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Speeding up the diagnosis of multidrug-resistant tuberculosis in a high-burden region with the use of a commercial line probe assay / Agilizando o diagnóstico da tuberculose multirresistente em uma região endêmica com o uso de um teste comercial de sondas em linha
Brandao, Angela Pires; Pinhata, Juliana Maira Watanabe; Oliveira, Rosangela Siqueira; Galesi, Vera Maria Neder; Caiaffa-Filho, Helio Hehl; Ferrazoli, Lucilaine.
  • Brandao, Angela Pires; Instituto Adolfo Lutz. São Paulo. BR
  • Pinhata, Juliana Maira Watanabe; Instituto Adolfo Lutz. São Paulo. BR
  • Oliveira, Rosangela Siqueira; Instituto Adolfo Lutz. São Paulo. BR
  • Galesi, Vera Maria Neder; Estado de São Paulo. Centro de Vigilância Epidemiológica. São Paulo. BR
  • Caiaffa-Filho, Helio Hehl; Instituto Adolfo Lutz. São Paulo. BR
  • Ferrazoli, Lucilaine; Instituto Adolfo Lutz. São Paulo. BR
J. bras. pneumol ; 45(2): e20180128, 2019. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1002440
ABSTRACT
ABSTRACT

Objective:

To evaluate the rapid diagnosis of multidrug-resistant tuberculosis, by using a commercial line probe assay for rifampicin and isoniazid detection (LPA-plus), in the routine workflow of a tuberculosis reference laboratory.

Methods:

The LPA-plus was prospectively evaluated on 341 isolates concurrently submitted to the automated liquid drug susceptibility testing system.

Results:

Among 303 phenotypically valid results, none was genotypically rifampicin false-susceptible (13/13; 100% sensitivity). Two rifampicin-susceptible isolates harboured rpoB mutations (288/290; 99.3% specificity) which, however, were non-resistance-conferring mutations. LPA-plus missed three isoniazid-resistant isolates (23/26; 88.5% sensitivity) and detected all isoniazid-susceptible isolates (277/277; 100% specificity). Among the 38 (11%) invalid phenotypic results, LPA-plus identified 31 rifampicin- and isoniazid-susceptible isolates, one isoniazid-resistant and six as non-Mycobacterium tuberculosis complex.

Conclusions:

LPA-plus showed excellent agreement (≥91%) and accuracy (≥99%). Implementing LPA-plus in our setting can speed up the diagnosis of multidrug-resistant tuberculosis, yield a significantly higher number of valid results than phenotypic drug susceptibility testing and provide further information on the drug-resistance level.
RESUMO
RESUMO

Objetivo:

Avaliar o diagnóstico rápido de tuberculose multirresistente, utilizando um teste comercial de sondas em linha (LPA-plus), na rotina de um laboratório de referência de tuberculose.

Métodos:

O teste LPA-plus foi avaliado prospectivamente em 341 isolados simultaneamente submetidos ao teste de suscetibilidade aos antimicrobianos em meio líquido, pelo sistema automatizado.

Resultados:

Entre os 303 resultados fenotipicamente válidos, nenhum foi genotipicamente falso suscetível à rifampicina (13/13; 100% de sensibilidade). Dois isolados sensíveis à rifampicina apresentavam mutações no gene rpoB (288/290; especificidade de 99,3%), as quais, no entanto, não são associadas à resistência a rifampicina. O LPA-plus não identificou resistência à isoniazida em três isolados fenotipicamente resistentes (23/26; 88,5% de sensibilidade) e detectou todos os isolados sensíveis à isoniazida (277/277; especificidade de 100%). Entre os 38 (11%) resultados fenotípicos inválidos, o LPA-plus identificou 31 isolados sensíveis à rifampicina e à isoniazida, um resistente à isoniazida e seis como micobactérias não tuberculosas.

Conclusões:

O LPA-plus mostrou excelente concordância (≥91%) e acurácia (≥99%). Sua implementação pode acelerar o diagnóstico da tuberculose multirresistente, produzir número significativamente maior de resultados válidos do que o teste fenotípico de suscetibilidade aos antimicrobianos e fornecer informações adicionais sobre o nível de resistência aos fármacos.
Subject(s)


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Phenotype / Rifampin / Time Factors / DNA, Bacterial / Microbial Sensitivity Tests / Prospective Studies / Reproducibility of Results / Sensitivity and Specificity / Tuberculosis, Multidrug-Resistant / Nucleic Acid Amplification Techniques Type of study: Diagnostic study / Observational study / Prognostic study / Screening study Limits: Adolescent / Adult / Aged / Aged80 / Child / Child, preschool / Female / Humans / Infant / Male Language: English Journal: J. bras. pneumol Journal subject: Pulmonary Disease (Specialty) Year: 2019 Type: Article Affiliation country: Brazil Institution/Affiliation country: Estado de São Paulo/BR / Instituto Adolfo Lutz/BR

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LILACS

LIS


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Phenotype / Rifampin / Time Factors / DNA, Bacterial / Microbial Sensitivity Tests / Prospective Studies / Reproducibility of Results / Sensitivity and Specificity / Tuberculosis, Multidrug-Resistant / Nucleic Acid Amplification Techniques Type of study: Diagnostic study / Observational study / Prognostic study / Screening study Limits: Adolescent / Adult / Aged / Aged80 / Child / Child, preschool / Female / Humans / Infant / Male Language: English Journal: J. bras. pneumol Journal subject: Pulmonary Disease (Specialty) Year: 2019 Type: Article Affiliation country: Brazil Institution/Affiliation country: Estado de São Paulo/BR / Instituto Adolfo Lutz/BR