The application of chromosome abnormality chip detection in male infertility / Aplicación de la detección de la anormalidad del cromosoma mediante biochips genéticos en la infertilidad masculina

ABSTRACT

OBJECTIVE: To discuss the application of microarray technology in the diagnosis of male infertility. METHODS: Sixteen loci, including a sex-determining region on the Y chromosome, were investigated by polymerase chain reaction (PCR) in infertile male patients. Chromosome abnormality chip with 180 000 probes was used to detect small deletion, small amplification and loss of heterozygosity. RESULTS: By PCR, nine of 103 infertile patients were found to have sequence-tagged site microdeletions. Microdeletions were not observed in control samples. The deletions detected by PCR were present in six azoospermic men (6/44, 13.6%) and in three oligoasthenoteratozoospermic (OATS) men (3/59, 5%). The overall frequency of microdeletions in infertile men was 8.7% (9/103). Chromosome abnormality chip detection 500+ detected more amplification or deletion in 51 infertile patients and the overall frequency of microdeletions in infertile men was 49.5% (51/103). CONCLUSION: Chromosome abnormality chip detection system provides a sensitive, economic and high-throughput method for detecting the deletion or amplification of genomic DNA sequences of infertile patients. Not only can it identify Yq deletions, but it can also find other chromosome abnormalities and facilitate the understanding of male infertility.

RESUMEN

OBJETIVO: Analizar la aplicación de la tecnología de los microarreglos en el diagnóstico de la infertilidad masculina. MÉTODOS: Dieciséis loci, incluyendo una región determinante del sexo en el cromosoma Y, fueron investigados mediante reacción en cadena de la polimerasa (RCP) en pacientes hombres con problemas de infertilidad. Un biochip de la anormalidad cromosómica, con 180000 sondas, fue utilizado a fin de detectar pequeñas delecciones, pequeñas amplificaciones y pérdidas de heterocigosidad. RESULTADOS: Por medio de la RCP, se halló que nueve de 103 pacientes con infertilidad presentaban microdelecciones de sitios de secuencia marcada. Las microdelecciones no fueron observadas en las muestras de control. Las delecciones detectadas mediante RCP, estuvieron presentes en seis hombres azoospérmicos (6/44, 13.6%) y en tres hombres con oligoastenoteratozoospermia (OAT) (3/59, 5%). La frecuencia general de las microdelecciones en los hombres infértiles fue 8.7% (9/103). La detección con biochip de la anormalidad cromosómica de 500+ detectó más amplificación y delección en 51 pacientes, y la frecuencia general de microdelecciones en los hombres infértiles fue 49.5% (51/103). CONCLUSIÓN: El sistema de detección de la anormalidad del cromosoma mediante biochips genéticos representa un método sensible, económico, y de alto rendimiento, para detectar la delección o amplificación de las secuencias genómicas de ADN de pacientes infértiles. Este método puede no sólo identificar las delecciones Yq, sino también hallar otras anormalidades cromosómicas, facilitando así la comprensión de la infertilidad en los hombres.