Vírus e fissuras orofaciais: um histórico isolado e de associação / Viruses and orofacial clefts: an isolated and associational history / Virus y fisuras orofaciales: una historia aislada y asociativa

Os vírus são microrganismos comumente associados as doenças e infectam todos os seres vivos. Atuam de forma direta e indireta levando a pressão seletiva, com papel significativo e ainda em exploração no planeta. As fissuras orofaciais são anomalias congênitas de etiologia complexa e multifatorial, sendo as infecções virais durante a gestação um dos possíveis fatores etiológicos. A história da humanidade frente aos vírus e fissuras orofaciais de forma isolada é vasta, remontando a períodos antes de Cristo, seja por meio de leis para o controle de pragas e/ou por lendas de míticas criaturas deificadas e/ou demonizadas, cuja criação está fundamentada na Teoria Alegórica do surgimento das mitologias, demonstrando assim o interesse do ser humano e sua curiosidade em inovação e explicação destes assuntos. Considerando a relevância histórica, bem como a possível relação etiológica destes dois elementos, uma revisão da literatura foi realizada para apresentar a história mitológica e científica dos vírus e fissuras orofaciais, de forma isolada e associadas para fins de comparação. Para isso, foram utilizadas as bases PubMed/Medline, SciElo, LILACS e Portal Periódicos (CAPES) com os descritores: Virus, Anomalias/Anomalies, Virus and Anomalias/Virus and Anomalies, A History of viruses/História dos vírus, Virus and History/História and Virus, Virus and Myth/Virus and Mito, Anomalias and Mitos/Anomalies and Myths, Vampires and Virus/Vampiros and Virus. Enquanto o histórico mitológico é cheio de teorias contraditórias, o histórico cientifico acadêmico se revela coerente, porém resistente as novas áreas de atuação, não ponderando novas possibilidades e limitando a exploração científica, que só pôde ser alcançada nos séculos atuais. Quanto a associação, a linha de pesquisa relacionando vírus e fissuras orofaciais não possui nem meio século de existência, propiciando um grande campo a ser explorado e na mesma medida limitando os benefícios em prevenção que poderiam ser obtidos através destes estudos.

Viruses are microorganisms commonly associated with diseases that infect all living beings, they act directly and indirectly leading to selective pressure, their role on the planet is significant and still under exploration. Orofacial clefts are congenital anomalies that have a complex multifactorial etiology, with viral infections during pregnancy being one of the possible etiological factors. The history of humanity in the face of viruses and orofacial clefts in isolation is vast, dating back to periods before Christ, whether through laws for pest control and/or legends of mythical deified and/or demonized creatures, whose creation is fundamentalized in the Allegorical Theory of the emergence of mythologies, thus demonstrating the interest of human beings and their curiosity in innovation and explanation of these subjects. Considering the historical relevance, as well as the possible etiology relationship of these two elements, we carried out a literature review to present the mythological and scientific history of viruses and orofacial clefts, isolated and associated for comparison purposes. For this intent, the bases PubMed/Medline, SciElo, LILACS and Portal Periódicos (CAPES) were selected with the descriptors: A History of viruses/História dos vírus, Virus and History/História and Virus, Virus and Myth/Virus and Mito, Anomalias and Mitos/Anomalies and Myths, Vampires and Virus/Vampiros and Virus. While the mythological history is full of contradictory theories, the academic, scientific history proves to be consistent, but resistant to new areas of action, not considering new possibilities and limiting scientific exploration, which can only be achieved in the present centuries. As for the association, the line of research relating viruses and orofacial clefts does not even have half a century of existence, providing a large field to be explored and at the same time limiting the benefits of prevention that could be obtained through these studies.

Los virus son microorganismos comúnmente asociados a enfermedades que infectan a todos los seres vivos, actúan directa e indirectamente provocando presión selectiva, su papel en el planeta es significativo y aún en exploración. Las hendiduras orofaciales son anomalías congénitas que tienen una compleja etiología multifactorial, siendo las infecciones virales durante el embarazo uno de los posibles factores etiológicos. La historia de la humanidad frente a los virus y las hendiduras orofaciales de forma aislada es vasta, remontándose a períodos anteriores a Cristo, ya sea a través de leyes para el control de plagas y/o leyendas de criaturas míticas deificadas y/o demonizadas, cuya creación se fundamentaliza en la Teoría Alegórica del surgimiento de las mitologías, demostrando así el interés del ser humano y su curiosidad en la innovación y explicación de estos temas. Considerando la relevancia histórica, así como la posible relación etiológica de estos dos elementos, realizamos una revisión bibliográfica para presentar la historia mitológica y científica de los virus y las hendiduras orofaciales, aislados y asociados para fines de comparación. Para ello, se seleccionaron las bases PubMed/Medline, SciElo, LILACS y Portal Periódicos (CAPES) con los descriptores: A History of viruses/História dos vírus, Virus and History/História and Virus, Virus and Myth/Virus and Mito, Anomalias and Mitos/Anomalías y Mitos, Vampiros and Virus/Vampiros y Virus. Mientras que la historia mitológica está llena de teorías contradictorias, la historia académica, científica, se muestra coherente, pero resistente a nuevos campos de actuación, no considerando nuevas posibilidades y limitando la exploración científica, que sólo puede alcanzarse en los siglos actuales. En cuanto a la asociación, la línea de investigación que relaciona virus y hendiduras orofaciales no tiene ni medio siglo de existencia, proporcionando un gran campo a ser explorado y al mismo tiempo limitando los beneficios de prevención que podrían ser obtenidos a través de estos estudios.

Trichoderma harzianum MTCC 5179 impacts the population and functional dynamics of microbial community in the rhizosphere of black pepper (Piper nigrum L )

Abstract Employing Illumina Hiseq whole genome metagenome sequencing approach, we studied the impact of Trichoderma harzianum on altering the microbial community and its functional dynamics in the rhizhosphere soil of black pepper (Piper nigrum L.). The metagenomic datasets from the rhizosphere with (treatment) and without (control) T. harzianum inoculation were annotated using dual approach, i.e., stand alone and MG-RAST. The probiotic application of T. harzianum in the rhizhosphere soil of black pepper impacted the population dynamics of rhizosphere bacteria, archae, eukaryote as reflected through the selective recruitment of bacteria [Acidobacteriaceae bacterium (p = 1.24e-12), Candidatus koribacter versatilis (p = 2.66e-10)] and fungi [(Fusarium oxysporum (p = 0.013), Talaromyces stipitatus (p = 0.219) and Pestalotiopsis fici (p = 0.443)] in terms of abundance in population and bacterial chemotaxis (p = 0.012), iron metabolism (p = 2.97e-5) with the reduction in abundance for pathogenicity islands (p = 7.30e-3), phages and prophages (p = 7.30e-3) with regard to functional abundance. Interestingly, it was found that the enriched functional metagenomic signatures on phytoremediation such as benzoate transport and degradation (p = 2.34e-4), and degradation of heterocyclic aromatic compounds (p = 3.59e-13) in the treatment influenced the rhizosphere micro ecosystem favoring growth and health of pepper plant. The population dynamics and functional richness of rhizosphere ecosystem in black pepper influenced by the treatment with T. harzianum provides the ecological importance of T. harzianum in the cultivation of black pepper.

Desenvolvimento de biossensor para detecção do vírus Espetein Barr (EBV) em saliva de pacientes HIV positivos / Biosensor development to detection of Epstein Barr virus (EBV) from positive HIV patients

O vírus Epstein Barr (EBV) é oncogênico e relacionado com a etiologia de inúmeras neoplasias malignas, como linfomas de Burkitt, Hodgkin(LH), não-Hodgkin (LNH), nasal de células NK, além de carcinoma nasofaríngeo, desordens linfoproliferativas, bem como outras lesões não malignas. A incidência de LNH em pacientes HIV positivos é maior em relação a indivíduos saudáveis, sendo 75% desses linfomas, EBV positivos, com alta taxa de DNA e expressão de genes virais. Além disso, aumento da carga viral em pacientes transplantados é preditivo de uma neoplasia maligna associada ao EBV. EBV é facilmente transmitido pela saliva e estudos apontam uma maior quantidade do DNA-EBV em saliva em relação ao sangue. Os métodos clássicos de diagnóstico - Imunoabsorbância (ELlSA); Imunoistoquímica; Reação de Polimerase em Cadeia (PCR); e Hibridização in situ - são realizados em laboratórios bem equipados e por profissionais qualificados, com reagentes específicos e onerosos, e tempo de análise com variação de horas ou até mesmo dias. O desenvolvimento de métodos analíticos rápidos, seguros e de baixo custo para diagnóstico e controle de doenças em humanos tem despertado grande interesse científico através dos biossensores. Simplicidade de utilização e grande sensibilidade nos resultados, diagnóstico em tempo reduzido, uso de pequenas quantidades de amostras e baixo custo, despontam como grandes vantagens para investimento em pesquisa no desenvolvimento dos biossesores, com potencial substituinte de técnicas analíticas tradicionais. Nesse trabalho foi desenvolvido um biossensor para diagnóstico do EBV, isto é, presença ou ausência, em saliva de pacientes HIV positivos. Este sistema foi formado pela imobilização de sequências oligonucleotideos modificados com grupo tiol, complementares ao gene alvo do EBV (EBV-DNA), em nanopartículas de ouro (AuNp) baseado no princípio de detecção colori métrica visual direta. O resultado positivo apresenta mudança de cor da solução do conjugado (AuNp/EBV-DNA) em contato com saliva, e o negativo não mostra mudança de cor sob as mesmas condições. Foi padronizado a partir de amostras de saliva previamente analisadas pela técnica de quantificação absoluta por PCR em Tempo Real. Apresentou linearidade de resposta entre 495.000 e 495 cópias de vírus/uL (R2=0,982), detecção limite de 0,29 cópia/uL e a sensibilidade foi de 0,022 cópias/uL em testes com saliva. Portanto, desenvolvemos um biossensor para diagnóstico do EBV em saliva, de baixo custo, sensível e específico, para ser utilizado em laboratórios, consultórios e/ou ambulatórios, sem a necessidade de equipamento e capacitação profissional para interpretação de resultados.

Epstein Barr (EBV) is an oncogenic vírus that is related to several diferent malignant neoplasms, such as, Burkitl, Hodgkin (HL) and non-Hodgkin (NHL) Iymphomas, nasal NK-cell Iymphoma, besides nasopharyngeal carcinoma, Iymphoproliferative disorders, and other non-neoplastic disorders. NHL is more incident in HIV patients than in healthy individuais, and 75% of these Iymphomas are EBV positive. Also, an increase in the viral load of transplanted patients is considered predictive of an EBV related neoplasm. EBV may be transmitled by the saliva of and infected person, and the literatures shows a higher DNA amount in this fluid than in blood. The classical diagnostic methods: immunoassay (ELlSA); immunohistochemistry; polymerase chain reaction (PCR); and "in situ" hybridization, are performed in well-equipped laboratories, by trained professionals, with specific and expensive reagents. Usually it takes hours or even days to analyze the results. The development of safe, quick and low-cost innovative methods for diagnosis and control of human diseases has challenged scientists, and biosensors are receiving a great deal of focus. Usability, sensitivity, short-term results, low sample amount and low-cost made biosensors a potential substitute for traditional analytical methods. In this work we developed a biosensor for EBV diagnosis, that is, its presence or absence, in HIV patients. The biosensor is based on the immobilization of EBV specific oligonucleotides sequences in gold nanoparticles by a thiol group. The system is based on a colorimetric detection by direct visualization. A positive result shows a change in color when the conjugate (AuNp/EBV-DNA) is in contact with an EBV infected saliva. EBV DNA copies in saliva were analyzed by absolute quantification with real time PCR. Results present linearity between 495000 and 495 copies/ul (R2=0.982), the detection limit was 0.29 copies/uL, and the sensitivity was 0.022 copies/uL. Therefore, a low-cost, sensitive and specific biosensor for salivary EBV diagnosis was developed. The system is possible to be used in laboratories, clinics, medical and dental offices, with no need of special equipment or training to understand the results.

La evolución viral y su relevancia para los virus transmitidos por alimentos / Viral evolution and its relevance for virus transmission via food

La comprensión científica requiere tanto comprobaciones científicas como teorías que puedan explicar esos hechos en una manera coherente. La evolución es, en este contexto, tanto un hecho como una teoría. Es un hecho incontrovertible que los organismos han cambiado, o evolucionado, durante la historia de la vida en la Tierra...La incongruencia que resulta de intentar explicar hechos de una gran complejidad mediante conceptos elaborados para explicar procesos muy simples sólo puede conducir a nuestra disciplina a una gran confusión. Ante esta situación, parece razonaable insistir en la necesidad de elaborar una base teórica sustentada en datos reales (no en hipótesis), que sea capaz de integrar y explicar coherente y cientificamente los fenómenos y los procesos biológicos pasados y, como consecuencia, haga posible una mejor comprensión de los actuales.

Scientific understanding requires both facts and theories that can explain those facts in a coherent manner. Evolution, in this context, is both a fact and a theory. It is an incontrovertible fact that organisms have changed, or evolved, during the history of life on Earth...The incongruity resulting from try to explain facts with a huge complexity by means fo concepts elaborated to explain very simple processes only can lead to our discipline into a big confussion. At this point it seems reasonable to insist in the need of a new theoretical framework, not founded on hypothesis but on real data. A theoretical framework able to coherently integrate, and scientifically explain, the biological processes of the past and therefore, able to provide a better understanding of the present ones.