Período de incubación e intervalo serial para COVID-19 en una cadena de transmisión en Bahia Blanca (Argentina) / Incubation period and serial interval of Covid-19 in a chain of infections in Bahia Blanca (Argentina)

RESUMEN

Resumen El objetivo de este trabajo es estimar el período de incubación y el intervalo serial de Covid-19 en una muestra de pacientes sintomáticos en la ciudad de Bahía Blanca durante marzo-mayo de 2020. Se registraron fechas de aparición de síntomas de casos primarios y secundarios y para los primeros 18 casos de transmisión local de SARS-Cov2 en Bahía Blanca (Argentina). La duración de la aparición de síntomas fue estimada suponiendo una distribución log normal. Para el intervalo serial se supuso una distribución gamma. Los parámetros fueron estimados por máxima verosimilitud. Del total de 18 casos de transmisión local analizados, 17% ocurrió en fase presintomática y asintomática. El período de incubación promedio es de 7.9 días (95% IC 4.6, 11.1) y de 7.5 días (95% IC 4.1, 10.9) si se toman los casos con mayor certidumbre sobre infectores y fechas de exposición. La mediana es 6.1 y 5.8 días respectivamente. La estimación puntual del intervalo serial es 6.8 días (95% IC 4.0-9.6) y 5.5 días (95% IC 2.8, 8.1) considerando solo los pares más fiables. La mediana del intervalo serial se ubica en 5.2 y 4.1 días respectivamente. La incubación y el intervalo serial podrían ser algo más largos en Bahía Blanca que en otras ciudades. La transmisión de asintomáticos y de pre-sintomáticos no es despreciable.

ABSTRACT

Abstract The objective of this work was to estimate the incubation period and the serial interval of Covid-19 from a sample of symptomatic patients in Bahia Blanca city during the period March-May 2020. We collected dates of illness onset for primary cases and secondary cases for the first 18 secondary patients infected with SARS-Cov-2. Estimations of incubation period are based on a log-normal distribution while we assume a Gamma distribution for the serial interval. In both cases maximum likelihood estimator was applied to estimate main parameters. Of the total of 18 cases of local transmission analyzed, 17% occurred in the presymptomatic and asymptomatic phase. The mean incubation period for symptomatic patients is 7.9 days (95%CI 4.6, 11.1) considering the full sample and 7.5 days (95%CI 4.1, 10.9) if the sample is restricted to the most certain cases. The median is 6.1 and 5.8 days respectively. The point estimation for the mean serial interval is 6.8 days (95%CI 4.0-9.6). or 5.5 days (95%CI 2.8, 8.1) for most certain pairs. The estimated median serial intervals were 5.2 and 4.1 days respectively. Comparisons with foreign estimates show that incubation period and serial interval could be longer in Bahia Blanca city than in other regions. Transmission from pre-symptomatic and asymptomatic is not negligible.