RESUMO
BACKGROUND & OBJECTIVES: Echovirus 11 (ECV11) is one of the most frequent non-polio enteroviruses isolated from stool samples of children with acute flaccid paralysis in north India. The present work was undertaken to study the sequence variability in the 440 bp of 5'-non-translated region of ECV11 genome using heteroduplex mobility assay (HMA). METHODS: Twelve ECV11 isolates were studied for sequence variability in the 5'-non-translated region (5'NTR) using the HMA followed by nucleotide sequencing. HMA was used to determine sequence diversity between Indian ECV11 isolates and prototype Gregory strain. HMA results were confirmed by 5'NTR nucleotide sequencing of five Indian ECV11 isolates. RESULTS: HMA results showed high genomic diversity between the prototype Gregory strain and Indian ECV11 isolates. All isolates were grouped into five different types of heteroduplex mobility patterns with respect to Gregory strain. A 440 bp 5'NTR fragment of five ECV11 isolates representing different heteroduplex patterns, was sequenced. The sequence alignment showed that 5'NTR of Indian isolates was different from prototype Gregory strain and identical to the ECV11 isolates of Finland and Hungary. Phylogenetic analysis including ECV11 isolate sequences from different parts of the world showed that Indian ECV11 isolates represented a different subgroup. INTERPRETATION & CONCLUSION: The results of the present study suggested that the HMA could be successfully used as a preliminary screening method for sequence variability determination of enterovirus field isolates. The sequence data generated on ECV11 isolates from India will be useful for future studies of endemic genotypes of echovirus.
Assuntos
Regiões 5' não Traduzidas , Pré-Escolar , DNA/genética , DNA Complementar/metabolismo , Enterovirus Humano B/genética , Feminino , Técnicas Genéticas , Genoma Viral , Humanos , Índia , Lactente , Masculino , Ácidos Nucleicos Heteroduplexes/genética , Filogenia , Vacina Antipólio Oral/farmacologia , Reação em Cadeia da Polimerase , RNA/metabolismo , RNA Viral , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase ReversaRESUMO
O objetivo da presente pesquisa foi avaliar se a administraçäo prévia de vacina oral antipoliomielite, tipo Sabin (VOP-Sabin), interfere na eficácia sorológica da vacina do sarampo. Com essa finalidade estudaram-se 117 crianças, de nove meses de idade, que receberam vacina de vírus vivo atenuado do sarampo (cep BIKEN CAM 70) no período de quatro semanas, ou menos, após terem recebido vacina oral antipoliomielite (VOP-Sabin), e 88 crianças, da mesma faixa etária mas sem vacinaçäo recente com a VOP-Sabin, como controle. Os anticorpos IgG para o sarampo foram pesquisados mediante a reaçäo de imunofluorescência indireta. A proporçäo de soroconversäo para a vacina do sarampo foi de 19/23 (82,6%) nas crianças que tinham recebido a VOP-Sabin 2 a 6 dias antes; 29/37 (78,4%), nas que receberam VOP-Sabin 9 a 13 dias antes; 32/42 (76,2%), nas vacinadas com a VOP-Sabin 16 a 20 dias antes; e 12/15 (80,0%), nas vacinadas com intervalos de 23 a 26 dias. A proporçäo de soroconversäo no grupo controle (vacinadas quatro semanas ou mais após a VOP-Sabin) foi de 68/88 (77,8%) e a comparaçäo destas proporçöes näo mostrou diferenças estatisticamente significativas. Os resultados obtidos näo demonstraram, portanto, uma menor eficácia sorológica para a vacina do sarampo em crianças previamente vacinadas contra a pólio que recebram a vacina Sabin durante as quatro semanas anteriores