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Storage protein variability in natural populations of maté (Ilex paraguariensis) in Brazil / Variabilidade de proteínas de reserva em populações naturais de erva-mate (Ilex paraguariensis) no Brasil
Gregianini, Tatiana Schäffer; Winge, Helga.
  • Gregianini, Tatiana Schäffer; Laboratório Central da Secretaria de Saúde do Estado do Rio Grande do Sul (LACEN/SES-RS). Porto Alegre. BR
  • Winge, Helga; Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS). Departamento de Genética. Porto Alegre. BR
Ciênc. rural (Online) ; 49(2): e20180451, 2019. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1045283
Responsible library: BR1.1
ABSTRACT
ABSTRACT Samples of 168 maté trees (Ilex paraguariensis) from four natural populations of different states of Brazil (Rio Grande do Sul, Santa Catarina, Paraná and Mato Grosso do Sul) were analyzed for their variability in storage proteins seed, which were used to estimate the degree of differentiation among and within species, because are relatively stable during evolution. Data on band presence/absence from 80 different polypeptides were used to perform similarity coefficient of Jaccard. A high level of genetic variability was reported within sampled populations (SJ intra=0.374). Lower levels of diversity were observed between populations (SJ inter=0.308). Total genetic diversity of maté was Hsp=0.264 estimated by Shannon measure. Partition of that value disclosed that 95 % of the total diversity is within-population, and only 5% to between-populations. The phenogram based on King's distances indicates a certain degree of geographic differentiation. This represents the first study on storage protein variability in I. paraguariensis and guides the choice of the specimens to increment germoplasm banks and genetic improvement programs.
RESUMO
RESUMO A variabilidade de proteínas de reserva das sementes foi analisada em 168 árvores de quatro populações naturais de erva-mate (Ilex paraguariensis) dos estados brasileiros Rio Grande do Sul, Santa Catarina, Paraná e Mato Grosso do Sul. Estes marcadores foram utilizados para estimar o grau de diferenciação entre e dentro da espécie porque são relativamente estáveis ao longo da evolução. Dados sobre presença e ausência de bandas de 80 diferentes polipeptídios foram utilizados para calcular o coeficiente de similaridade de Jaccard. Encontramos alto grau de variabilidade genética dentro de cada uma das quatro populações de árvores (SJ intra=0.374). Menores níveis de diversidade foram observados entre as populações (SJ inter=0.308). A diversidade total da espécie Ilex foi Hsp=0,264, estimada pela medida de Shannon. A partição deste valor revelou que 95% da diversidade total é intrapopulacional, enquanto somente 5% é entre populações. O fenograma, baseado nas distâncias de King, indica certo grau de diferenciação geográfica. Este trabalho representa o primeiro estudo de variabilidade em proteínas de reserva de I. paraguariensis e pode ser utilizado para orientar a escolha de espécimes para compor bancos de germoplasma e programas de melhoramento genético da espécie.


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Country/Region as subject: South America / Brazil Language: English Journal: Ciênc. rural (Online) Journal subject: Sa£de Ambiental Year: 2019 Type: Article Affiliation country: Brazil Institution/Affiliation country: SES-RS)+BR / Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)/BR

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