Pulmonary nontuberculous mycobacterial infections: presumptive diagnosis based on the international microbiological criteria adopted in the state of São Paulo, Brazil, 2011-2014 / Micobacterioses pulmonares: diagnóstico presuntivo pelos critérios microbiológicos internacionais adotados no estado de São Paulo, Brasil, 2011-2014

ABSTRACT

ABSTRACT Objective: Pulmonary nontuberculous mycobacterial infections are caused by nontuberculous mycobacteria (NTM), the microbiological diagnosis of which involves the isolation and identification of the same species in at least two sputum samples, one BAL fluid sample, or one lung biopsy sample. The objective of the present study was to determine the frequency at which the various NTM species are identified among selected individuals and in potential cases of pulmonary nontuberculous mycobacterial infection. Methods: This was a retrospective analysis of the data on species isolated from respiratory specimens collected from 2,843 individuals between 2011 and 2014. Potential NTM infection cases were identified on the basis of the international microbiological criteria adopted in the state of São Paulo. Results: A total of 50 species were identified using the molecular method PCR-restriction enzyme analysis. Samples collected from 1,014 individuals were analyzed in relation to the microbiological criteria, and 448 (44.18%) had a presumptive diagnosis of pulmonary nontuberculous mycobacterial infection, the species identified most frequently being, in descending order, Mycobacterium kansasii, M. abscessus, M. intracellulare, M. avium, and M. szulgai. Conclusions: Although various NTM species were identified among the individuals studied, those presumptively identified most frequently on the basis of the microbiological criteria adopted in the state of São Paulo were the ones that are most commonly associated with pulmonary nontuberculous mycobacterial infection worldwide or in specific geographic regions.

RESUMO

RESUMO Objetivo: As micobacterioses pulmonares são doenças causadas por micobactérias não tuberculosas (MNTs), cujo diagnóstico microbiológico envolve o isolamento e a identificação da mesma espécie a partir de pelo menos duas amostras de escarro, uma de lavado brônquico ou uma de biópsia pulmonar. O objetivo do presente estudo foi determinar as frequências das diferentes espécies de MNTs em indivíduos selecionados e em potenciais casos de micobacterioses pulmonares. Métodos: Análise retrospectiva dos dados de identificação de espécies isoladas a partir de espécimes clínicos pulmonares de 2.843 indivíduos incluídos no estudo entre 2011 e 2014. A identificação dos potenciais casos baseou-se nos critérios microbiológicos internacionais adotados no estado de São Paulo. Resultados: Um total de 50 espécies foi identificado utilizando-se o método molecular PCR-restriction enzyme analysis. Dos 1.014 indivíduos analisados quanto aos critérios microbiológicos, 448 (44,18%) tiveram o diagnóstico presuntivo de micobacteriose pulmonar, sendo as maiores frequências de casos, em ordem decrescente, Mycobacterium kansasii, M. abscessus, M. intracellulare, M. avium e M. szulgai. Conclusões: Embora tenham sido identificadas diversas espécies de MNTs entre os indivíduos estudados, as que tiveram as maiores frequências de casos presuntivamente identificados pelos critérios microbiológicos adotados no estado de São Paulo foram as que mais frequentemente estão associadas a micobacterioses pulmonares mundialmente ou em várias regiões geográficas.