Speeding up the diagnosis of multidrug-resistant tuberculosis in a high-burden region with the use of a commercial line probe assay / Agilizando o diagnóstico da tuberculose multirresistente em uma região endêmica com o uso de um teste comercial de sondas em linha
J. bras. pneumol
;
45(2): e20180128, 2019. tab, graf
Article
in English
| LILACS
| ID: biblio-1002440
ABSTRACT
ABSTRACT Objective:
To evaluate the rapid diagnosis of multidrug-resistant tuberculosis, by using a commercial line probe assay for rifampicin and isoniazid detection (LPA-plus), in the routine workflow of a tuberculosis reference laboratory.Methods:
The LPA-plus was prospectively evaluated on 341 isolates concurrently submitted to the automated liquid drug susceptibility testing system.Results:
Among 303 phenotypically valid results, none was genotypically rifampicin false-susceptible (13/13; 100% sensitivity). Two rifampicin-susceptible isolates harboured rpoB mutations (288/290; 99.3% specificity) which, however, were non-resistance-conferring mutations. LPA-plus missed three isoniazid-resistant isolates (23/26; 88.5% sensitivity) and detected all isoniazid-susceptible isolates (277/277; 100% specificity). Among the 38 (11%) invalid phenotypic results, LPA-plus identified 31 rifampicin- and isoniazid-susceptible isolates, one isoniazid-resistant and six as non-Mycobacterium tuberculosis complex.Conclusions:
LPA-plus showed excellent agreement (≥91%) and accuracy (≥99%). Implementing LPA-plus in our setting can speed up the diagnosis of multidrug-resistant tuberculosis, yield a significantly higher number of valid results than phenotypic drug susceptibility testing and provide further information on the drug-resistance level.RESUMO
RESUMO Objetivo:
Avaliar o diagnóstico rápido de tuberculose multirresistente, utilizando um teste comercial de sondas em linha (LPA-plus), na rotina de um laboratório de referência de tuberculose.Métodos:
O teste LPA-plus foi avaliado prospectivamente em 341 isolados simultaneamente submetidos ao teste de suscetibilidade aos antimicrobianos em meio líquido, pelo sistema automatizado.Resultados:
Entre os 303 resultados fenotipicamente válidos, nenhum foi genotipicamente falso suscetível à rifampicina (13/13; 100% de sensibilidade). Dois isolados sensíveis à rifampicina apresentavam mutações no gene rpoB (288/290; especificidade de 99,3%), as quais, no entanto, não são associadas à resistência a rifampicina. O LPA-plus não identificou resistência à isoniazida em três isolados fenotipicamente resistentes (23/26; 88,5% de sensibilidade) e detectou todos os isolados sensíveis à isoniazida (277/277; especificidade de 100%). Entre os 38 (11%) resultados fenotípicos inválidos, o LPA-plus identificou 31 isolados sensíveis à rifampicina e à isoniazida, um resistente à isoniazida e seis como micobactérias não tuberculosas.Conclusões:
O LPA-plus mostrou excelente concordância (≥91%) e acurácia (≥99%). Sua implementação pode acelerar o diagnóstico da tuberculose multirresistente, produzir número significativamente maior de resultados válidos do que o teste fenotípico de suscetibilidade aos antimicrobianos e fornecer informações adicionais sobre o nível de resistência aos fármacos.
Full text:
Available
Index:
LILACS (Americas)
Main subject:
Phenotype
/
Rifampin
/
Time Factors
/
DNA, Bacterial
/
Microbial Sensitivity Tests
/
Prospective Studies
/
Reproducibility of Results
/
Sensitivity and Specificity
/
Tuberculosis, Multidrug-Resistant
/
Nucleic Acid Amplification Techniques
Type of study:
Diagnostic study
/
Observational study
/
Prognostic study
/
Screening study
Limits:
Adolescent
/
Adult
/
Aged
/
Aged80
/
Child
/
Child, preschool
/
Female
/
Humans
/
Infant
/
Male
Language:
English
Journal:
J. bras. pneumol
Journal subject:
Pulmonary Disease (Specialty)
Year:
2019
Type:
Article
Affiliation country:
Brazil
Institution/Affiliation country:
Estado de São Paulo/BR
/
Instituto Adolfo Lutz/BR
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