First report of Sugarcane mosaic virus in achira (Canna edulis Ker.) in Nariño, Colombia / Primer registro del Sugarcane mosaic virus en achira (Canna edulis Ker.) en Nariño, Colombia

ABSTRACT

ABSTRACT Achira (Canna edulis Ker.) is a cultivated species for handcrafted food products and starch production. In Colombia is estimated an achira cultivated area of 800 ha; in the department of Nariño there has been a disturbance of viral etiology, known by farmers as Streak Virus, due to its symptoms in the leaves, but without previous records in the area. The disease causes losses in performance, although they have not been established precisely. In order to clarify the nature of this pathology and the identity of the pathogen associated with the problem, an investigation was carried out at the University of Nariño, by means of molecular tests of PCR and RT-PCR, sequencing, serology and electron microscopy, of foliar samples collected in the producing areas. The most outstanding symptoms in affected tissues were yellow mosaic, mottled, chlorotic streak and ribs discoloration, among others. There were no cytoplasmic inclusions similar to those produced by Potyvirus, nor viral particles were observed, nor serology positive results, but it was possible to achieve the amplification of a cDNA fragment, with specific primers for Potyvirus and 98% of homology of the sequences with Sugarcane mosaic virus. This is the first SCMV report in achira in Nariño, Colombia.

RESUMEN

RESUMEN La achira (Canna edulis Ker.) es una especie utilizada para la producción de almidón y alimentos artesanales. En Colombia, se estima un área cultivada de 800ha; en el departamento de Nariño, se viene presentando un disturbio de etiología viral, conocido por los agricultores como el rayado, por sus síntomas en las hojas, pero sin registros previos en esta zona. La enfermedad causa pérdidas en el rendimiento, aunque no se ha establecido con precisión. Con el objetivo de esclarecer la naturaleza de dicha patología y la identidad del patógeno asociado al problema, en la Universidad de Nariño, se realizó una investigación, mediante pruebas moleculares de PCR y RT-PCR, secuenciación, serología y microscopía electrónica, de muestras foliares colectadas en las zonas productoras. Los síntomas más sobresalientes en tejidos afectados fueron mosaico amarillo, moteado, rayado clorótico, aclaramiento de nervaduras entre otros. No se detectaron inclusiones citoplasmáticas similares a las producidas por Potyvirus, ni se observaron partículas virales, tampoco hubo resultados positivos con serología, pero sí se logró amplificación de un fragmento de cDNA, con cebadores específicos para Potyvirus y homología de 98% de las secuencias con el virus Sugarcane mosaic virus SCMV. Este es el primer reporte de SCMV en achira en Nariño, Colombia.