5,5-553) ) y bacteriemia no comunitaria (p 0,008 OR 17,4 IC95% 2,1-143). Factores de riesgo mortalidad intrahospitalaria (análisis multivariado): enfermedad hematooncológica o neoplásica (OR 4,687 IC95% 1,207-18,200) y score qPitt ≥2 (OR 10,332 IC95% 2,639-40,442). Antibioticoterapia empírica activa in vitro para la bacteriemia: 10/29(34,5%) en pacientes BLEE(+) y 36/40 BLEE(-) (90%). Se encontró asociación entre bacteriemia BLEE + y recibir antibioticoterapia empírica inactiva (p<0,0001) ; siendo el riesgo de recibir antibioticoterapia empírica inactiva 17 veces mayor en bacteriemias BLEE(+) respecto a BLEE(-). Se encontró que la mediana de la duración de la hospitalización a partir del episodio de bacteriemia es más prolongada en casos BLEE+ que en los controles BLEE- (22,5 versus 14 días, p=0,006). CONCLUSIONES: Enterobacteria BLEE más prevalente K. pneumoniae, y dentro de ella alta prevalencia del clon exitoso de alto riesgo ST 258. Predominio de CTX-M-15, y alta prevalencia (> 80%) de TMQR en aislamientos BLEE. Presencia de BLEE aumenta significativamente el riesgo de recibir antibioticoterapia empírica inactiva. Necesidad de mantener vigilancia de perfiles de susceptibilidad y clones circulantes y considerar posibles factores de riesgo al momento se seleccionar antibioticoterapia empírica.

BACKGROUND: Bloodstream infections are associated with high morbidity and mortality, being frequently caused by Enterobacteriaceae, and when they produce extended spectrum ß-lactamases (ESBL), morbidity, mortality and healthcare costs are even higher. OBJECTIVE: We aimed to characterize Enterobacteriaceae bacteremia episodes at the "Hospital de Clínicas", in a 2 years period. METHODS: Observational, analytical study, case-controls (1: 1), with retrospective data collection. Population: ≥18 years old patients attended at the "Hospital de Clínicas" between 01/01/2014 and 11/30/2015, with Enterobacteriaceae recovered from blood culture. Collection of clinical-epidemiological data: review of medical records. Microbiological study: identification and susceptibility: automated system Vitek® 2 (bioMérieux, Marcy l'Etoile, France). Susceptibility to fosfomycin: disc-diffusion (E. coli) and agar dilution (others Enterobacterales). Ceftazidime-avibactam: disc-diffusion. ESBL (+) isolates according to Vitek: ESBL confirmation and characterization by Polymerase Chain Reaction (PCR) and sequencing. Investigation of transferable mechanisms of quinolone resistance (TMQR) qnrB and aac (6 ')- Ib-cr: PCR. Molecular characterization of the most prevalent ESBL enterobacterales: MultiLocus Sequence Typing (MLST) and Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). Case-control analysis: I) ESBL bacteremia risk factors: Cases - patients with bacteremia by an ESBL-producing enterobacteria. Controls - patients with third generation cephalosporin susceptible enterobacteria, not ESBL-producing. II) In-hospital mortality risk factors: Cases - patients with in-hospital mortality from any cause. Controls - patients discharged alive. Statistical analysis: IBM SPSS Statistics 23 statistical package. Case-control analysis: calculation of odd ratios (OR) and 95% confidence interval (95% CI). Variables with p ≤0.05 in univariate analysis were included in multivariate analysis (logistic regression). Project approved by the Hospital de Clinicas Ethics Committee and financed by ANII (FMV_3_2016_1_126580, María Viña Fund - 2016). RESULTS: Main microbiological results: 174 bacteremia episodes and 178 enterobacterales recovered. ESBL production confirmated in 41 isolates (23%): 29 Klebsiella pneumoniae, 7 Escherichia coli, 2 Serratia marcescens, 1 Enterobacter cloacae, 1 Citrobacter freundii y 1 Morganella morganii.E. coli was the most recovered enterobacteria (n = 69), but K. pneumoniae was the most prevalent ESBL producing specie (56 isolates and 29/56 ESBL +), followed by E. coli (7/69). Distribution of ESBL producing enterobacterales according to enzyme detected: CTX- M-15: 32 isolates, CTX-M-15 + CTX-M-14: 3 isoaltes, CTX-M-2: 3, CTX-M-8: 2, SHV-5: 1. Antibiotic susceptibility in ESBL producers: meropenem 100%, ceftazidime-avibactam 100%, fosfomycin 100%, imipenem 98%, ertapenem 97,6%, colistin 92,7%, amikacin 85,4%, gentamicin 36,6%, tigecycline 29,3%, piperacillin-tazobactam 26,8%, trimethroprim sulfamethoxazole 19,5%, ciprofloxacin 12,2%. Detection of TMQR in 33/41 isolates (80.5%): aac(6')-Ib-cr: 22 isolates, qnrB: 2 isolates, and aac(6')Ib-cr + qnrb: 9 isolates. We detected "successful" sequence types within E. coli ESBL producing: ST 73 (1 isolate), ST 95 (1) and ST 38 (2) and a high prevalence of ST 258 among K. pneumoniae isolates (12/29 = 41.4%). ST 258 was also detected in one ESBL(-) K. pneumoniae isolate. Main clinical-epidemiological results: 98 medical records were reviewed; 60 bacteremia episodes were classified as nosomial, 29 as community acquired, 8 health care associated, and for one episode, data was insufficient for its classification. 41 were ESBL(+) and 57 ESBL(-). 80 patients alive at discharge, 17 deceased and 1 without data. Risk factors for ESBL bacteremia according to multivariate analysis were: use of medical device prior to hospitalization (OR = 50.226, 95% CI 4.367 - 577.721) and non-community bacteremia (OR 12.052, 95% CI 1.350-107.605). In-hospital mortality risk factors (multivariate analysis): hemato-oncological or neoplasic disease (OR 4,687 95% CI 1,207-18,200) and qPitt score ≥2 (OR 10,332 95% CI 2,639-40,442). The empirical antibiotic therapy was active according to the susceptibility test in 10/29 (34,5%) patients with ESBL (+) bacteremia and in 36/40 patients with ESBL (-) (90%). Presence of ESBL was found to be associated with inactive empirical antibiotic therapy (p<0.0001), and risk for receiving inactive empirical antibiotic therapy was 17 times higher in ESBL (+) compared to ESBL (-). The mean length of hospital stay after the onset of bacteraemia was longer in the cases of ESBL producers than in the cases of non-ESBL producers ( 22,5 vs. 14 days; P=0.006). CONCLUSIONS: K. pneumoniae was the most prevalent ESBL producing specie, and within it we found a high prevalence of the successful high-risk clone ST258. CTX-M-15 was the main ESBL detected and we found high prevalence (80%) of TMQR among ESBL(+). Presence of ESBL significantly increases the risk of receiving inactive empirical antibiotic therapy. Need to maintain surveillance of susceptibility profiles and circulating clones and to take into account possible risk factors when selecting empirical antibiotic therapy.

Detección de ß-lactamasas de espectro extendido en Escherichia coli aisladas de ecosistemas dulceacuícolas de La Habana / Detection of extended-spectrum ß;-lactamases in Escherichia coli isolated from freshwater ecosystems in Havana

Introducción: Las cepas de Escherichia coli productoras de β-lactamasas de espectro extendido son patógenos multirresistentes y una de las bacterias que más contribuyen con la resistencia antibiótica bacteriana en la clínica. Sin embargo, se aíslan cada vez con más frecuencia de ambientes naturales, tales como los ecosistemas acuáticos en los cuales se emplea como un indicador de contaminación fecal. Objetivo: Evaluar la susceptibilidad a los antibióticos y la producción de enzimas ß-lactamasas de espectro extendido de aislados de Escherichia coli procedentes de ecosistemas dulceacuícolas de La Habana. Métodos: Se analizaron 43 aislados de E. coli provenientes de los ríos Almendares, Quibú y Luyanó de La Habana. Se determinó la susceptibilidad a 18 antibióticos y la producción fenotípica de ß-lactamasas de espectro extendido según las normas del Instituto de Estándares para el Laboratorio Clínico. La detección molecular de las enzimas se realizó mediante reacción en cadena de la polimerasa. Se calculó el índice de multirresistencia a los antibióticos y los patrones de resistencia de cada aislado de E. coli- ß-lactamasas de espectro extendido. Resultados: El 65 por ciento de los aislados de E. coli fueron resistentes al menos a un antibiótico y el 35 por ciento fueron sensibles a todos los antibióticos. El fenotipo ß-lactamasas de espectro extendido fue detectado en siete aislados; de estos, cuatro fueron portadores del gen bla CTX-M-1 y tres presentaron bla TEM. El 37 por ciento de los aislados de E. coli mostraron valores de índices de multirresistencia a los antibióticos menores que 0,22; el 16 por ciento de 0,22; el 9,3 por ciento mayor que 0,5; y el 5 por ciento mayor que 0,7. Los aislados de E. coli-BLEE mostraron corresistencia a las familias de las tetraciclinas, quinolonas, aminoglucósidos y macrólidos. Conclusiones: La presencia de aislados ambientales multirresistentes de E. coli productores de ß-lactamasas de espectro extendido en ecosistemas dulceacuícolas de La Habana destaca la necesidad de implementar estrategias de control para prevenir la diseminación de estos aislados en los ambientes naturales(AU)

Introduction: Extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli strains are multiresistant pathogens and one of the bacteria contributing most greatly to bacterial antibiotic resistance in clinical practice. However, they are increasingly isolated from natural environments, such as aquatic ecosystems, where they are used as fecal pollution indicators. Objective: Evaluate antibiotic susceptibility and extended-spectrum ß-lactamase enzyme production in Escherichia coli isolates from freshwater ecosystems in Havana. Methods: An analysis was conducted of 43 E. coli isolates from the rivers Almendares, Quibú and Luyanó in Havana. Determination was made of susceptibility to 18 antibiotics and phenotypic production of extended-spectrum ß-lactamases according to standards from the Clinical and Laboratory Standards Institute. Molecular detection of the enzymes was performed by polymerase chain reaction. Estimation was carried out of the antibiotic multiresistance index and the resistance patterns of each extended-spectrum E. coli ß-lactamase isolate. Results: Of the E. coli isolates studied, 65 percent were resistant to at least one antibiotic, whereas 35 percent were sensitive to all antibiotics. The extended-spectrum ß-lactamase phenotype was detected in seven isolates, of which four were carriers of the gene bla CTX-M-1 and three contained bla TEM. 37 percent of the E. coli isolates displayed antibiotic multiresistance index values below 0.22, 16 percent of 0.22, 9.3 percent above 0.5 and 5 percent above 0.7. ESBL E. coli isolates displayed co-resistance to the families tetracyclines, quinolones, aminoglycosides and macrolides. Conclusions: The presence of multiresistant extended-spectrum ß-lactamase-producing environmental E. coli isolates in Havana freshwater ecosystems highlights the need to implement control strategies aimed at preventing the spread of these isolates in natural environments(AU)

Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productoras de betalactamasas de espectro extendido en un hospital de La Habana

RESUMEN Introducción: En microorganismos gramnegativos la producción de enzimas betalactamasas es el mecanismo más común de resistencia. Las de espectro extendido constituyen un grupo importante por su capacidad de inactivar las cefalosporinas de tercera y cuarta generación y el aztreonam. Su detección es vital para indicar el tratamiento óptimo y las medidas de aislamiento que eviten la dispersión de los microorganismos que las portan. Objetivos: Determinar la incidencia y principales características de los aislados de Escherichiacoli y Klebsiellapneumoniae productores de betalactamasas de espectro extendido en muestras no urogenitales. Métodos: Estudio transversal realizado en el hospital "Salvador Allende" durante el año 2017. Se determinó la frecuencia de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productoras de betalactamasas de espectro extendido, su procedencia según servicio del hospital, tipo de muestra clínica, y su sensibilidad antimicrobiana. La identificación de betalactamasas de espectro extendido se hizo por el método de doble disco de Jarlier. Resultados: Fueron productores de betalactamasas de espectro extendido 46 y 50 % de aislados de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae, respectivamente. La mayoría provenían de muestras de las salas del Instituto de Angiología, el antimicrobiano con mayor efectividad fue el meropenem, la sensibilidad al resto de los antimicrobianos estuvo por debajo de 80 % y no hubo aislados sensibles a las cefalosporinas de tercera generación. Conclusiones: Se demuestra una alta incidencia de aislados de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productores de betalactamasas de espectro extendido en el Hospital "Salvador Allende" de La Habana, más marcada en las salas del Instituto de Angiología y en muestras de piel.

ABSTRACT Introduction: Beta-lactamase production is the most common resistance mechanism in gram-negative microorganisms. Extended-spectrum beta-lactamases are an important group of enzymes capable of inactivating third- and fourth-generation cephalosporins and aztreonam. Their detection is important to indicate the optimum treatment as well as isolation measures aimed at preventing the spread of carrier microorganisms. Objectives: Determine the incidence and main characteristics of isolates of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae from non-urogenital samples. Methods: A cross-sectional study was conducted at Salvador Allende hospital during the year 2017. Determination was made of the frequency of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae, their origin by hospital service, the type of clinical sample and their antimicrobial sensitivity. Identification of extended-spectrum beta-lactamases was based on the Jarlier double disc method. Results: Of the total Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates studied, 46% and 50%, respectively, were extended-spectrum beta-lactamase producers. Most had been obtained from samples taken in wards of the Institute of Angiology; the most effective antimicrobial was meropenem; sensitivity to the remaining antimicrobials was below 80%; no isolates were sensitive to third-generation cephalosporins. Conclusions: A high incidence was found of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates at Salvador Allende Hospital in Havana, more noticeably in Institute of Angiology wards and skin samples.

Factores de riesgo para infección del tracto urinario por microorganismos productores de betalactamasas de espectro extendido en niños en Huancayo, Perú

Introducción: La infección del tracto urinario en los niños es una de las infecciones bacterianas más frecuentes con una alta tasa de recurrencia. Objetivo: Determinar los factores de riesgo para infección del tracto urinario adquirida en la comunidad por microorganismos productores de betalactamasas de espectro extendido en niños en Huancayo, Perú. Métodos: Estudio de tipo analítico con diseño de casos y controles. Se estudiaron 220 niños entre el mes de nacido hasta 13 años de edad, ingresados en el hospital nacional "Ramiro Priale Priale" con el diagnóstico de infección del tracto urinario durante el año 2019. Se distribuyeron en dos grupos (40 casos y 80 controles). Para cada paciente se llenó un cuestionario con las variables de interés y se realizó la comparación entre los grupos. Se realizó el análisis multivariado considerando significativo un valor de p< 0,05. Resultados: La frecuencia de infección del tracto urinario causada por microorganismos productores de betalactamasas de espectro extendido es de 18,18 %. En los casos la edad predominante está entre 1 y 3 años con 42,5 %, sexo femenino con 62,5 %, la bacteria predominante es: Escherichia coli en 85,0 %. Durante el análisis multivariado la presencia de infección del tracto urinario complicada tuvo OR 18,62 y p= 0,000 y la recurrente OR 12,98 y p= 0,004, ambas estadísticamente significativas para el desenlace de esta infección en los niños. Conclusión: Los factores de riesgo para infección del tracto urinario adquirida en la comunidad por microorganismos productores de betalactamasas de espectro extendido en niños son: infección del tracto urinario complicada y la recurrente.

Introduction: Urinary tract infection in children is one of the most frequent bacterial infections with a high rate of recurrence. Objective: Determine the risk factors for community-acquired urinary tract infection by microorganisms producing extended-spectrum beta-lactamases in children of Huancayo, Peru. Methods: Analytical study with case-control design. 220 children from one month to 13 years of age were studied, whom were admitted to "Ramiro Priale Priale" National Hospital with the diagnosis of urinary tract infection during the year 2019. They were distributed in two groups (40 cases and 80 controls). For each patient, a questionnaire was completed with the variables of interest, and the comparison between the groups was made. The multivariate analysis was performed considering significant a value of p< 0.05. Results: The frequency of urinary tract infection caused by microorganisms producing extended-spectrum beta-lactamases is 18.18%. In the cases, the predominant age is between 1 and 3 years with 42.5%, female sex with 62.5%, the predominant bacterium is: Escherichia coli in 85.0%. During the multivariate analysis, the presence of complicated urinary tract infection had OR 18.62 and p= 0.000 and recurrent OR 12.98 and p= 0.004, both statistically significant for the outcome of this infection in children. Conclusion: The risk factors for community-acquired urinary tract infection by microorganisms producing extended-spectrum beta-lactamases in children are complicated and recurrent urinary tract infections.

Factores de riesgo asociados a infecciones del tracto urinario por gérmenes productores de betalactamasas de espectro extendido / Risk factors associated with urinary tract infections by spectrum betalactamase producing germs extended

El tratamiento de las infecciones del tracto urinario requiere la constante actualización de la susceptibilidad in vitro de los gérmenes de la zona o institución que permita orientar la elección apropiada del tratamiento empírico. Objetivo: Identificar los factores de riesgo asociados a infecciones del tracto urinario por gérmenes productores de BLEE en pacientes hospitalizados en el Hospital Militar "Dr. Carlos Arvelo" con diagnóstico de infección del tracto urinario durante el periodo enero de 2015 y diciembre de 2019. Método: estudio retrospectivo, corte transversal, casos y controles. Tratamiento estadístico: Se calculó la razón de probabilidades de los factores de riesgo previamente establecidos. Los factores que demuestren asociación significativa en el análisis univariable serán incluidos en el modelo de regresión logística a fin de determinar los predictores independientes de infección por gérmenes productores BLEE. Resultados: Se evaluaron 283 pacientes, 161 con fenotipo de BLEE y 122 no BLEE. La edad mayor a 65 años (p =0,001; OR 1,059), infección del tracto urinario recurrente (p <0,001; OR 3,689), uso de antibióticos en los último 3 meses (p <0,001; OR 6,921), y sondaje vesical permanente mayor a 30 días (p <0,001; OR 6,801) fueron predictores independientes de ITU por bacterias productoras de BLEE. Conclusiones: Los factores de riesgo identificados en nuestro estudio ayudarán a guiar el reconocimiento de pacientes con alto riesgo de infección por estos organismos. Estos resultados sugieren la necesidad de revisión de los esquemas terapéuticos empíricos locales en el tratamiento de infecciones del tracto urinario, basándose en el riesgo de cada paciente(AU)

Urinary tract infections are an important cause of disease, its treatment requires the permanent update of in vitro antimicrobial susceptibility of the major germs of the institution to allow the appropriate choice of empirical treatment; Objective: To identify the risk factors associated with urinary tract infections caused by extended-spectrum beta-lactamases-producing germs in patients admitted at the Hospital Militar "Dr. Carlos Arvelo" with urinary tract infections between the january 2015 and december 2019. Methods: this is a retrospective study of a crosssectional cohort of cases and controls. Statistical Analysis: We also calculated adjusted odds ratios and 95% confidence intervals for target risk factors. Risk factors with significant association to ESBLs in the univariate analysis were included in a logistic regression model in order to determine independent forecasters of infections by ESBL-producing organisms. Results: Two hundred and eighty three patients were assessed: 161 with a phenotype of ESBL and 122 without ESBL. Ages over 65 years old (p =0,001; OR 1,059), regular urinary tract infection (p <0,001; OR 3,689), use of antibiotics in the last 3 months (p <0,001; OR 6,921), and permanent bladder catheterization for more than 30 days (p <0,001; OR 6,801) were independent forecasters of UTIs by ESBL-producing bacteria. Conclusions: the risk factors identified in our study will help guide the recognition of patients at high risk of infection by these organisms. These results suggest the need to review local empirical therapeutic schemes in the management of urinary tract infections, based on the odds of each patient of acquiring these bacteria(AU)

Biliary tract infections and their Microbiological Spectrum- A study from coastal region of Southern India / Infecciones de vías biliares y su espectro microbiologico- Un estudio en región de la costa del sur de la India

Objective: Biliary tract infections include cholangitis and cholecystitis. They are associated with high morbidity and mortality in elderly patients with co-morbid disease. The present study was undertaken to determine the microbial aetiology causing biliary tract infections and also to study their antimicrobial resistance profile. Materials & methods: A retrospective study was conducted from January 2011 to December 2016 at the Enteric Diseases Division, Kasturba Medical College Hospital, Manipal. Patients with biliary tract infections admitted in tertiary referral health care hospital, Manipal were included for the study. Aerobic and anaerobic bacteriological and fungal aetiology of biliary tract infections were recorded along with their antimicrobial resistance profile. Results: Out of 307 bile samples sent for aerobic culture and susceptibly testing 187 (60.91%) were positive for culture, of which Escherichia coli (44.4%) was the predominant aetiology followed by Klebsiella pneumoniae (27.3%). Among the 14 samples sent for anaerobic culture, 5 (35.75%) specimens showed growth, of which Bacteroides fragilis group was found to be the predominant anaerobe. Among the 201 bacterial pathogens tested for their antimicrobial susceptibility, 108 (53.73%) isolates were resistant, out of which 9 were PDR Enterobacteriaceae with 12 ESBL strains. All the Candida species were susceptible to fluconazole with the exception of C. glabrata and C. krusei. All the anaerobic isolates were found to be susceptible to Metronidazole. Conclusions: The high rate of bacterial infection particularly gram-negative bacteria was recorded. It is necessary that antimicrobial therapy be initiated when culture or the clinical conditions reports caution. Routine aerobic and anaerobic culturing of bile samples with biliary tract infections are imperatively necessary. With the emergence of multidrug resistant pathogens and change in the microbiological spectrum of biliary tract infections, there is a need for the empirical antimicrobial therapy in every clinical setting.

Objectivo: Las infecciones del tracto biliar incluyen colangitis y colecistitis. Se asocian a gran mortalidad y morbildiad en pacientes ancianos y con comorbilidad. El presente studio se hizo para detemrianr la etiologia microbiana que produce infecciones biliares y para estudiar su perfil de resistencia antimicrobiana. Materiales & metodos: Se hizo un studio retrospectivo entre los meses de Enero 2011 a Diciembre de 2016 en la "Enteric Diseases Division, Kasturba Medical College Hospital, Manipal" en India. Los pacientes con infección de vías biliares admitidos al centro de atención de tercer nivel se incluyeron en el estudio. Se buscaron bacterias aerobicas y anaerobicas y etiologia fungica y se analizó su perfil de resistencia antibiotica. Resultados: De 307 muestras de bilis enviadas para cultivo aerobico y antibiograma, 187 (60.91%) crecieron en el medio de cultivo, predominando Escherichia coli (44.4%) seguida por Klebsiella pneumoniae (27.3%). Entre las 14 muestras analizadas en medio anaerobio, 5 (35.75%) mostraron crecimiento de Bacteroides fragilis. Entre 201 bacterias probadas por antibiograma, 108 (53.73%) tuvieron perfil de resistencia, de los cuales 9 fueron PDR Enterobacteriaceae con 12 cepas ESBL. Todas las especies de Candida fueron susceptibles al fluconazol con la excepción de C. glabrata y C. krusei. Todos los aislados anaerobios fueron susceptibles al Metronidazol. Conclusiones: Se encontró una alta tasa de infección bacteriana con predominio de gram-negativos. Se hace necesario iniciar terapia antimicrobiana cuando lo sugieren las condiciones clínicas o el resultado del cultivo. El cultivo rutinario de bilis es imperioso. Dado el aumento de patógenos multirresistentes se requiere inicio empírico inmediato

Prevalencia de infecciones osteoarticulares por enterobacterias productoras de ß-lactamasas de espectro extendido / Prevalence of osteoarticular infections by Enterobacteria producing extended-spectrum ß-lactamases

Resumen: Introducción: Las infecciones por enterobacterias productoras de β-lactamasas de espectro extendido (BLEEs) ocasionan una gran carga a los sistemas de salud. Poco se conoce de las infecciones osteoarticulares, por lo que este trabajo estudió la prevalencia de estas infecciones en un hospital de tercer nivel. Material y métodos: Estudio de prevalencia en pacientes de un servicio de traumatología durante 2016, con criterios de infección proporcionados por el CDC de Atlanta, Georgia. Se utilizó el sistema VITEK® 2 AST-N272 (bioMérieux) para la identificación bacteriana a nivel de especie y para las pruebas de susceptibilidad antimicrobiana. Resultados: Se reportaron 7.85% (n = 86) con infecciones osteoarticulares; 22.09% (n = 19) fueron por enterobacterias BLEEs. Con un promedio de 77.1 días de hospitalización (DE 37.7) (46-200 días); el aislamiento del microorganismo se produjo 15 días posteriores al ingreso; 16 (84.2%) pacientes presentaron osteomielitis, tres (15.8%) tuvieron infección protésica de rodilla o cadera. El promedio de días de tratamiento fue de 60 días (21-129 días); 18 pacientes (94.7%) fueron dados de alta con resolución de su cuadro infeccioso; un paciente falleció con infección sobreagregada por neumonía debida a K. pneumoniae resistente a carbapenémicos. Discusión: La prevalencia de infecciones osteoarticulares por enterobacterias BLEEs no se pudo calcular con precisión, pero consideramos que se encuentra dentro de lo esperado, las medidas de control de infecciones requieren tener estándares más elevados y falta desarrollar programas de uso racional de antimicrobianos para controlar la aparición de estas patologías.

Abstract: Introduction: Infections of enterobacteria producing extended-spectrum ß-lactamases place a heavy burden on health systems. Little is known in osteoarticular infections, so this work studied the prevalence of these infections in a third-level hospital. Material and methods: Prevalence study in patients of a Traumatology Service during 2016, with infection criteria provided by the CDC in Atlanta, Georgia. The VITEK® 2 AST-N272 (bioMérieux) system was used for bacterial identification at the species level and for antimicrobial susceptibility tests. Results: 7.85% (n = 86) were reported with osteoarticular infections; 22.09% (n = 19) were by enterobacteria BLEEs. An average of 77.1 days of hospitalization (SD 37.7) (46-200 days); isolation of the microorganism occurred 15 days after entry. Sixteen (84.2%) patients had osteomyelitis, three (15.8%) had a prosthetic knee or hip infection. The average number of treatment days was 60 days (21-129 days). Eighteen patients (94.7%) were discharged with resolution of their infectious picture; one patient died with infection over aggregated pneumonia due to carbapenem-resistant K. pneumoniae. Discussion: The prevalence of osteoarticular infections by enterobacteria BLEEs could not be accurately calculated, but we consider it to be within what is expected, infection control measures require higher standards and there is a lack of development programs to use antimicrobials rationally to control the emergence of these pathologies.

Detección de los genes de ß-lactamasas blaTEM, blaSHV y blaCTX-M en aislamientos de Escherichia coli comunitarios / Detection of ß-lactamase genes bla TEM, bla SHV and bla CTX-M in community isolates of Escherichia coli

A nivel mundial la resistencia a los antibióticos es un problema de salud pública, tanto en el ámbito hospitalario como en el comunitario. La producción de ß-lactamasas es el principal mecanismo de resistencia en enterobacterias y la mayoría de enzimas responsables pertenecen a las familias TEM, SHV y CTX-M. El objetivo de este estudio fue detectar los genes de ß-lactamasas blaTEM, blaSHV y blaCTX-M en cepas comunitarias de Escherichia coli productoras de BLEE aisladas de urocultivos de pacientes que acudieron al Laboratorio Clínico Popular de la Universidad de San Carlos de Guatemala en el año 2016. Se detectó la presencia de al menos uno de los genes en el 90% de los 79 aislamientos y un 53.2% presentó los tres genes. La frecuencia fue de 57% para blaCTX-M, 84% para bla SHV y 85% para blaTEM. La detección de los genes codificadores de las enzimas TEM-1, SHV-11, CTX-M15 y CTX-M55 corresponde a la primera caracterización molecular de aislamientos de E. coli productoras de BLEE en Guatemala y son importantes para entender su propagación en el ámbito comunitario. Los aislamientos de E. coli productoras de BLEE mostraron alta resistencia a ciprofloxacina y trimetoprim sulfametoxazol (78%) y bajos niveles de resistencia para fosfomicina (2.5%) y nitrofurantoina (7.6%). El 11.39% de las cepas presentó resistencia a un grupo de antibióticos no betalactámicos. Es importante establecer una vigilancia activa para la resistencia de estos antibióticos en cepas comunitarias ya que son la primera opción de tratamiento para cepas productoras de BLEE

Globally, resistance to antibiotics is a public health problem, both in the hospital and in the community environment. e production of ß-lactamases is the main mechanism of resistance in enterobacteria and usually the cause of resistance are the enzymes to the families TEM, SHV and CTX-M. e principal aim of this study was to detect - ß-lactamase genes blaTEM, blaSHV and blaCTX-M in community strains of ESBL-producing Escherichia coli isolated from urine cultures of patients attended in the Laboratorio Clínico Popular of the Universidad de San Carlos de Guatemala in 2016. At least, one of the genes was detected in 90% of the 79 isolates and in 53.2% of the isolates the three genes were detected. e frequency was 57% for blaCTX-M, 84% for blaSHV and 85% for blaTEM. e detection of the genes coding for TEM-1, SHV-11, CTX-M15 and CTX-M55 represent the first molecular characterization of ESBL-producing E. coli isolates in Guatemala and it is important to understand the spread of these strains at the community environment. e ESBL-producing E. coli isolates showed high resistance to ciprofloxacin and trimethoprim sulfamethoxazole (78%) and low resistance levels for fosfomycin (2.5%) and nitrofurantoin (7.6%). e 11.39% of the strains showed resistance to a group of non-beta-lactam antibiotics. It is important to establish an active surveillance for these antibiotics in community strains because they are the first line treatment for strains producing ESBL

Perfil de sensibilidad de Escherichia coli aislados de infecciones del tracto urinario de pacientes del Hospital Regional de Villarrica en el periodo de julio 2013 a agosto 2015 / Sensitivity profile of Escherichia coli isolated from urinary tract infections of patients of the Regional Hospital of Villarrica from July 2013 to August 2015

Introducción: El uso inapropiado de los antimicrobianos está conduciendo a la disminución de la sensibilidad antimicrobiana de microorganismos que producen enfermedades infecciosas. El uso clínico de los antimicrobianos ha sido paralelo al surgimiento de bacterias resistentes a su acción. Materiales y Métodos: Se realizó un estudio observacional, descriptivo, retrospectivo de corte transversal, con muestreo no probabilístico de casos consecutivos. La selección de antibióticos incluyó solo aquellos que tienen actividad frente a bacilos gram negativos y para la interpretación de los diámetros de los halos de inhibición se tomaron en cuenta los estándares de la Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI versión 2015). Resultados: La ampicilina presentó una resistencia del 100%, en cambio la ciprofloxacina presentó una sensibilidad del 73%, la amikacina del 100% y la gentamicina del 82%. La familia de los carbapenemicos presentó una sensibilidad del 100%. Dentro del grupo de los nitrofuranos se constató una sensibilidad del 96%. El trimetoprim/ sulfametoxazol, presentó una sensibilidad del 57%. Se determinó la presencia de Beta Lactamasa de Espectro Extendido (BLEE) en 13% de las cepas de Escherichia coli estudiadas. Conclusiones: La gentamicina, la nitrofurantoína y los carbapenemes presentaron una elevada sensibilidad, por lo que en presencia de cepas con BLEE serían opciones factibles acompañados siempre de la evaluación del perfil renal y clasificando la ITU como complicada o no.

Introduction: The inappropriate use of antimicrobials is leading to a decrease in the antimicrobial sensitivity of microorganisms that cause infectious diseases. The clinical use of antimicrobials has been parallel to the emergence of bacteria resistant to its action. Materials and methods: The sensitivity profile of Escherichia coli isolated from patients with urinary tract infections (UTI) concurrent to the Regional Hospital of Villarrica in the period from 2013 to 2015 was determined. Results: Ampicillin showed a resistance of 100%, ciprofloxacin showed a sensitivity of 73%. Amikacin showed a sensitivity of 100% and gentamicin 82%. The family of carbapenem showed a sensitivity of 100%. Within the group of nitrofurans a sensitivity of 96% was found. Trimethoprim / sulfamethoxazole had a sensitivity of 57%. The presence of Extended Spectrum Beta Lactamase (ESBL) was determined in 13% of the strains of Escherichia coli studied. Conclusions: Gentamicin, nitrofurantoin and carbapenem have a high sensitivity, so in the presence of strains with ESBL they would be feasible options always accompanied by the evaluation of the renal profile and classifying the UTI as complicated or not.

Estudio teórico de compuestos derivados de cefalosporinas con potencial actividad inhibitoria frente a proteína de unión a penicilina (PBP) y resistencia a enzimas betalactamasa de espectro extendido (BLEE) producidas por Escherichia coli / Theoretical study of compounds derived from cephalosporins with inhibitory activity potential front to penicillin binding proteins (PBP) and resistance to Extended spectrum Beta-lactamase (ESBL) produced by Escherichia coli

RESUMEN Se han utilizado herramientas computacionales para proponer moléculas derivadas de cefalosporinas con potencial actividad antibacteriana, frente a cepas de Escherichia Coli, con mayor afinidad como inhibidores de enzimas de unión a penicilinas y que a su vez disminuyan o no tengan afinidad por betalactamasas de espectro extendido. Se diseñaron 20 moléculas con base en la estructura molecular de la cefalosporina, las estructuras fueron optimizadas utilizando la teoría del funcional de la densidad, se calcularon descriptores moleculares de reactividad, de forma paralela se sometieron a acoplamiento molecular con las enzimas antes mencionadas. Las moléculas presentaron valores de energía de unión negativos, doce moléculas mostraron una orientación e interacciones favorables en el sitio activo de la enzima de unión a penicilinas y trece moléculas presentaron menor afinidad que el ligando nativo (cefotaxima) por la betalactamasa. Tres moléculas pueden considerarse como potenciales inhibidores de enzimas de unión a penicilinas resistentes y betalactamasas.

SUMMARY Computational tools have been used to propose molecules derived from cephalosporins with potential antibacterial activity, against strains of Escherichia Coli, with higher affinity as inhibitors of penicillin-binding enzymes and which in turn decrease or do not have affinity for extended-spectrum beta-lactamases. 20 molecules were designed based on the molecular structure of the cephalosporin, the structures were optimized using the density functional theory, molecular descriptors of reactivity were calculated, and in parallel form they were subjected to molecular docking with the enzymes mentioned above. The molecules showed negative binding energy values, 12 molecules showed an orientation and favorable interactions in the active site of the penicillin binding enzyme and thirteen molecules had lower affinity than the native ligand (Cefotaxime) for betalactamase. Three molecules can be considered as potential inhibitors of binding enzymes to resistant penicillins and betalactamases.

Patrón sensibilidad/resistencia en los urocultivos de pacientes con I.T.U. que consultan a urgencias de adultos, Hospital de San José entre enero de 2014 y diciembre de 2014 / Pattern Sensitivity/Resistance in the Urocultives of Patients with U.T.I. who Consult Adult Urgencies, San Jose Hospital between January 2014 and December 2014

Introducción: La infección del tracto urinario (ITU) es un motivo de consulta frecuente en urgencias, siendo necesario el tratamiento antibiótico empírico antes de obtener un urocultivo. Objetivo Determinar el patrón de sensibilidad/resistencia de los gérmenes aislados en los urocultivos de pacientes que ingresan por urgencias de adultos con sintomatología sugestiva de ITU. Métodos Se realizó un estudio observacional, descriptivo de corte transversal, recolectando los datos de los urocultivos de pacientes con diagnóstico de ITU que asistieron por urgencias adultos, y cumplieron los criterios de inclusión en el año 2014. Resultados Se analizaron 133 pacientes (133 urocultivos), 50,4% mujeres, edad promedio de 64,1 años (DE 19,1). Se encontró una frecuencia mayor de ITU alta (54,9%), e ITU no complicada (54,1%), la mayoría de origen en la comunidad (95,5%). El germen más frecuentemente aislado fue E. coli (56,4%), seguido por Klebsiella oxytoca (7,1%). La resistencia de E. coli fue del 55,7% para ampicilina sulbactam, 58,2% para nitrofurantoina, 40% para quinolonas y 32% para cefazolina. En pacientes con factores de riesgo urológico se encontró una resistencia entre el 40% al 50%. Se evidenció patrón BLEA (12,9%), AMPc (20%) y KPC (1,4%). Conclusión Los uropatógenos han aumentado de forma significativa su resistencia a las diferentes familias de antibióticos, entre ellas las cefalosporinas y las quinolonas, confirmando que medicamentos como ampicilina sulbactam, nitrofurantoina, y ciprofloxacina no están indicados en el manejo empírico de ITU en nuestra institución, especialmente al presentar factores de riesgo urológicos.

Introduction Urinary tract infection (UTI) is a frequent cause for assistance to the emergency services, in most cases is necessary initiate empirical antimicrobial management while obtaining the result of the uroculture. Therefore, it is vital to know the pattern of sensitivity/resistance of the most frequent uropathogens and thus offer the best initial treatment. Objective To determine the pattern of sensitivity / resistance of isolated germs in the urine cultures of adults patients admitted to the emergency room with UTI suggestive symptoms. Methods An observational, descriptive, cross-sectional study was conducted, collecting urine culture data from patients diagnosed with UTI who were attended in adult emergencies in 2014. Results A total of 133 patients were analyzed (133 urine cultures), 50.4% were women, with average age of 64.1 years (SD 19.1). Higher frequency of high urinary tract infection was found (54.9%), and uncomplicated UTI (54.1%), most UTI originated in the community (95.5%). The most frequently isolated germ was E. coli (56.4%), followed by Klebsiella oxytoca (7.1%). The resistance of E. coli was 55.7% for ampicillin sulbactam, 58.2% for nitrofurantoin, 40% for quinolones and 32% for cefazolin. In patients with urological risk factors, resistance was found between 40% and 50%. BLEA pattern (12.9%), cAMP (20%) and KPC (1.4%) were evidenced. Conclusion Uropathogens have significantly increased their resistance to different families of antibiotics, including cephalosporins and quinolones, confirming that drugs such as ampicillin sulbactam, nitrofurantoin, and ciprofloxacin are not indicated in the empirical management of UTI in our institution, especially with the presence of urological risk factors.

Carbapenem Resistance in Gram-negative Bacteria in South-western Nigeria: The Role of Extended-spectrum lactamase CTX-M-15 / Resistencia al carbapenem en las bacterias gramnegativas en Nigeria Suroccidental: papel de la betalactamasa de espectro extendido tipo CTX-M-15

ABSTRACT Objective: To determine the role of extended-spectrum β-lactamases in carbapenem-resistant Gram-negative bacteria from south-western Nigeria. Methods: Twenty-seven carbapenem-resistant isolates that were found to be non-carbapenemase producers (15 Escherichia coli, 9 Klebsiella pneumoniae and 3 Pseudomonas aeruginosa) were further studied. These isolates were subjected to analysis including phenotypic and genotypic detection of various β-lactamases, efflux activity, outer membrane protein, plasmids replicon typing, detection of transferable genes and resistances and typing using random amplified polymorphic DNA tests. Results: No isolates demonstrated de-repression of efflux, but all showed either complete loss or reduced production of outer membrane proteins. Transconjugants from these strains contained various genes including plasmid-mediated quinolone resistance and extended-spectrum beta-lactamases. All the transconjugants carried the blaCTX-M-15 gene. The transconjugants had varying minimum inhibitory concentrations of carbapenems ranging from 0.03 μg/ml to 8 μg/ml. Varying resistances to other antimicrobial agents were also transferred with the plasmids. The donor isolates were not clonally related by molecular typing. Conclusion: Resistance to carbapenem antibiotics in this sample was not mediated only by carbapenemases but also by production of extended-spectrum β-lactamases (largely CTX-M-15), accompanied by protein loss. This was an important mechanism underpinning carbapenem resistance in these clinical isolates of various species.

RESUMEN Objetivo: Determinar el papel de las betalactamasas de espectro extendido en la resistencia al carbapenem en las bacterias gramnegativas en Nigeria. Métodos: Veintisiete aislados resistentes al carbapenem que fueron hallados productores de no carbapenemasas (15 Escherichia coli, 9 Klebsiella pneumoniae, y 3 Pseudomonas aeruginosa) fueron estudiados con mayor profundidad. Estos aislados fueron sometidos a análisis incluyendo la detección fenotípica y genotípica de varias betalactamasas, la actividad de eflujo, las porinas de la membrana externa, la tipificación del replicón plasmídico, la detección de genes transferibles y resistencias y tipificación usando pruebas de ADN polimórficas amplificadas aleatorias. Resultados: Ninguno de los aislamientos mostró desrepresión de eflujo, pero todos demostraron la pérdida completa o la producción reducida de porinas externas de la membrana. Los transconjugantes de estas cepas contenían varios genes incluyendo resistencia a la quinolona mediada por plásmidos y betalactamasas de espectro extendido. Todos los transconjugantes portaban el gen blaCTX-M-15. Los transconjugantes tenían diversas concentraciones inhibitorias mínimas de carbapenemas que oscilaban entre 0.03 μg/ml y 8 μg/ml. Varias resistencias a otros agentes antimicrobianos fueron también transferidas con los plásmidos. Los aislamientos del donante no estuvieron relacionados clonalmente por tipificación molecular. Conclusión: La resistencia al antibiótico carbapenem en esta muestra no fue mediada solamente por las carbapenemasas, sino también por la producción de betalactamasas de espectro extendido (en gran parte CTX-M-15), acompañado por pérdida de porina. Éste era un mecanismo importante que sustentaba la resistencia al carbapenem en estos aislados clínicos de varias especies.

Características y factores de riesgo de la infección de vías urinarias con cultivo positivo para betalactamasas de espectro extendido en adultos atendidos en urgencias en el Hospital Militar Central / Clinical characteristics and risk factors for urinary tract infection with extended spectrum betalactamase infections in the emergency service of the Central Military Hospital

Objetivo: El objetivo del estudio fue describir los factores de riesgo de los pacientes adultos con infección de vías urinarias (IVU) por enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en la población usuaria del Hospital Militar Central (HMC) los años 2012 y 2014. Se analizaron factores de riesgo como hospitalización previa, residente en unidad de cuidado crónico, uso previo de antibióticos, uso previo de esteroides, instrumentación del tracto urinario y usuario de sonda vesical. Materiales y métodos: Se realizó un estudio de casos y controles, retrospectivo, la fuente de información fueron las historias clínicas de los pacientes adultos mayores de 18 años de edad, que consultaron al servicio de urgencias del HMC, con diagnostico de IVU por una enterobacteria productora de BLEE. Se establecieron las características de la muestra y se determinó cuales fueron los factores de riesgo asociados al desarrollo de la infección por gérmenes productores de BLEE en la muestra seleccionada. Resultados: De los 1986 aislamientos que cumplían los criterios de selección, 14% correspondían a microorganismos productores de BLEE. De los seis factores de riesgo estudiados, tres presentaron una diferencia estadísticamente significativa: la hospitalización previa, el uso previo de antibióticos y la instrumentación del tracto urinario. De los factores de riesgo identificados, se realizó un análisis multivariado donde se mantuvieron como factores de riesgo significativos el uso previo de antibióticos y la instrumentación del tracto urinario que aumentan el riesgo de IVU por gérmenes productores de BLEE en 1,9 y 3,18 veces respectivamente. Conclusiones: Si bien los otros factores de riesgo descritos no alcanzaron una diferencia estadísticamente significativa, se deben realizar estudios prospectivos para poder evaluar su asociación con el desarrollo de infecciones por gérmenes resistentes y así desarrollar una escala de riesgo que permita al personal de urgencias administrar antibioticoterapia dirigida para este subgrupo poblacional.

Objectives: The objective of the study was to describe the risk factors of adult patients with urinary tract infection (UTI) with extended spectrum beta-lactamase producing bacteria (ESBL) in the population of the Hospital Militar Central (HMC) in 2012 and 2014. Risk factors such as previous hospitalization, chronic care unit resident, previous use of antibiotics, previous use of steroids, urinary tract instrumentation and bladder catheter were analyzed. Material and methods: We conducted a retrospective case-control study, the source of information were the medical records of adult patients older than 18 years of age, who consulted the emergency department of the HMC, diagnosed with UTI by a bacterium carrying ESBL. The characteristics of the sample were established and the risk factors associated with the development of infection by ESBL-producing bacteria in the selected sample were determined. Results: Of the 1986 isolates that fulfilled the selection criteria, 14% reported microorganisms producing ESBL. Of the six risk factors studied, three presented a statistically significant difference: previous hospitalization, previous use of antibiotics and urinary tract instrumentation. Of the risk factors identified, a multivariate analysis was performed in which the previous use of antibiotics and urinary tract instrumentation were maintained as significant risk factors that increase the risk of UTI by ESBL-producing bacterias in 1,9 and 3,18 times respectively. Conclusions: Although the other risk factors described did not reach a statistically significant difference, prospective studies should be performed to assess their association with the development of resistant germ infections and to develop a risk scale that allows emergency personnel to administer targeted antibiotic therapy to this population subgroup.

Evaluación de susceptibilidad y respuesta al tratamiento con piperacilina/tazobactam en pacientes con infecciones por Escherichia coli productoras de β -lactamasas de espectro extendido (BLEE) CTX-M / Evaluation of susceptibility and response to therapy with piperacillin-tazobactam in patients with infections caused by Escherichia coli with extended-spectrum β -lactamase (ESBL) CTX-M

Resumen Introducción: En las infecciones por enterobacterias productoras de β-lactamasas de espectro extendido (BLEE), los β-lactámicos preferidos para tratamiento son los carbapenémicos. Sin embargo, estudios clínicos muestran eficacia de piperacilina/tazobactam en ciertas infecciones por Escherichia coli productoras de BLEE. Objetivo: Determinar la cura clínica y microbiológica con piperacilina/tazobactam en pacientes con infecciones por E. coli productoras de BLEE, tipo CTX-M. Materiales/Métodos: Estudio descriptivo, retrospectivo, con adultos internados en un hospital universitario. Incluimos infecciones del tracto urinario (ITU), intra-abdominales (IIA) e infecciones de tejidos blandos (ITB). Resultados: Estudiamos 40 pacientes, donde 65% correspondían a ITU, 25% IIA y 10 % ITB. La cura clínica global se logró en 89,4%, con mejores resultados en las ITU (100%), seguidas de ITB (80%) e IIA (70%). El 85% de las cepas tenía concentraciones inhibitorias mínimas (CIM) ≤ 8 μg/mL y 70% con CIM ≤ 4 μg/mL. La tasa de fracaso fue mayor en las infecciones con inóculos altos intraabdominales. La BLEE del tipo CTX-M-15 se encontró en 62,5%. Conclusiones: Piperacilina/tazobactam logró cura clínica y microbiológica, en pacientes con infecciones por E. coli productoras de BLEE susceptibles, especialmente en ITU e IPB y en menor medida en IIA.

Background: Carbapenems are the preferred β-lactamics for treatment for infections caused by enterobacteria producing extended-spectrum β-lactamases (ESBL); however, clinical studies show effectiveness of piperacillin/tazobactam in certain infections by Escherichia coli ESBL producers. Aim: To determine the clinical and micro-biological cure with piperacillin/tazobactam in patients with infections caused by E. coli ESBL producers, CTXM type. Methods: Retrospective descriptive study with adults hospitalized in a university hospital. We included urinary tract infections (UTI), intra-abdominal infections (IAI), soft tissue infections (STI) and/or bacteremia. Results: We studied 40 patients, where 65% corresponded to UTI, 25% to IAI and 10% were STI. The overall clinical cure was achieved in 89.4%, with the best results in the ITU (100%), followed by STI (80%) and 70% in IAI. The 85% of the strains had minimum inhibitory concentrations (MIC) ≤8 μg/ml and 70% with MIC ≤4 μg/mL, however the rate of failure were high in intra-abdominal infections with high inocula or not controlled; CTX-M-15 was found in the 62.5%. Conclusions: Piperacillin/tazobactam was efficient to obtain clinical and microbiological cure in patients with infections caused by ESBL producers but susceptible E. coli, especially in UTI and STI and to a lesser extent in IAI.

Caracterización molecular y patrón de susceptibilidad antimicrobiana de Escherichia coli productora de β -lactamasas de espectro extendido en infección del tracto urinario adquirida en la comunidad / Molecular characterization and antimicrobial susceptibility pattern of extended-spectrum β -lactamase-producing Escherichia coli as cause of community acquired urinary tract infection

Resumen Introducción Las infecciones del tracto urinario adquiridas en la comunidad (ITUac) causadas por cepas de Escherichia coli productoras de β-lactamasas de espectro extendido (BLEE), principalmente por cepas que contienen el gen blaCTX-M-15, es un fenómeno creciente a nivel mundial. Objetivo Determinar el patrón de susceptibilidad a antimicrobianos de cepas de E. coli productoras de BLEE causantes de ITUac y conocer su patrón molecular. Materiales y Métodos Se realizó un estudio descriptivo en Oaxaca, México, donde se incluyeron 288 cepas de E. coli aisladas de pacientes adultos con posible ITUac. Para obtener los patrones de susceptibilidad antimicrobiana se siguieron los criterios del CLSI y para obtener el análisis molecular se utilizó la técnica de RPC. Resultados Del total de cepas de E. coli aisladas, 31,3% fueron productoras de BLEE, presentando una menor susceptibilidad a antimicrobianos que las cepas no productoras de estas enzimas. El 95,6% de las cepas BLEE estudiadas fueron portadoras del gen blaCTX-M. Conclusiones Un tercio de las ITUac causadas por E. coli en nuestra población fueron causadas por cepas BLEE, mostrando un alto nivel de resistencia a los antimicrobianos comúnmente utilizados en su tratamiento y disminuyendo las opciones terapéuticas para tratamientos empíricos en esta población.

Background Community acquired urinary tract infections (CaUTI) caused by strains of extended-spectrum β-lactamases (ESBL) - producing Escherichia coli, mainly by strains carrying the blaCTX-M-15 gene, is a growing phenomenon worldwide. Aim To determine the antibiotic susceptibility pattern of ESBL-producing E. coli as cause of CaUTI and to identify their molecular pattern. Methods A descriptive study was performed in the city of Oaxaca, Mexico, from where 288 strains of CaUTI-producing strains of E. coli in adults with possible UTI were isolated. The CLSI criteria was followed to determine the antimicrobial susceptibility patterns, and their molecular characterization was performed by using PCR. Results 31.3% of E. coli strains isolated in our population were ESBL producers, which presented higher levels of antibiotic resistance than those of non-producers of these enzymes. 95.6% of the studied strains were carriers of the blaCTX-M gene. Conclusions One-third of the Ca-UTI caused by E. coli in our population are caused by ESBL-producing strains, which present high levels of resistance to the antibiotics widely used in our community. This situation considerably decreases the number of antibiotics available for an empiric treatment against these infections.

Detección de Betalactamasas de espectro extendido en Enterobacteriaceae en un Centro de Salud de Maracaibo, Venezuela / Detection of Extended-Spectrum ß-lactamase-producing Enterobacteriaceae in a Healthcare Center from Maracaibo city, Venezuela

La alta incidencia de las enfermedades infecciosas y el aumento de la resistencia a los antibióticos se han convertido en la actualidad en un problema de salud pública, siendo las enterobacterias productoras de Betalactamasas de Espectro Extendido (BLEE) un ejemplo de este fenómeno. En el presente estudio se determinó la producción de BLEE en aislados clínicos de la familia Enterobacteriaceae procedentes de una institución de salud de la ciudad de Maracaibo, durante el periodo septiembre de 2014 a febrero de 2015. Para la detección de BLEE se utilizó como método preliminar el de Kirby-Baüer, siguiendo los lineamientos del CLSI; adicionalmente se utilizó como prueba confirmatoria fenotípica el método de sinergia del doble disco y como prueba confirmatoria genotípica la detección de los genes blaCTX-M, blaTEM y blaSHV mediante PCR. Se analizaron 55 enterobacterias productoras de BLEE, distribuidas de la siguiente manera: Escherichia coli 56,36%, Klebsiella pneumoniae 21,82%, Enterobacter cloacae 7,27%, Proteus mirabilis y Serratia marcescens 5,45% para cada especie, por último, Salmonella spp. y Morganella morganii 1,82% respectivamente. En cuanto al tipo de BLEE detectado mediante PCR, se observó que el 83,63% de los aislados presentó el tipo TEM, seguido de CTX-M (23,63%) y SHV (21,81%), mientras que el 27,27% de los aislados produjo dos o tres BLEE de manera simultánea. Los resultados de este estudio confirman la alta diseminación de este mecanismo de resistencia entre las enterobacterias productoras de infecciones en nuestras instituciones públicas de salud, por lo que deben aplicarse medidas de control que permitan controlar y disminuir su incidencia.

The high incidence of the infectious diseases and the antimicrobial resistance arise represent a public health threat today. The extended-spectrum ß-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae are an example of this phenomenon. We determined the ESBL-production in Enterobacteriaceae isolates from a Healthcare Center in Maracaibo, during September 2014 to February 2015. The Kirby-Baüer method was perform to preliminary phenotypic detection of ESBL, according to CLSI guidelines. ESBL-production was confirmed by a double-disk synergy test according to the CLSI standards. To genotypic confirmation, the genes blaCTX-M, blaTEM and blaSHV were amplified by PCR. Fifty-five (n=55) strains were analyzed distributed in Escherichia coli (56.36 %), Klebsiella pneumoniae (21.82 %), Enterobacter cloacae (7.27 %), Proteus mirabilis and Serratia marcescens (5.45 % each one), Salmonella spp. and Morganella morganii (1.82 % each one). The major encoded ESBL was the blaTEM gene (83.63 %); followed by 23.63% of the blaCTX-M gene, and 21.81 % encoded the blaSHV gene. 27.27 % of the isolates produced two or three ESBL simultaneously. These results confirmed the high spread of this resistant mechanism among Enterobacteriaceae-producing infections in our public health institutions, therefore control measures should applied to control and reduce its incidence.