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Genoma mitocondrial de Simulium spp. e Onchocerca volvulus na Amazônia brasileira / Mitochondrial genome of Simulium spp. and Onchocerca volvulus in the Brazilian Amazon
Rio de Janeiro; s.n; 2018. 59 p. ilus.
Thesis in Portuguese | LILACS | ID: biblio-1026261
RESUMO
As espécies de simulídeos são vetores de filárias, como as do gênero Onchocerca e Mansonella, que são os agentes etiológicos da oncocercose e mansonellose, respectivamente. Essas duas filárias ocorrem na região Amazônica brasileira e são transmitidas pelas seguintes espécies de vetores Simulium incrustatum, S. limbatum, S. oyapockense, S. exiguum, S. guianense, e S. roraimense. As espécies de Simulium tem sido designada com base em caracteres morfológicos, os quais, em alguns casos, não são bem discriminativos. Recentemente, o gene mitocondrial Citocromo c-oxidase 1 (CO1) e a região nuclear Internal Transcribed Spacer (ITS) tem sido utilizados para descriminar espécies e definir populações dentro deste gênero. Entretanto, existe um grande gap acerca da informação genética de Simulium, o qual é considerado a linha de base para estudos ecológicos e populacionais. Considerando este cenário, nosso objetivo foi aplicar a metagenômica para recuperar genomas mitocondriais de amostras brasileiras S. incrustatum e S. oyapockense do foco de oncocercose e também a informação genética a respeito de seus microbiomas. O DNA total de dez simulídeos, morfologicamente identificados como S. incrustatum (3) e S. oyapockense (7) foram sequenciados randomicamente na plataforma Illumina HiSeq 2500. Nós recuperamos dez genomas mitocondriais com cobertura média de 15,591 bp e conteúdo médio de GC de 22,94 %, apresentando o mesmo conteúdo gênico e em sintenia. Baseado nestes mitogenomas, no gene mitocondrial CO1, e também na região nuclear (ITS), realizamos análises filogenéticas que mostraram a presença de três espécies conhecidas dentre as amostras S. incrustatum, S. oyapockense e S. guianense, e também um grupo de amostras pertencentes à Simulium spp. Nós também recuperamos um genoma mitocondrial de Onchocerca volvulus da amostra aqui identificada como S. guianense.
Subject(s)
Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Onchocerciasis / Simuliidae / Onchocerca volvulus / Genome, Mitochondrial / Metagenomics Limits: Animals Country/Region as subject: South America / Brazil Language: Portuguese Year: 2018 Type: Thesis

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LILACS

LIS

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