RESUMO
Abstract Yellow pigmented, filamentous, Gram-negative bacteria belonging to genus Flavobacterium are commonly associated with infections in stressed fish. In this study, inter-species diversity of Flavobacterium was studied in apparently healthy freshwater farmed fishes. For this, ninety one yellow pigmented bacteria were isolated from skin and gill samples (n = 38) of three farmed fish species i.e. Labeo rohita, Catla catla and Cyprinus carpio. Among them, only twelve bacterial isolates (13.18%) were identified as Flavobacterium spp. on the basis of morphological, biochemical tests, partial 16S rDNA gene sequencing and phylogenetic analysis. On the basis of 16S rDNA gene sequencing, all the 12 isolates were 97.6-100% similar to six different formally described species of genus Flavobacterium. The 16S rDNA based phylogenetic analysis grouped these strains into six different clades. Of the 12 isolates, six strains (Fl9S1-6) grouped with F. suncheonense, two strains (Fl6I2, Fl6I3) with F. indicum and the rest four strains (Fl1A1, Fl2G1, Fl3H1 and Fl10T1) clustered with F. aquaticum, F. granuli, F. hercynium and F. terrae, respectively. None of these species except, F. hercynium were previously reported from fish. All the isolated Flavobacterium species possessed the ability of adhesion and biofilm formation to colonize the external surface of healthy fish. The present study is the first record of tropical freshwater farmed fishes as hosts to five environmentally associated species of the Flavobacterium.
Assuntos
Animais/classificação , Animais/genética , Animais/isolamento & purificação , Animais/microbiologia , Animais/fisiologia , Animais/veterinária , DNA Bacteriano/classificação , DNA Bacteriano/genética , DNA Bacteriano/isolamento & purificação , DNA Bacteriano/microbiologia , DNA Bacteriano/fisiologia , DNA Bacteriano/veterinária , DNA Ribossômico/classificação , DNA Ribossômico/genética , DNA Ribossômico/isolamento & purificação , DNA Ribossômico/microbiologia , DNA Ribossômico/fisiologia , DNA Ribossômico/veterinária , Doenças dos Peixes/classificação , Doenças dos Peixes/genética , Doenças dos Peixes/isolamento & purificação , Doenças dos Peixes/microbiologia , Doenças dos Peixes/fisiologia , Doenças dos Peixes/veterinária , Peixes/classificação , Peixes/genética , Peixes/isolamento & purificação , Peixes/microbiologia , Peixes/fisiologia , Peixes/veterinária , Infecções por Flavobacteriaceae/classificação , Infecções por Flavobacteriaceae/genética , Infecções por Flavobacteriaceae/isolamento & purificação , Infecções por Flavobacteriaceae/microbiologia , Infecções por Flavobacteriaceae/fisiologia , Infecções por Flavobacteriaceae/veterinária , Flavobacterium/classificação , Flavobacterium/genética , Flavobacterium/isolamento & purificação , Flavobacterium/microbiologia , Flavobacterium/fisiologia , Flavobacterium/veterinária , Água Doce/classificação , Água Doce/genética , Água Doce/isolamento & purificação , Água Doce/microbiologia , Água Doce/fisiologia , Água Doce/veterinária , Índia/classificação , Índia/genética , Índia/isolamento & purificação , Índia/microbiologia , Índia/fisiologia , Índia/veterinária , Dados de Sequência Molecular/classificação , Dados de Sequência Molecular/genética , Dados de Sequência Molecular/isolamento & purificação , Dados de Sequência Molecular/microbiologia , Dados de Sequência Molecular/fisiologia , Dados de Sequência Molecular/veterinária , Filogenia/classificação , Filogenia/genética , Filogenia/isolamento & purificação , Filogenia/microbiologia , Filogenia/fisiologia , Filogenia/veterinária , /classificação , /genética , /isolamento & purificação , /microbiologia , /fisiologia , /veterináriaRESUMO
The ribosomal RNA genes of catfish Heteropneustes fossilis Bloch were examined by Southern blot analysis of genomic DNA digested with restriction enzymes and probed with labelled catfish ribosomal RNA. The major repeat length is 12 kb and about 300 copies per haploid genome are tandemly arranged. The repeat lengths are homogeneous in size in different tissues and individuals. A restriction site polymorphism exists in some of the repeats.