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LEPR polymorphisms and haplotypes in Mexican patients with colorectal cancer / Polimorfismos y haplotipos del gen LEPR en pacientes mexicanos con cáncer colorrectal
Departamento de Ciencias MédicasPartida, Miriam; Gutiérrez, Melva; Ayala, María de la Luz; Laboratorio de Genética HumanaMacías, Nelly Margarita; Alvizo, Carlos Rogelio; Departamento de Biología Celular y MolecularPeregrina, Jorge.
  • Departamento de Ciencias MédicasPartida, Miriam; Universidad de Guadalajara. Centro Universitario de Ciencias de la Salud. Departamento de Ciencias MédicasPartida, Miriam. Puerto Vallarta. MX
  • Gutiérrez, Melva; Universidad de Guadalajara. Centro Universitario de Ciencias de la Salud. Guadalajara. MX
  • Ayala, María de la Luz; Universidad de Guadalajara. Centro Universitario de Ciencias de la Salud. Guadalajara. MX
  • Laboratorio de Genética HumanaMacías, Nelly Margarita; Universidad de Guadalajara. Centro Universitario del Sur. Laboratorio de Genética HumanaMacías, Nelly Margarita. Ciudad Guzmán. MX
  • Alvizo, Carlos Rogelio; Universidad de Guadalajara. Centro Universitario de Ciencias de la Salud. Guadalajara. MX
  • Departamento de Biología Celular y MolecularPeregrina, Jorge; Universidad de Guadalajara. Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Departamento de Biología Celular y MolecularPeregrina, Jorge. Zapopán. MX
Biomédica (Bogotá) ; 39(1): 205-211, ene.-mar. 2019. tab
Article in English | LILACS | ID: biblio-1038799
ABSTRACT
Abstract

Introduction:

Obesity and colorectal cancer could be linked by adipocytokines, which are proteins associated with cell proliferation. High levels of the adipocytokine leptin promote the development of colorectal cancer through its receptor.

Objective:

To determine the association between c.326A>G and c.668A>G LEPR gene polymorphisms and colorectal cancer. Materials and

methods:

DNA was extracted from the peripheral blood of 147 patients with sporadic colorectal cancer and 134 healthy people. Genotypes were obtained by PCR- RFLP and the association was determined by the odds ratio (OR) test using the SPSS™, version 10.0, program. Haplotype frequencies and linkage disequilibrium were estimated by the Arlequin, version 3.5, software.

Results:

Both polymorphisms were in Hardy-Weinberg equilibrium. Only the c.326A>G heterozygous genotype revealed an increased risk for colorectal cancer development (OR=1.81, 95% CI=1.04-3.16, p=0.04). The AG haplotype showed a significant association with colorectal cancer (OR=0.58, 95% CI=0.35-0.96, p<0.03). Linkage disequilibrium between the variants was only evident for the patients group (r2=0.36).

Conclusion:

Our results suggest that AG individuals heterozygous for the c.326A>G LEPR variant have a higher risk of colorectal cancer development whereas the AG haplotype (c.326A/c.668G) has a protective effect in the Mexican population.
RESUMEN
Resumen Introducción. La relación entre la obesidad y el cáncer colorrectal podría estar dada por las adipocitocinas, proteínas asociadas con la proliferación celular. Los niveles elevados de la adipocitocina leptina promueven el desarrollo del cáncer colorrectal a través de su receptor. Objetivo. Determinar la asociación de los polimorfismos c.326A>G y c.668A>G del gen LEPR con el cáncer colorrectal. Materiales y métodos. A partir de sangre periférica, se extrajo el ADN de 147 pacientes con cáncer colorrectal esporádico y de 134 personas sanas. La genotipificación se hizo mediante PCR-RFLP y la asociación se determinó por la odds ratio (OR) en el programa SPSS™, versión 10.0. Las frecuencias haplotípicas y el desequilibrio de ligamiento se estimaron utilizando el programa Arlequin, versión 3.5. Resultados. Ambos polimorfismos estaban en equilibrio de Hardy-Weinberg. Solo el genotipo heterocigoto c.326A>G reveló un mayor riesgo de desarrollar cáncer colorrectal (OR=1,81; IC95% 1,04-3,16; p=0,04). El haplotipo AG mostró una asociación significativa con este cáncer (OR=0,58; IC95% 0,35-0,96; p≤0,03) y el desequilibrio de ligamiento entre las variantes fue evidente únicamente en el grupo de pacientes (r2=0,36). Conclusión. Los resultados sugieren que los individuos heterocigotos con el haplotipo AG para la variante c.326A>G en el gen LEPR tenían un mayor riesgo de desarrollar cáncer colorrectal, en tanto que el haplotipo AG (c.326A/c.668G) tenía un efecto protector en la población mexicana.
Subject(s)


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Haplotypes / Colorectal Neoplasms / Polymorphism, Single Nucleotide / Receptors, Leptin Limits: Adult / Aged / Female / Humans / Male Country/Region as subject: Mexico Language: English Journal: Biomédica (Bogotá) Journal subject: Medicine Year: 2019 Type: Article Affiliation country: Mexico Institution/Affiliation country: Universidad de Guadalajara/MX

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Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Haplotypes / Colorectal Neoplasms / Polymorphism, Single Nucleotide / Receptors, Leptin Limits: Adult / Aged / Female / Humans / Male Country/Region as subject: Mexico Language: English Journal: Biomédica (Bogotá) Journal subject: Medicine Year: 2019 Type: Article Affiliation country: Mexico Institution/Affiliation country: Universidad de Guadalajara/MX