Genetic variability and efficiency of DNA microsatellite markers for paternity testing in horse breeds from the Brazilian Marajó archipelago

In this study, 15 microsatellite DNA loci used in comparative tests by the International Society for Animal Genetics were applied to the evaluation of genetic diversity and management, and the efficiency of paternity testing in Marajoara horses and Puruca ponies from the Marajó Archipelago. Based on the genotyping of 93 animals, mean allelic diversity was estimated as 9.14 and 7.00 for the Marajoara and Puruca breeds, respectively. While these values are similar to those recorded in most European breeds, mean levels of heterozygosity were much lower (Marajoara 49 percent, Puruca 40 percent), probably as a result of high levels of inbreeding in the Marajó populations. The mean informative polymorphic content of this 15-marker system was over 50 percent in both breeds, and was slightly higher in the Marajoara horses. The discriminative power and exclusion probabilities derived from this system were over 99 percent for both populations, emphasizing the efficacy of these markers for paternity testing and genetic management in the two breeds.

Caracterización de tres microsatelites del gen de fibrosis quistica en familias argentinas / Characterization of 3 microsatellites of the cystic fibrosis gene in Argentine families

La población de Argantina es altamente Heterogénea para las mutaciones del gen regulador de la conductancia de transmembrana de la fibrosis quística (CFTR). El estudio de 14 mutaciones reportadas entre las más frecuentes, detectó ambos alelos mutados (genotipo completo) en sólo el 51 porciento de los pacientes. Este estudio confirmó el diagnóstico de Fibrosis Quística de estos pacientes y posibilitó detectar entres sus familiares, individuos portadores asintomáticos. Sin embargo, en el resto de los pacientes, el análisis molecular directo, no aportó la información necesaria para el asesoriamento familiar. Con el objetivo de estabelecer la transmisióan de microsatélite (IVS17bTA, IVS8CA y IVS17bCA) localizados en regiones intrónicas del gan CFTR. En las 40 familias FQ analizadas, se detectaron diferentes variantes alélicas, 15 para IVS17TA, 10 para IVS8CA y 4 para IVS17CA . El contenido de información polimórfica y de heterocigosis de estos marcadores fue elevado, a exepción de IVS17bCA que resultó poco polimórfico. A través del análisis simultáneo de estos tres microsatélite se pudo asesorar al 100 porciento de las familias. Nuestros resultados demuestran que estos microsatélites, constituyen un excelente gru[po de marcadores, útiles para realizar estudios de ligamiento de población Argentina.

A validation study of four single locus probes (MS1, MS31, MS43 and g3) in a Korean population: further evaluation for paternity testing

Hypervariable tandem repetitive regions in human DNA are proving to be increasingly useful for genetic analysis in humans. We chose four single locus probes (SLP; MS1, MS43, MS8 and g3) for a validation test among Koreans. The specimens were from 216 unrelated individuals and 33 paternity inclusion families. Extracted DNA from EDTA blood was restricted by Hinfl and electrophoresed in 0.7% agarose gel, transferred and hybridized with chemiluminescent probes. Heterozygosity was over 90% by all of the probes. Total numbers of unassignable mutant bands from 33 paternity inclusion cases were 5, and the highest mutation rate was determined in probe MS1(0.045). The probability of having the same DNA band between two unrelated individuals was 5.7 x 10(-10) when four SLPs were used at the same time. The data presented here on allele frequencies and mutation rates provide preliminary data supporting the validity of these probes in paternity analysis and forensic investigators in the Korean population.

Molecular cloning of human satellite DNA sequences and their use in detecting DNA polymorphism.

A approximately 400 bp HaeIII human genomic satellite DNA band was cloned into pUC18 to construct a partial library. A fragment of bacteriophage M13 containing a sequence homologous to the human minisatellite core was cloned in pUC18 and was used as a probe to isolate a approximately 350 bp human satellite clone (pTRF5.6) from the partial library. Other clones from this library showed a wide variation in terms of size and hybridization to the pTRF5.6 clone. Human DNA from different individuals was digested with restriction enzymes, Southern transferred and probed with TRF5.6. Individual-specific complex pattern of DNA bands was produced. TRF5.6, therefore, could be useful as a probe for detecting genetic polymorphism.

Patrón de las asociaciones satelíticas en mujeres post-parto y en neonatos / Satellite association patterns in post partum women and neonates

Se compararon diferentes aspectos de las asociaciones satelíticas, presentes en dos grupos de 200 células cada uno (2 por individuo), correspondientes a 100 madres post-parto, con edades comprendidas entre 14 y 43 años y 100 neonatos (51 hombres y 49 mujeres), provenientes de la población de Puriscal, Costa Rica. Varios tipos de asociaciones satelíticas mostraron una proporción significativamente mayor en las madres. Las asociaciones más frecuentes en los dos grupos fueron las de dos cromosomas, seguidas en frecuencia por las de tres cromosomas. La relación D/G fue de 1,43 en los niños y de 1,40 en las madres; el número de asociaciones por células fue casi el doble en las madres; el número medio de acrocéntricos por asociación fue de 2,2 en los niños y de 2,35 en las madres. No se reveló diferencias significativas entre los valores observados y esperados de cromosomas D y G involucrados en asociaciones en ambos grupos, de manera que los factores no determinados aún, implicados en el aumento de asociaciones satelíticas en las madres, influenciaron de manera similar a los dos tipos de cromosomas acrocéntricos