Distribución de genotipos de virus papiloma humano de alto riesgo en mujeres y hombres atendidos en una red asistencial privada en la Región Metropolitana, Chile / Distribution of high-risk human papillomavirus genotypes in women and men attended in a private healthcare network in the Metropolitan Region, Chile

Introducción: La infección persistente por genotipos de virus papiloma humano de alto riesgo (VPH-AR) es la principal causa del cáncer cérvico-uterino en todo el mundo. Los genotipos 16 y 18 están asociados a la progresión hacia el cáncer de cuello uterino; sin embargo, otros genotipos también presentan alto riesgo oncogénico. Existe escasa evidencia respecto a la distribución de genotipos VPH-AR en la población nacional, siendo un tema que debiese ser abordado en el contexto de un creciente aumento de la inmigración e implementación del programa de inmunización en Chile desde 2015. Objetivo: Dar a conocer la distribución de genotipos de VPH-AR detectados en pacientes de ambos sexos, atendidos en la red de atención privada de Clínica Dávila de Santiago, entre los años 2014 y 2021. Metodología: Se estudiaron muestras genitales y anales provenientes de 3.642 pacientes, incluyendo ambos sexos. La genotipificación fue realizada mediante reacción de la polimerasa en cadena (RPC) en tiempo real (HPV AnyplexTM II HPV28 detection, Seegene, Korea. Resultados: La distribución global de genotipos en mujeres (porcentaje) fue: 16 (14,34%) - 31 (6,20%) - 39 (5,94%) - 58 (5,94%) - 51 (5,68%) - 53 (5,64%) - 52 (5,30%) - 56 (5,27%) - 68 (5,19%) - 66 (4,97% - 18 (3,36%) - 59 (3,29%) - 73 (2,80%) - 35 (2,54%) - 45 (2,13%) - 33 (1,53%) - 82 (1,38%) - 26 (0,49%) y 69 (0,41%). En hombres fue: 16 (8,52%) - 58 (4,39%) - 51 (8,44%) - 26 (0,42%) - 18 (3,21%) - 52 (4,47%) - 39 (5,40%) - 53 (4,56%) - 33 (1,69%) - 35 (2,03%), 73 (2,19%) - 69 (0,59%) - 45 (2,11%) - 59 (4,22%) - 68 (3,04%) - 66 (5,06%) - 31 (4,64%) - 56 (4,81%) y 82 (1,10%). Conclusiones: La distribución de los genotipos de VPH fue concordante con estudios previos nacionales. Se observó una tendencia a la reducción del genotipo 16 en el tiempo, lo cual podría relacionarse a la vacunación, implementada en los últimos años en Chile. Destaca que otros genotipos de VPH-AR tuvieron una alta frecuencia en la población estudiada por lo que sería recomendable evaluar la pesquisa ampliada de genotipos de VPH-AR para valorar el riesgo oncogénico, con fines diagnósticos y terapéuticos.

Background: Persistent infection by high-risk human papillomavirus (HR-HPV) genotypes is the main cause of cervical cancer worldwide. Genotypes 16 and 18 are associated with progression to cervical cancer, however other genotypes also present high oncogenic risk. There is little evidence regarding the distribution of HR-HPV genotypes in the national population, being an issue that should be addressed in the context of a growing increase in immigration and implementation of the immunization program in Chile since 2015. Aim: To show the distribution of HR-HPV genotypes detected in women and men, attended at the private care network of Clinica Davila, Santiago City, between 2014 and 2021. Methods: Genital and anal samples from 3,642 patients were studied, including both sexes. Genotyping was performed by real-time polymerase chain reaction (PCR) (HPV AnyplexTM II HPV28 detection, Seegene, Korea). Results: The global distribution of genotypes in women (percentage) was: 16 (14.34%) - 31 (6.20%) - 39 (5.94%) - 58 (5.94%) - 51 (5.68%) - 53 (5.64%) - 52 (5.30%) - 56 (5.27%) - 68 (5.19%) - 66 (4.97%) - 18 (3.36%) - 59 (3.29%) - 73 (2.80%) - 35 (2.54%) - 45 (2.13%) - 33 (1.53%) - 82 (1.38%) - 26 (0.49%) and 69 (0.41%). In men was: 16 (8.52%) - 58 (4.39%) - 51 (8.44%) - 26 (0.42%) - 18 (3.21%) - 52 (4.47%) - 39 (5.40%) - 53 (4.56%), 33 (1.69%) - 35 (2.03%) - 73 (2.19%) - 69 (0.59%) - 45 (2.11%) - 59 (4.22%) - 68 (3.04%) - 66 (5.06%) - 31 (4.64%) - 56 (4.81%) and 82 (1.10%). Conclusions: The distribution of HPV genotypes was consistent with previous national studies. A tendency to reduce genotype 16 over the years was observed, which could be related to the vaccination, implemented in recent years in Chile. It is remarkable that other HR-HPV genotypes had a high frequency in the population studied, so it would be advisable to evaluate an expanded screening for HR-HPV genotypes to assess the oncogenic risk, for diagnostic and therapeutic purposes.

Detección e integración del virus del papiloma humano de alto riesgo en lesiones pre-neoplásicas en mujeres del sur de Chile: un estudio transversal / High-risk human papillomavirus detection and integration in preneoplastic lesions among women in Southern Chile: a cross-sectional study

INTRODUCCIÓN: El virus del papiloma humano de alto riesgo (VPH-AR) es responsable del cáncer de cuello uterino y sus lesiones preneoplásicas. Los genotipos VPH16 y VPH18 son los más frecuentes en este cáncer. La integración del VPH-AR en el genoma de la célula hospedera es crucial en la carcinogénesis cervical, pero la etapa en que ocurre en la población chilena es incierta. OBJETIVO: Evaluar la integración de VPH16 y VPH18 en lesiones pre-neoplásicas de cuello uterino. MÉTODOS: Se analizaron 108 muestras de raspados cervicales. El VPH se genotipificó mediante reacción de polimerasa en cadena (RPC) e hibridación no radiactiva. La integración de VPH16 y VPH18 se determinó por presencia del gen E2 mediante RPC. RESULTADOS: VPH16 y VPH18 se detectaron en 36,1% y 12,0% de las muestras, respectivamente. El VPH16 se integró en 23,1% de los casos de VPH16, mientras que VPH18 se integró en 100% de las muestras positivas para este genotipo. CONCLUSIONES: La integración VPH-AR es un evento temprano en la carcinogénesis cervical que ocurre en casi la mitad de las lesiones pre-neoplásicas y es más frecuente en VPH18 que en VPH16. La evaluación de la integración VPH-AR puede ser una herramienta útil para detectar el virus en la población chilena.

BACKGROUND: High-risk Human Papillomaviruses (HR-HPVs) are the etiological agents of cervical cancer and its preneoplastic lesions. HPV16 and 18 are the most frequent HR-HPV genotypes detected in cervical cancer. HR-HPV genome integration into the host cell is an important event in the carcinogenic process. However, it remains uncertain which stage of cervical carcinogenesis HPV16 and 18 integration occurs in the Chilean population. AIM: The goal of this study was to evaluate HPV16 and HPV18 integration in preneoplastic lesions of the cervix. METHODS: DNA was extracted from 108 cervical scrape samples with preneoplastic lesions. HPV was genotyped using PCR and non-radioactive hybridization. The integration status of HPV16 and HPV 18 was determined by evaluating the E2 gene presence through PCR. RESULTS: HPV16 and HPV18 tested positive in 36.1% and 12.0% of samples, respectively. HPV16 was found integrated in 23.1% of HPV 16 cases, while HPV 18 in 100% of samples positive for this viral genotype. CONCLUSIONS: HR-HPV integration is an early event in cervical carcinogenesis, occurring in nearly half of preneoplastic lesions and being more frequent in HPV18 than in HPV16. The evaluation of HR-HPV integration can be utilized as a complementary tool for detecting HPV in the Chilean population.

Phylogenetic relationship between rabies virus (Lyssavirus rabies) variants from two different species / Relações filogenéticas do vírus da raiva (Lyssavirus rabies) em duas diferentes espécies / Relaciones filogenéticas del virus de la rabia (Lyssavirus rabies) en dos especies diferentes

Rabies is a fatal zoonotic disease that affects several mammals. Hematophagous bats are recognized hosts of the rabies virus, and their main food source is the blood of other mammals, particularly cattle. During feeding, bats transmit the virus to cattle, which are victims of the disease, contributing to economic losses and increasing the risk of infection for humans. Based on this affinity in the rabies cycle between bats and cattle, the objective of this study was to analyze the phylogenetic relationships of rabies virus samples in cattle and bats. The G gene of the rabies virus was chosen for this study because it is directly related to the infection process. Nucleotide sequences of the viral G gene were selected from GenBank for samples obtained from infected cattle and bats. Maximum parsimony analyses were conducted using the Molecular Evolutionary Genetics Analysis software. The Maxima Parsimony tree indicated a phylogenetic relationship between the G genes of both hosts, indicating that the virus evolved from bats to cattle. Analysis of parsimoniously informative sites revealed that the viral G gene carried specific mutations in each host. Knowledge of the evolutionary relationships between the rabies virus and its hosts is critical for identifying potential new hosts and the possible routes of infection for humans.

A Raiva é uma zoonose fatal que infecta várias espécies de mamíferos. Os morcegos hematófagos são reconhecidos como hospedeiros do vírus da Raiva e sua principal fonte de alimento é o sangue de outros mamíferos, especialmente os bovinos. Quando se alimentam, os morcegos transmitem o vírus para o bovino os quais são vítimas da doença, contribuindo para perdas econômicas e riscos de infecção para humanos. Baseado nesta afinidade do ciclo da Raiva entre morcegos e bovinos, o objetivo deste estudo foi analisar as relações filogenéticas de amostras do vírus da Raiva em ambos os hospedeiros, bovinos e morcegos. O gene G do vírus da Raiva foi escolhido para esta pesquisa porque ele está diretamente relacionado ao processo de infecção. Sequências de nucleotídeos do gene G viral foram selecionadas no GenBank a partir de amostras obtidas de bovinos e morcegos infectados. Análises de Máxima Parcimônia foram conduzidas utilizando o software Molecular Evolutionary Genetics Analysis. A árvore de Máxima Parcimônia indicou uma relação filogenética entre o gene G de ambos os hospedeiros, indicando que o vírus evoluiu dos morcegos para os bovinos. A análise dos sítios parcimoniosamente informativos revelou que o gene G viral apresentou mutações específicas em cada hospedeiro. O conhecimento sobre as relações evolutivas do vírus da Raiva e seus hospedeiros é crucial para identificar nos hospedeiros potenciais e novas rotas possíveis de infecção para humanos.

La rabia es una zoonosis fatal que infecta a varias especies de mamíferos. Los murciélagos hematófagos son reconocidos como huéspedes del virus de la rabia y su principal fuente de alimentación es la sangre de otros mamíferos, especialmente del ganado. Al alimentarse, los murciélagos transmiten el virus al ganado que es víctima de la enfermedad, contribuyendo a pérdidas económicas y riesgos de infección para los humanos. Basado en esta afinidad del ciclo de la rabia entre murciélagos y ganado, el objetivo de este estudio fue analizar las relaciones filogenéticas de las muestras de virus de la rabia tanto en huéspedes, ganado y murciélagos. El gen G del virus de la rabia fue elegido para esta investigación porque está directamente relacionado con el proceso de infección. Las secuencias de nucleótidos del gen G viral se seleccionaron en GenBank a partir de muestras obtenidas de bovinos y murciélagos infectados. Los análisis de parsimonia máxima se realizaron utilizando el software Molecular Evolutionary Genetics Analysis. El árbol de Máxima Parsimônia indicó una relación filogenética entre el gen G de ambos huéspedes, indicando que el virus evolucionó de murciélagos a bovinos. El análisis de los sitios parsimoniosamente informativos reveló que el gen G viral presentaba mutaciones específicas en cada huésped. El conocimiento sobre las relaciones evolutivas del virus de la rabia y sus huéspedes es crucial para identificar huéspedes potenciales y nuevas posibles rutas de infección para humanos.

Avanços no entendimento da patogenia da Covid-19: uma revisão / Advances in understanding Covid-19 pathogenesis: a review / Avances en la comprensión de la patogenia de la Covid-19: una revisión

Introdução: O SARS-CoV-2, causador da pandemia por Doença por Coronavirus 2019 (COVID-19) gerou desafios à saúde pública, principalmente pelo conhecimento escasso de sua patogênese, e de estratégias terapêuticas e preventivas eficazes. Diversas lacunas de conhecimento sobre a doença envolvem a contribuição de fatores de risco, as doenças concomitantes, os fatores genéticos e imunogenéticos, no direcionamento da resposta imune, bem como a hiperinflamação, a imunidade antiviral e os alelos dos antígenos leucocitários humanos (HLAs) dos pacientes, que estão relacionados ao desfecho da doença. Objetivo: Esta revisão integrativa objetivou aprofundar os conhecimentos sobre os mecanismos de imunidade relacionada aos fatores de risco, da hiperinflamação e da tempestade de citocinas decorrente da infecção por SARS-CoV-2, bem como os avanços de associação dos HLAs nos agravos da doença. Metodologia: A revisão integrativa foi realizada utilizando os descritores nas bases de dados PubMed, SCIELO, CINAHL, SCOPUS, Web of Science, MedNar, Portal periódicos CAPES e Open Journal System, sem limites de janela cronológica. Resultados: Os efeitos da pandemia e os esforços na busca do conhecimento sobre a patogênese da COVID-19 resultaram em avanço no combate da doença. Conseguiu-se relacionar fatores de risco como obesidade, hipertensão, diabetes, doenças renais crônicas, idade, gênero, e outras condições predisponentes ao agravo da doença. Sob o aspecto da patogênese, também houveram progressos no entendimento dos mecanismos celulares e humorais em resposta à doença, bem como conseguiu vincular a resposta da hiperinflamação e o perfil dos HLAs dos pacientes à evolução da doença ao óbito ou à convalescência. Conclusão: Os esforços científicos conjuntos e os avanços na compreensão dos mecanismos da doença conseguiram estabelecer estratégias de combate a COVID-19, resultando no fim da pandemia, porém ainda há avanços que devem ser alcançados para o combate das sequelas dos pacientes convalescentes e para minimização da COVID longa e seus prejuízos.

Introduction: SARS-CoV-2, which causes the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) pandemic, has generated challenges to public health, mainly due to the limited knowledge of its pathogenesis and effective therapeutic and preventive strategies. Several gaps in knowledge about the disease involve the contribution of risk factors, concomitant diseases, genetic and immunogenetic factors, in directing the immune response, as well as hyperinflammation, antiviral immunity and human leukocyte antigen (HLAs) alleles of patients, which are related to the outcome of the disease. Aim: This integrative review aimed to deepen knowledge about the mechanisms of immunity related to risk factors, hyperinflammation and the cytokine storm resulting from SARS-CoV-2 infection, as well as advances in the association of HLAs in diseases. Methodology: The integrative review was carried out using the descriptors in the databases PubMed, SCIELO, CINAHL, SCOPUS, Web of Science, MedNar, CAPES periodical portal and Open Journal System, without chronological window limits. Results: The effects of the pandemic and efforts to seek knowledge about the pathogenesis of COVID-19 resulted in progress in combating the disease. It was possible to relate risk factors such as obesity, hypertension, diabetes, chronic kidney disease, age, gender, and other conditions predisposing to the worsening of the disease. From the aspect of pathogenesis, progress has also been made in understanding the cellular and humoral mechanisms in response to the disease, as well as linking the hyperinflammation response and the patients' HLA profile to the progression of the disease to death or convalescence. Conclusion: Joint scientific efforts and advances in understanding the mechanisms of the disease managed to establish strategies to combat COVID-19, resulting in the end of the pandemic, but there are still advances that must be achieved to combat the sequelae of convalescent patients and to minimize of long COVID and its losses.

Introducción: El SARS-CoV-2, causante de la pandemia de la Enfermedad del Coronavirus 2019 (COVID-19), ha generado desafíos a la salud pública, principalmente por el limitado conocimiento de su patogénesis y estrategias terapéuticas y preventivas efectivas. Varios vacíos en el conocimiento sobre la enfermedad involucran la contribución de factores de riesgo, enfermedades concomitantes, factores genéticos e inmunogenéticos, en la dirección de la respuesta inmune, así como la hiperinflamación, la inmunidad antiviral y los alelos del antígeno leucocitario humano (HLA) de los pacientes, que están relacionados con el resultado de la enfermedad. Objetivo: Esta revisión integradora tuvo como objetivo profundizar el conocimiento sobre los mecanismos de inmunidad relacionados con los factores de riesgo, la hiperinflamación y la tormenta de citocinas resultante de la infección por SARS-CoV-2, así como los avances en la asociación de los HLA en las complicaciones de la enfermedad. Metodología: La revisión integradora se realizó utilizando los descriptores de las bases de datos PubMed, SCIELO, CINAHL, SCOPUS, Web of Science, MedNar, portal periódico CAPES y Open Journal System, sin límites de ventana cronológica. Resultados: Los efectos de la pandemia y los esfuerzos por buscar conocimiento sobre la patogénesis de la COVID-19 resultaron en avances en el combate de la enfermedad. Se logró relacionar factores de riesgo como obesidad, hipertensión, diabetes, enfermedad renal crónica, edad, sexo y otras condiciones que predisponen al agravamiento de la enfermedad. Desde el punto de vista de la patogénesis, también se ha avanzado en la comprensión de los mecanismos celulares y humorales de respuesta a la enfermedad, así como en la vinculación de la respuesta de hiperinflamación y el perfil HLA de los pacientes con la progresión de la enfermedad hasta la muerte o la convalecencia. Conclusión: Los esfuerzos científicos conjuntos y los avances en la comprensión de los mecanismos de la enfermedad lograron establecer estrategias para combatir el COVID-19, teniendo como resultado el fin de la pandemia, pero aún quedan avances que se deben lograr para combatir las secuelas de los pacientes convalecientes y para Minimizar el COVID prolongado y sus pérdidas.

Headache as the most prevalent post-vaccination adverse event after Covid-19 vaccination / Dor de cabeça como evento adverso pós-vacinação mais prevalente após a vacinação contra Covid-19

BACKGROUND: In 2020, the first vaccines were approved, according to the WHO. However, speculations arose regarding their efficacy and post-vaccination adverse events (AEFV). OBJECTIVE: To evaluate the prevalence of headache as AEFI from the SARSCoV-2 vaccine in Piauí, Brazil. METHODS: This is a quantitative, observational, cross-sectional, and prevalence study. Data were provided by the Post-Vaccination Adverse Event Information System (SI-AEFV), from reported cases from January to September 2021. Data were analyzed, and the research was approved by the UFPI Research Ethics Committee. RESULTS: A total of 2,008 cases were analyzed. Headache was reported in 752 cases (27.99%) as an AEFV after vaccination against SARS-CoV-2. In most cases, patients were from Teresina (67.62%), of brown race/ethnicity (52.67%), female (79.00%), and the majority were not healthcare professionals (54.27%). The most common age of patients, with the original data, was 33 years. After data correction, the most common age was 28 years. The majority of these cases were not severe (96.44%), and the majority of cases were associated with the first dose of the Covid-19-Covishield-Oxford/AstraZeneca vaccine (43.18%).CONCLUSION: Thus, it is concluded from the partial analysis of the results that headache is the most common adverse event after vaccination against SARS-CoV-2. The profile of patients with the most notifications was brown women aged 30 to 40 years who received the first dose of the Covid-19-Covishield-Oxford/AstraZeneca vaccine. Regarding the severity of events, the vast majority were considered non-severe, and no deaths were mentioned, demonstrating the safety of immunobiologicals.

FUNDAMENTO: Em 2020, foram aprovadas as primeiras vacinas, segundo a OMS. No entanto, surgiram especulações quanto à sua eficácia e eventos adversos pós-vacinais (EAPV). OBJETIVO: Avaliar a prevalência de cefaleia como EAPV da vacina SARSCoV-2 no Piauí, Brasil. MÉTODOS: Trata-se de um estudo quantitativo, observacional, transversal e de prevalência. Os dados foram fornecidos pelo Sistema de Informação de Eventos Adversos Pós-Vacinação (SI-AEFV), dos casos notificados no período de janeiro a setembro de 2021. Os dados foram analisados ​​e a pesquisa foi aprovada pelo Comitê de Ética em Pesquisa da UFPI. RESULTADOS: Foram analisados ​​2.008 casos. Cefaleia foi relatada em 752 casos (27,99%) como EAPV após vacinação contra SARS-CoV-2. Na maioria dos casos, os pacientes eram procedentes de Teresina (67,62%), de raça/etnia parda (52,67%), do sexo feminino (79,00%) e a maioria não era profissional de saúde (54,27%). A idade mais comum dos pacientes, com os dados originais, era de 33 anos. Após correção dos dados, a idade mais comum foi 28 anos. A maioria desses casos não foi grave (96,44%), e a maioria dos casos esteve associada à primeira dose da vacina Covid-19-Covishield-Oxford/AstraZeneca (43,18%).CONCLUSÃO: Assim, conclui-se a partir da análise parcial dos resultados de que cefaleia é o evento adverso mais comum após vacinação contra SARS-CoV-2. O perfil dos pacientes com mais notificações foi de mulheres pardas com idade entre 30 e 40 anos que receberam a primeira dose da vacina Covid-19-Covishield-Oxford/AstraZeneca. Quanto à gravidade dos eventos, a grande maioria foi considerada não grave e não foram mencionados óbitos, demonstrando a segurança dos imunobiológicos.

Mpox: Aspectos epidemiológicos, imunopatogênicos e manejo pré e pós-infecção / Mpox: Epidemiological, immunopathogenic aspects and pre- and post-infection management

Mpoxou Varíola M é uma zoonose causada por vírus do gênero Orthopoxvirus, causadores também da varíola comum. É uma doença considerada rara e autolimitada, sendo endêmica em países africanos. Entretanto, no ano de 2022 ganhou destaque devido ao surto global que se iniciou, quando o mundo ainda se recuperava da pandemia da COVID-19. Dessa forma, por se tratar de uma doença emergente, a presente revisão visa pontuar aspectos gerais do que se sabe até o momento sobre a Mpox, desde sua imunopatogenia até as formas atuais de prevenção e cuidados pós-infecção

Mpox or Variola M is a zoonosis caused by viruses of the genus Orthopoxvirus, which also cause smallpox. It is a disease considered rare and self-limiting, being endemic in African countries. However, in 2022, it gained prominence due to the global outbreak that began when the world was still recovering from the COVID-19 pandemic. Thus, as it is an emerging disease, this review aims to point out general aspects of what is known so far about Mpox, from its immunopathogenesis to current forms of prevention and post-infection care

Manifestações orais e Covid-19: Revisão Sistemática da literatura / Oral Manifestations and Covid-19: Systematic literature review

A doença COVID-19, que se tornou uma pandemia em pouco espaço de tempo, apresenta uma ameaça grave para a saúde global. As condições bucais de pacientes com COVID-19 foram analisadas em vários estudos. Diante disso, observou-se que diversas manifestações bucais foram encontradas nesses pacientes. O objetivo deste trabalho foi realizar uma revisão de literatura sistemática sobre as manifestações bucais que podem estar associadas à doença COVID-19. A pesquisa foi realizada por meio de uma revisão sistemática nas bases de dados Bireme, PubMed e SciELO, no período de 30 de abril de 2021 a 11 de maio de 2023. A busca utilizou os descritores "COVID-19", "coronavirus" e "oral manifestations". Foram utilizados como critério de inclusão a presença do artigo completo disponível na íntegra e publicado nos anos de 2020 a 2023 e excluídos aqueles que não relatavam alguma manifestação da COVID-19 ou que não abordavam formas de tratamento. Foram incluídos 19 artigos. As informações foram compiladas de forma a compreender a importância de se investigar as manifestações orais em decorrência dessa doença, devido a sua importância internacional dadas às suas circunstâncias devastadoras. Concluiu-se que é notável a importância da anamnese e o exame intraoral para diagnosticar as manifestações orais nos pacientes sob suspeita ou confirmados com a COVID-19, e o diagnóstico precoce das alterações é fundamental para assegurar um suporte adequado ao paciente acometido. Mais estudos são necessários para comprovar a associação direta entre a COVID-19 e as manifestações orais relatadas.

COVID-19, which has become a pandemic in a short time, poses a serious threat to global health. The oral conditions of patients with COVID-19 have been analyzed in several studies. Therefore, it was observed that several manifestations were found in these patients. The objective of the work is to carry out a systematic literature review on the oral manifestations that may be associated with the disease COVID-19. The research was carried out through a systematic review in the databases Bireme, PubMed and SciELO, from April 30, 2021 o May 11, 2023. The search using the descriptors "COVID-19", "coronavirus" and "Oral manifestations". Inclusion criteria were the presence of the full article available in full and published in 2020 and 2023. Articles that did not report any manifestation of COVID-19 or those that did not address forms of treatment were excluded. 19 articles were included. The information was compiled in order to understand the importance of investigating oral manifestations as a result of this disease, due to its international importance given to its devastating entities. It was concluded that the importance of anamnesis and intraoral examination for the diagnosis of oral manifestations in patients suspected or confirmed with COVID-19 is remarkable, and the early diagnosis of alterations is essential to ensure adequate support for the affected patient. Further studies are needed to prove the direct association between COVID-19 and the reported oral manifestations.

Escala de Percepção de Risco sobre Covid-19/Isolamento Social: Propriedades Psicométricas / Escala de Percepción de Riesgo sobre Covid-19 y Aislamiento Social: Propiedades Psicométricas / Psychometric Properties of Risk Perception Scale about Covid-19 and Social Isolation (RPSCI)

Risk perception is a concept related to the decision-making process and allows people to perceive the hazards surrounding the context and choose the best preventive methods to avoid them. The COVID-19 pandemic was a remarkable era in which people had to adopt protective methods, such as social isolation, to reduce the possibility of being contaminated by the virus. This study covers the development, psychometric properties, and norms of a scale to assess Risk Perception regarding COVID-19 and Social Isolation. The analysis suggested good expert agreement regarding the adequacy of the scale content and items and factor analysis suggested two factors, called the emotional and cognitive domains. The composite reliability suggested the internal consistency of the scale and its factors. All the results of this study suggest that this scale presents evidence of construct validity, constituting a reliable instrument. This new instrument may be used to evaluate risk perception related to COVID-19 and Social Isolation.

La percepción del riesgo es un concepto relacionado con el proceso de toma de decisiones y permite a las personas percibir los peligros en el contexto y elegir los mejores métodos de prevención para evitarlos. La pandemia de COVID-19 es una era notable en la que las personas deben adoptar métodos, como el aislamiento social, para reducir la posibilidad de ser contaminados por el virus. Este estudio proporciona el desarrollo, las propiedades psicométricas y las normas de una escala para evaluar Percepción de Riesgo sobre el COVID-19 y el Aislamiento Social. El análisis sugirió un buen acuerdo de expertos sobre el ajuste del contenido y la escala de ítems y el análisis factorial apuntó dos factores denominados dominios emocional y cognitivo. La confiabilidad compuesta sugirió consistencia interna de la escala y sus factores. Todos los resultados de este estudio proponen que esta escala presenta evidencia de validez de constructo y es un instrumento confiable. Este nuevo instrumento podrá ser utilizado para evaluar la percepción de riesgo sobre el COVID-19 y el aislamiento social.

A percepção de risco é um conceito relacionado ao processo de tomada de decisão e permite que as pessoas percebam os perigos em torno do contexto e escolham os melhores métodos de prevenção para evitá-los. A pandemia do COVID-19 é uma era marcante em que as pessoas devem adotar métodos de proteção, como o isolamento social, para reduzir a possibilidade de serem contaminados pelo vírus. Este estudo fornece o desenvolvimento, as propriedades psicométricas e normas de uma escala para avaliar Percepção de Risco sobre COVID-19 e Isolamento Social. A análise sugeriu boa concordância dos especialistas sobre o ajuste de conteúdo e itens da escala, e a análise fatorial sugeriu dois fatores denominados domínios emocionais e cognitivos. A confiabilidade composta sugeriu a consistência interna da escala e seus fatores. Todos os resultados deste estudo sugerem que esta escala apresenta evidências de validade de construto, sendo um instrumento confiável. Este novo instrumento poderá ser utilizado para avaliar a percepção de risco sobre a COVID-19 e o Isolamento Social.

Virología molecular de la rabia: un enfoque clínico / Rabies molecular virology: a clinical approach

Introducción: La rabia es una enfermedad zoonótica asociada al virus RABV, el cual tiene características neurotrópicas. El virus se transmite por el contacto con saliva de animales infectados; la mordedura de un perro es la causa más común. Es un virus que causa la muerte de miles de personas cada año. Objetivo: Describir a profundidad los principios moleculares de la infección por rabia, así como su patogenia, diagnóstico y tratamiento. Métodos: Se realizó una búsqueda de bibliografía en PubMed, SciELO, Scopus, Researchgate; se consultaron 163 referencias y se seleccionaron 51 fuentes que contenían la información más relevante para cumplir con el objetivo del trabajo. Conclusión: Actualmente es posible entender de mejor manera los mecanismos de transmisión y propagación del virus en el organismo; existe nuevo conocimiento sobre los receptores involucrados, así como la función de estos en la replicación viral. Sin embargo, el objetivo de la erradicación de la rabia a corto plazo es complejo. La invasión de territorios selváticos vuelve a la rabia un posible patógeno reemergente; la vacunación de especies transmisoras es el medio ideal para conseguir el control de la enfermedad.

Introduction: Rabies is a zoonotic disease associated with the RABV virus, which has neurotropic characteristics. The virus is transmitted by contact with saliva from infected animals; a dog's bite is the most common cause. This virus causes the death of thousands of people every year. Objective: To describe in depth the molecular principles of rabies infection, as well as its pathogenesis, diagnosis and treatment. Methods: A literature search was conducted in PubMed, SciELO, Scopus, and Researchgate. A total of 163 references were consulted, and 51 sources containing the most relevant information were selected to fulfill the objective of the work. Conclusions: It is currently possible to better understand the mechanisms of transmission and spread of the virus in the organism; there is new knowledge about the receptors involved, as well as their function in viral replication. However, the goal of eradicating rabies in the short term is complex. The invasion of wild territories makes rabies a possible re-emerging pathogen; vaccination of transmitting species is the ideal means to achieve disease control.

Brote de histoplasmosis en el contexto de la pandemia por COVID-19 / Histoplasmosis outbreak in the context of the COVID-19 pandemic

La histoplasmosis es una micosis profunda de distribución mundial causada por el Histoplasma capsulatum var. capsulatum. Se caracteriza por una variabilidad clínica que depende principalmente de la carga fúngica, del estado inmunológico del paciente y de la virulencia del germen. Se describe un brote de histoplasmosis pulmonar aguda en militares, producido en el contexto epidemiológico de la COVID-19. El episodio tuvo lugar a partir de actividad laboral en cuevas donde participaron cuatro militares, tres de los cuales desarrollaron síntomas y fueron admitidos en el Hospital Dr. Gustavo Aldereguía Lima de Cienfuegos en enero de 2022. La información fue obtenida a través de la entrevista médica y la historia clínica. Se evidenció que en el contexto epidemiológico de la pandemia por COVID-19 no se debe subestimar el diagnóstico de otras enfermedades respiratorias, incluidas las micosis endémicas(AU)

Histoplasmosis is a deep mycotic infection of worldwide distribution caused by Histoplasma capsulatum var. capsulatum. It is characterized by clinical variability that depends mainly on the fungal load, the patient's immune status and the virulence of the germ. We describe an outbreak of acute pulmonary histoplasmosis among military officers, which occurred in the epidemiological context of COVID-19. The episode occurred during work activities in caves in which four soldiers participated, three of whom developed symptoms and were admitted to the "Dr. Gustavo Aldereguía Lima" Hospital in Cienfuegos in January 2022. The information was obtained through medical interviews and clinical records. It was evidenced that in the epidemiological context of the COVID-19 pandemic, the diagnosis of other respiratory diseases, including endemic mycoses, should not be underestimated(AU)

Guia para Controle de Tuberculose em Instituições de Acolhimento para População em Situação de Rua / Guide to Tuberculosis Control in Reception Institutions for Population in Street Situation

Este guia se destina a profissionais que atuam, principalmente, nas Instituições de Acolhimento destinadas à População em Situação de Rua (PSR). Entretanto, vários conceitos e informações que serão apresentados aqui podem ser usados em outros espaços de acolhimento e de oferta de cuidados a esta população, como os de grupos informais e de organizações públicas, governamentais ou não-governamentais.

Genital Human Papillomavirus Infection in women from Florianópolis - Santa Catarina, Brazil / Infecção genital pelo Papilomavírus Humano em mulheres de Florianópolis - Santa Catarina, Brasil

Introduction: Human Papillomavirus (HPV) infection is the most common sexually transmitted infection in women. About 80% of sexually active women will have contact with this virus at some age in their lives. Most infections will be transient, but when the infection becomes persistent, associated with high oncogenic risk HPV, there may be progression to cancer, especially cervical cancer. The best way to prevent HPV infection is through the use of vaccines. Objective: To assess which are the most prevalent types of HPV in the city of Florianópolis, Brazil and if the majority of the diagnosed types are contained in the HPV vaccines currently available on the market and in the public health sector. Methods: More than 14,727 HPV tests were evaluated for the diagnosis of genital HPV infection in women from Florianópolis. The prevalence of infection was evaluated according to age of the women. HPV detection was performed using molecular biology tests, such as hybrid capture (for diagnosis of the HPV group, high or low oncogenic risk) and PCR (viral genotyping) techniques. Results: The diagnosis of HPV infection was made for women between one and 102 years of age. The highest positivity of the exams was observed in women aged 20­25 years (51% of the exams). The most prevalent age group was 31­35 years old (23.5%), and the lowest was for women aged 70 and above (0.6%). High oncogenic risk HPV was detected in 94.1% of positive samples and was the most frequent in all age groups. Mixed infection (high- and low-risk HPV) was more prevalent in the 66­70 age group (25.6%). The most frequent genotypes were non-16/18 high oncogenic risk HPV (77% of positive cases). HPV 16 was found in 17.1% of positive cases, and HPV 18 in 6.5%. Conclusion: The most prevalent types of HPV in Florianópolis in the last 6 years are non-16/18 high oncogenic risk HPV types, viral types not covered by the current HPV vaccine available in the public health sector in Brazil.

Introdução: A infecção pelo Papilomavírus Humano (HPV)é a infecção sexualmente transmissível mais frequente na mulher. Cerca de 80% das mulheres sexualmente ativas irão entrar em contato com este vírus em algum momento da sua vida. A maioria das infecções será transitória, mas quando a infecção se torna persistente, associada aos HPV de alto risco oncogênico, poderá haver a progressão para o câncer, principalmente o câncer de colo de útero. A melhor forma de prevenção da contaminação pelo HPV é através da utilização das vacinas. Objetivo: Avaliar quais são os tipos de HPV mais prevalentes na cidade de Florianópolis, Brasil, e se a maioria dos tipos diagnosticados estão contidos nas vacinas contra o HPV atualmente disponíveis no mercado e no setor público de saúde. Métodos: Foram avaliados 14.727 exames para diagnóstico da infecção genital pelo HPV em mulheres de Florianópolis, de acordo com a idade das mulheres. A detecção do HPV foi realizada através dos exames de biologia molecular pelas técnicas de captura híbrida (para diagnóstico do grupo de HPV, alto ou baixo risco oncogênico) e PCR (genotipagem viral). Resultados: Foram avaliados exames para diagnóstico da infecção de mulheres entre um e 102 anos de idade. A maior positividade dos exames foi observada em mulheres dos 20­25 anos (51% dos exames). A faixa etária de maior prevalência foi dos 31­35 anos (23,5%), e a menor, após os 70 anos (0,6%). O HPV de alto risco oncogênico foi detectado em 94,1% dos casos positivos e foi o mais frequente em todas as faixas etárias. A infecção mista (HPV de alto e baixo risco) foi mais prevalente na faixa etária dos 66­70 anos (25,6%). Os genótipos mais frequentes foram os HPV de alto risco oncogênico não 16/18 (77% dos casos positivos). O HPV 16 foi encontrado em 17,1% dos casos positivos, e o HPV 18 em 6,5%. Conclusão: Os tipos de HPV mais prevalentes em Florianópolis nos últimos 6 anos são os HPV de alto risco oncogênico não 16/18, tipos virais não cobertos pela atual vacina contra o HPV disponível no setor público de saúde do Brasil.Palavras-chave: HPV. Tipos de HPV. Câncer de colo de útero. Cobertura vacinal.

Prevalence of HPV infection and cervical intraepithelial lesions in HIV positive and negative women in the city of Florianopolis / Prevalência da infecção pelo HPV e lesões intraepiteliais cervicais em mulheres HIV positivas e negativas na cidade de Florianópolis

Introduction: HPV infection is the most frequent sexually transmitted infection in women. The high oncogenic risk HPV, associated with others factors, there are a risk of progressing to a precancerous lesion of the cervix and even cancer. This evolution is related to the persistence of the infection and other factors, mainly those that interfere with the woman's immunity. The immunosuppression caused by HIV infection is an important factor for viral persistence and the appearance of these lesions. Objectives: To compare the prevalence of HPV infection and cervical intraepithelial lesions in HIV-positive and negative women and describe the possible associated risk factors. Methods: The sample consisted of 50 HIV positive women (study group) and 50 HIV negative women (control group) recruited from the public health system of Florianópolis during the months of January to April 2022. Cervical samples were collected for cytological analysis and for detection of high-risk oncogenic HPV DNA by polymerase chain reaction (PCR). Categorical variables were compared using the chi-square test, with a significance level set at 5% Results: HPV infection was more prevalent in the control group, however, HIV positive women had a higher frequency of intraepithelial lesions diagnosed on cytology. Factors such as greater number of sexual partners, depression and smoking were more frequent in the group of HIV positive women. The number of CD4 T cells less than 200 cels/mm3 was associated with a higher number of altered Pap smears and a positive HPV DNA test. The use of combination antiretroviral therapy and undetectable viral load were associated with a greater number of normal cytology and undetected HPV DNA. Conclusion: The prevalence of cervical intraepithelial lesions in HIV-infected women is higher than in women without infection. The presence of HIV infection was the most important risk factor associated with the development of cervical lesions. (AU)

Introdução: O Papilomavírus Humano (HPV) é a infecção de transmissão sexual mais frequente na mulher. O HPV de alto risco oncogênico, associado a outros fatores, apresenta risco de evoluir para uma lesão pré-cancerosa do colo de útero e até mesmo para o câncer. Essa evolução está relacionada à persistência da infecção e outros fatores, principalmente os que interferem na imunidade da mulher. A imunossupressão causada pela infecção HIV é um fator importante para a persistência viral e o aparecimento destas lesões. Objetivos: Comparar a prevalência da infecção pelo HPV e das lesões intraepiteliais do colo de útero em mulheres HIV positivas e negativas, e descrever os possíveis fatores de risco associados. Métodos: A amostra foi composta por 50 mulheres HIV positivas (grupo de estudo) e 50 mulheres HIV negativas (grupo controle) recrutadas no sistema público de saúde de Florianópolis durante os meses de janeiro a abril de 2022. Foram coletadas amostras cervicais para análise citológica e para detecção do DNA HPV de alto risco oncogênico por reação em cadeia da polimerase (PCR). As variáveis categóricas foram comparadas pelo teste qui-quadrado, com nível de significância estabelecido em 5%. Resultados: A infecção pelo HPV foi mais prevalente no grupo controle, entretanto, as mulheres HIV positivas tiveram uma maior frequência de lesões intraepiteliais diagnosticadas na citologia. Os fatores como maior número de parceiros sexuais, depressão e tabagismo foram mais frequentes no grupo de mulheres HIV positivas. O número de células TCD4 inferior a 200 células/mm3 esteve associado a maior número de colpocitologias alteradas e teste DNA HPV positivo. O uso da terapia antirretroviral combinada e a carga viral indetectável estiveram associadas a um número elevado de citologias normais e DNA HPV não detectado. Conclusão: A prevalência de lesões intraepiteliais do colo do útero em mulheres infectadas pelo HIV foi maior que em mulheres soronegativas. A presença de infecção pelo HIV foi o fator de risco mais importante associado ao desenvolvimento de lesões cervicais.Palavras-chave: HPV. HIV. coinfecção. lesões intraepiteliais escamosas cervicais. prevalência.. (AU)

Phosphoproteomic analysis of human umbilical venous endothelial cells with DENV-2 infection / 南方医科大学学报

OBJECTIVE@#To analyze the differentially phosphorylated proteins in DENV-2-infected human umbilical venous endothelial cells (HUVECs) and explore the possible pathogenic mechanism of DENV-2 infection.@*METHODS@#The total proteins were extracted from DENV-2-infected HUVECs and blank control HUVEC using SDT lysis method. The phosphorylated proteins were qualitatively and quantitatively analyzed using tandem mass spectrometry (TMT). The identified differentially phosphorylated proteins were analyzed by bioinformatics analyses such as subcellular localization analysis, GO enrichment analysis, KEGG pathway analysis and protein-protein interaction (PPI) analysis. Western blotting was used to detect the expressions of phosphorylated Jun, map2k2 and AKT1 proteins in DENV-2-infected HUVECs.@*RESULTS@#A total of 2918 modified peptides on 1385 different proteins were detected, and among them 1346 were significantly upregulated (FC > 1.2, P < 0.05) and 1572 were significantly downregulated (FC < 0.83, P < 0.05). A total of 49 phosphorylated conserved motifs were obtained by amino acid conservative motif analysis. The most abundant differentially phosphorylated peptides in protein domain analysis included RNA recognition motif, protein kinase domain and PH domain. Subcellular localization analysis showed that the differentially modified peptides were mainly localized in the nucleus and cytoplasm. GO enrichment and KEGG pathway analysis showed that the differential peptides were mainly enriched in the regulation of stimulation response, biosynthesis of small molecules containing nuclear bases, and migration of phagosomes and leukocytes across the endothelium. PPI and KEGG joint analysis showed that the up-regulated and down-regulated differentially phosphorylated proteins were enriched in 15 pathways. In DENV-2-infected HUVECs, Western blotting detected differential expressions of phosphorylated proteins related with the autophagy pathway, namely JUN, MAP2K2 and AKT1, and among them p-JUN was significantly down-regulated and p-AKT1 and p-MAP2K2 were significantly upregulated (P < 0.01).@*CONCLUSION@#DENV-2 infected HUVECs show numerous differentially expressed proteins. The downregulation of p-JUN and upregulation of p-MAP2K2 and p-AKT1 suggest their potential roles in regulating autophagy, which is probably involved in the mechanism of DENV-2 infection.

Clinical features of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 Omicron variant infection in children: an analysis of 201 cases / 中国当代儿科杂志

OBJECTIVES@#To study the clinical features of children with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Omicron variant infection.@*METHODS@#A retrospective analysis was performed on the medical data of 201 children with coronavirus disease 2019 (COVID-19) who were hospitalized and diagnosed with SARS-CoV-2 Omicron variant infection in Quanzhou First Hospital from March 14 to April 7, 2022. Among the 201 children, there were 34 children with asymptomatic infection and 167 with symptomatic infection. The two groups were compared in terms of clinical features, results of experimental examinations, and outcome.@*RESULTS@#Of all the 201 children, 161 (80.1%) had a history of exposure to COVID-19 patients and 132 (65.7%) had a history of COVID-19 vaccination. Among the 167 children with symptomatic infections, 151 had mild COVID-19 and 16 had common COVID-19, with no severe infection or death. Among the 101 children who underwent chest CT examination, 16 had ground glass changes and 20 had nodular or linear opacities. The mean time to nucleic acid clearance was (14±4) days for the 201 children with Omicron variant infection, and the symptomatic infection group had a significantly longer time than the asymptomatic infection group [(15±4) days vs (11±4) days, P<0.05]. The group vaccinated with one or two doses of COVID-19 vaccine had a significantly higher positive rate of IgG than the group without vaccination (P<0.05). The proportions of children with increased blood lymphocyte count in the symptomatic infection group was significantly lower than that in the asymptomatic infection group (P<0.05). Compared with the asymptomatic infection group, the symptomatic infection group had significantly higher proportions of children with increased interleukin-6, increased fibrinogen, and increased D-dimer (P<0.05).@*CONCLUSIONS@#Most of the children with Omicron variant infection have clinical symptoms, which are generally mild. The children with symptomatic infection are often accompanied by decreased or normal blood lymphocyte count and increased levels of interleukin-6, fibrinogen, and D-dimer, with a relatively long time to nucleic acid clearance. Some of them had ground glass changes on chest CT.

Epidemiological distribution of genotypes and sub-genotypes of hepatitis B virus in 15 ethnic groups in China / 中华流行病学杂志

Objective: To understand the distribution of genotypes and sub-genotypes of HBV in different ethnic groups in China. Methods: The HBsAg positive samples were selected by stratified multi-stage cluster sampling from the sample base of national HBV sero-epidemiological survey in 2020 for the amplification of S gene of HBV by nested PCR. A phylogeny tree was constructed to determine the genotypes and sub-genotypes of HBV. The distribution of genotypes and sub-genotypes of HBV were analyzed comprehensively by using laboratory data and demographic data. Results: A total of 1 539 positive samples from 15 ethnic groups were successfully amplified and analyzed, and 5 genotypes (B, C, D, I and C/D) were detected. The proportion of genotype B was higher in ethnic group of Han (74.52%, 623/836), Zhuang (49.28%, 34/69), Yi (53.19%, 25/47), Miao (94.12%, 32/34), Buyi (81.48%, 22/27). The proportions of genotype C were higher in ethnic groups of Yao (70.91%, 39/55). Genotype D was the predominant genotype in Uygur (83.78%, 31/37). Genotype C/D were detected in Tibetan (92.35%,326/353). In this study, 11 cases of genotype I were detected, 8 of which were distributed in Zhuang nationality. Except for Tibetan, sub-genotype B2 accounted for more than 80.00% in genotype B in all ethnic groups. The proportions of sub-genotype C2 were higher in 8 ethnic groups, i.e. Han, Tibetan, Yi, Uygur, Mongolian, Manchu, Hui and Miao. The proportions of sub-genotype C5 were higher in ethnic groups of Zhuang (55.56%, 15/27) and Yao (84.62%, 33/39). For genotype D, sub-genotype D3 was detected in Yi ethnic group and sub-genotype D1 was detected in both Uygur and Kazak. The proportions of sub-genotype C/D1 and C/D2 in Tibetan were 43.06% (152/353) and 49.29% (174/353). For all the 11 cases of genotype I infection, only sub-genotype I1 was detected. Conclusions: Five genotypes and 15 sub-genotypes of HBV were found in 15 ethnic groups. There were significant differences in the distribution of genotypes and sub-genotypes of HBV among different ethnic groups.

Genetic diversity and molecular characterization of Cucumber mosaic cucumovirus (CMV) subgroup II infecting Spinach (Spinacia oleracea) and Pea (Pisum sativum) in Pothwar region of Pakistan / Diversidade genética e caracterização molecular do Cucumber mosaic cucumovirus (CMV) subgrupo II infectando espinafre (Spinacia oleracea) e ervilha (Pisum sativum) na região de Pothwar, Paquistão

Cucumber mosaic virus (CMV) is a tremendous threat to vegetables across the globe, including in Pakistan. The present work was conducted to investigate the genetic variability of CMV isolates infecting pea and spinach vegetables in the Pothwar region of Pakistan. Serological-based surveys during 2016-2017 revealed 31.70% overall CMV disease incidence from pea and spinach crops. Triple-antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (TAS-ELISA) revealed that all the positive isolates belong to CMV subgroup II. Two selected cDNA from ELISA-positive samples representing each pea and spinach crops were PCR-amplified (ca.1100 bp) and sequenced corresponding to the CMV CP gene which shared 93.7% nucleotide identity with each other. Both the sequences of CMV pea (AAHAP) and spinach (AARS) isolates from Pakistan were submitted to GenBank as accession nos. MH119071 and MH119073, respectively. BLAST analysis revealed 93.4% sequence identity of AAHAP isolate with SpK (KC763473) from Iran while AARS isolate shared maximum identity (94.5%) with the strain 241 (AJ585519) from Australia and clustered with some reference isolates of CMV subgroup II from UK (Z12818) and USA (AF127976) in a Neighbour joining phylogenetic reconstruction. A total of 59 polymorphic (segregating) sites (S) with nucleotide diversity (π) of 0.06218 was evident while no INDEL event was observed in Pakistani isolates. The evolutionary distance of Pakistani CMV isolates was recorded as 0.0657 with each other and 0.0574-0.2964 with other CMV isolates reported elsewhere in the world. A frequent gene flow (Fst = 0.30478 <0.33) was observed between Pakistani and earlier reported CMV isolates. In genetic differentiation analysis, the value of three permutation-based statistical tests viz; Z (84.3011), Snn (0.82456), and Ks* (4.04042) were non-significant. The statistical analysis revealed the [...].

Cucumber mosaic cucumovirus (CMV) é uma tremenda ameaça aos vegetais em todo o mundo, inclusive no Paquistão. O presente trabalho foi conduzido para investigar a variabilidade genética de isolados de CMV infectando vegetais de ervilha e espinafre na região de Pothwar, Paquistão. Pesquisas com base em sorologia durante 2016-2017 revelaram 31,70% da incidência geral da doença por CMV em safras de ervilha e espinafre. O ensaio de imunoabsorção enzimática em sanduíche de anticorpo triplo (TAS-ELISA) revelou que todos os isolados positivos pertencem ao subgrupo II do CMV. Dois cDNA selecionados de amostras positivas para ELISA representando cada safra de ervilha e espinafre foram amplificados por PCR (ca.1100 pb) e sequenciados correspondendo ao gene CMV CP que compartilhou 93,7% de identidade de nucleotídeo um com o outro. Ambas as sequências de isolados de ervilha CMV (AAHAP) e espinafre (AARS) do Paquistão foram submetidas ao GenBank como nos de acesso. MH119071 e MH119073, respectivamente. A análise BLAST revelou 93,4% de identidade de sequência do isolado AAHAP com SpK (KC763473) do Irã, enquanto o isolado AARS compartilhou a identidade máxima (94,5%) com a cepa 241 (AJ585519) da Austrália e agrupada com alguns isolados de referência do subgrupo II de CMV do Reino Unido (Z12818) e EUA (AF127976) em uma reconstrução filogenética vizinha. Um total de 59 sítios polimórficos (segregantes) (S) com diversidade de nucleotídeos (π) de 0,06218 foi evidente, enquanto nenhum evento INDEL foi observado em isolados do Paquistão. A distância evolutiva de isolados de CMV do Paquistão foi registrada como 0,0657 entre si e 0,0574-0,2964 com outros isolados de CMV relatados em outras partes do mundo. Um fluxo gênico frequente (Fst = 0,30478 < 0,33) foi observado entre os isolados de CMV do Paquistão e relatados anteriormente. Na análise de diferenciação genética, os valores de três testes estatísticos baseados em [...].

Mycoviruses infecting Colletotrichum spp: a comprehensive review / Micoviroses em Colletotrichum spp: uma revisão abrangente

Colletotrichum is one of the most economically important fungal genera, which affects a wide range of hosts, specifically tropical and subtropical crops. Thus far, there have been several records of mycovirus infection in Colletotrichum spp., primarily by viruses of the Partitiviridae family. There have also been records of infections by mycoviruses of the Chrysoviridae family. Mycoviruses are (+)ssRNA and dsRNA genome viruses, which may or may not be enveloped. To date, no mycovirus with a DNA genome has been isolated from Colletotrichum spp. Typically, mycoviruses cause latent infections, although hypo- and hypervirulence have also been reported in Colletotrichum spp. In addition to its effects on pathogenic behavior, mycovirus infection can lead to important physiological changes, such as altered morphological characteristics, reduced vegetative growth, and suppressed conidia production. Therefore, research on mycoviruses infecting phytopathogenic fungi can help develop alternative methods to chemical control, which can cause irreversible damage to humans and the environment. From an agricultural perspective, mycoviruses can contribute to sustainable agriculture as biological control agents via changes in fungal physiology, ultimately resulting in the total loss of or reduction in the virulence of these pathogens.

Colletotrichum é um dos gêneros fúngicos mais importantes economicamente, afetando uma ampla gama de hospedeiros, especialmente em cultivos tropicais e subtropicais. Atualmente já existem diversos registros de infecção por micovírus em Colletotrichum spp., sendo a maioria dos já identificados classificados na família Partitiviridae. Ocorrem registros também de micovírus pertencentes à família Chrysoviridae. Compreendem vírus de genoma de (+)ssRNA e dsRNA que podem ser ou não envelopados. Ainda não foram identificados micovírus com genoma de DNA isolados de Colletotrichum. A infecção por micovírus pode ocorrer de forma latente, mas já foi observado em Colletotrichum spp. o fenômeno de hipo e hipervirulência. Além de influenciar no comportamento patogênico, a infecção pode causar mudanças fisiológicas importantes como alterações das características morfológicas, redução do crescimento vegetativo e redução na produção de conídios. O estudo com micovírus em fungos fitopatogênicos traz uma alternativa ao controle químico que é um método capaz de causar danos irreversíveis ao homem e o meio ambiente. Sob a perspectiva agrícola, os micovírus podem contribuir para agricultura sustentável como agentes de controle biológico. Isso porque obsevam-se mudanças importantes na fisiologia fúngica resultando na perda total ou redução da virulência desses patógenos.

Death caused by covid-19 in top ten countries in Asia affected by covid-19 pandemic with special reference to Pakistan / Morte causada por covid-19 nos dez principais países da Ásia afetados pela pandemia de covid-19, com referência especial ao Paquistão

The COVID-19 is a contagious viral disease, was first emerged in Wuhan, China in December 2019 and became the whole world on alert. The mortality rate in top most countries in Asia with special reference to Pakistan has been focused. Since February 26 to September 2020 the total confirmed cases and mortality rate was measured through Wikipedia and the notable journals. Iran is the only country having highest number of deaths (5.73%) followed by Indonesia (3.77%) while Saudi Arabia shows the lowest number of deaths as 1.39%. In Pakistan the first case was confirmed in 26th February, 2020. The nCov-19 has closely related to severe acute respiratory syndrome (SARS) hence SARS COV-2 was named. This virus is responsible for more than 33.9 million deaths in over all the world as of 20th September, 2020. The number of new cases is increasing time to time. Sindh province of Pakistan has reported the highest number of cases till September, 20, 2020 as compared to other parts of the country and has the highest number of death followed by Khyber Pakhtunkhwa. Because of the person to person contact the disease is spreading rapidly. The individuals who has already infected with other diseases like cancer or diabetic etc. are vulnerable. The nCOV-19 is the most contagious due to its mode of transmission. There is still no vaccine is available for the treatment of disease caused by nCoV-2019. It is therefore the only option to control this pandemic is to adopt effective preventive measures.

A covid-19 é uma doença viral contagiosa, que surgiu pela primeira vez em Wuhan, China, em dezembro de 2019, e deixou o mundo todo em alerta. A taxa de mortalidade na maioria dos principais países da Ásia, com referência especial ao Paquistão, foi enfocada. De 26 de fevereiro a setembro de 2020, o total de casos confirmados e a taxa de mortalidade foram medidos por meio da Wikipedia e de periódicos notáveis. O Irã é o único país com maior número de mortes (5,73%), seguido pela Indonésia (3,77%), enquanto a Arábia Saudita mostra o menor número de mortes, 1,39%. No Paquistão, o primeiro caso foi confirmado em 26 de fevereiro de 2020. O nCov-19 está intimamente relacionado à síndrome respiratória aguda grave (SARS), daí o nome SARS COV-2. Esse vírus é responsável por mais de 33,9 milhões de mortes em todo o mundo em 20 de setembro de 2020. O número de novos casos está aumentando de tempos em tempos. A província de Sindh, no Paquistão, registrou o maior número de casos até 20 de setembro de 2020, em comparação com outras partes do país, e tem o maior número de mortes, seguida por Khyber Pakhtunkhwa. Por causa do contato pessoa a pessoa, a doença está se espalhando rapidamente. Indivíduos que já foram diagnosticados com outras doenças, como câncer ou diabetes, etc. são mais vulneráveis. O nCOV-19 é o mais contagioso devido ao seu modo de transmissão. Ainda não há vacina disponível para o tratamento da doença causada pelo nCoV-2019. Portanto, a única opção para controlar essa pandemia é a adoção de medidas preventivas eficazes.