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Chromosomal distribution of the retroelements Rex 1, Rex 3 and Rex 6 in species of the genus Harttia and Hypostomus (Siluriformes: Loricariidae)
Traldi, Josiane B; Lui, Roberto L; Martinez, Juliana de F; Vicari, Marcelo R; Nogaroto, Viviane; Moreira Filho, Orlando; Blanco, Daniel R.
  • Traldi, Josiane B; Universidade Federal do Amazonas. Departamento de Genética. Manaus. BR
  • Lui, Roberto L; Universidade Estadual do Oeste do Paraná. Centro de Ciências Biológicas e da Saúde. Cascavel. BR
  • Martinez, Juliana de F; Universidade Federal de São Carlos. Departamento de Genética e Evolução. São Carlos. BR
  • Vicari, Marcelo R; Universidade Estadual de Ponta Grossa. Departamento de Biologia Estrutural, Molecular e Genética. Ponta Grossa. BR
  • Nogaroto, Viviane; Universidade Estadual de Ponta Grossa. Departamento de Biologia Estrutural, Molecular e Genética. Ponta Grossa. BR
  • Moreira Filho, Orlando; Universidade Federal de São Carlos. Departamento de Genética e Evolução. São Carlos. BR
  • Blanco, Daniel R; Universidade Tecnológica Federal do Paraná. Campus Santa Helena. Santa Helena. BR
Neotrop. ichthyol ; 17(2): e190010, 2019. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1012708
ABSTRACT
The transposable elements (TE) have been widely applied as physical chromosome markers. However, in Loricariidae there are few physical mapping analyses of these elements. Considering the importance of transposable elements for chromosomal evolution and genome organization, this study conducted the physical chromosome mapping of retroelements (RTEs) Rex1, Rex3 and Rex6 in seven species of the genus Harttia and four species of the genus Hypostomus, aiming to better understand the organization and dynamics of genomes of Loricariidae species. The results showed an intense accumulation of RTEs Rex1, Rex3 and Rex6 and dispersed distribution in heterochromatic and euchromatic regions in the genomes of the species studied here. The presence of retroelements in some chromosomal regions suggests their participation in various chromosomal rearrangements. In addition, the intense accumulation of three retroelements in all species of Harttia and Hypostomus, especially in euchromatic regions, can indicate the participation of these elements in the diversification and evolution of these species through the molecular domestication by genomes of hosts, with these sequences being a co-option for new functions.(AU)
RESUMO
Os elementos transponíveis (TE) têm sido amplamente aplicados como marcadores cromossômicos. Contudo, em Loricariidae, há poucas análises de mapeamento físico destes elementos. Considerando a importância de elementos transponíveis para a evolução cromossômica e organização genômica, este trabalho realizou o mapeamento físico cromossômico dos retroelementos (RTEs) Rex1, Rex3 e Rex6 em sete espécies do gênero Harttia e em quatro espécies do gênero Hypostomus, com o intuito de melhor compreender a organização e dinâmica dos genomas das espécies de Loricariidae. Os resultados evidenciaram um intenso acúmulo dos RTEs Rex1, Rex3 e Rex6 e distribuição dispersa em regiões heterocromáticas e eucromáticas no genoma das espécies estudadas. A presença de retroelementos em algumas regiões cromossômicas sugere sua participação em vários rearranjos cromossômicos. Além disso, o intenso acúmulo dos três retroelementos em todas as espécies de Harttia e Hypostomus, especialmente em regiões eucromáticas, pode indicar a participação destes elementos na diversificação e evolução destas espécies através da domesticação molecular pelo genoma dos hospedeiros, com estas sequências sendo co-optadas paras novas funções.(AU)
Subject(s)


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Catfishes / Genes, pX / In Situ Hybridization Limits: Animals Language: English Journal: Neotrop. ichthyol Year: 2019 Type: Article Institution/Affiliation country: Universidade Estadual de Ponta Grossa/BR / Universidade Estadual do Oeste do Paraná/BR / Universidade Federal de São Carlos/BR / Universidade Federal do Amazonas/BR / Universidade Tecnológica Federal do Paraná/BR

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