La acelerada búsqueda de candidatos terapéuticos contra SARS-CoV-2, métodos in silico: Revisión / The accelerated search for drug candidates against SARS-CoV-2, in silico methods: Review

RESUMEN

El reposicionamiento de fármacos como la derivatización química, que se han aplicado en los estudios de descubrimiento y diseño de fármacos contra el SARS-CoV-2, dependen del ciclo de vida del virus, las dianas moleculares identificadas y un diseño basado en su estructura e interacciones moleculares. Se realizó una revisión extensa en las bases de datos públicas e institucionales RSCB-Protein Data Bank, ZINC, NCBI (PubMed, PMC), PubChem, Science Direct e instituciones como CDC, NIH y revistas científicas especializadas sobre los avances en la búsqueda de nuevas moléculas contra el nuevo coronavirus basadas en estudios in silico, detectándose más de 40,000 publicaciones sobre SARS-CoV-2 y cerca de 200 relacionadas a dichos estudios, las consideradas más relevantes fueron analizadas e incluidas en este artículo. Su análisis evidencia el avance acelerado de las herramientas computacionales y fortaleza del diseño de fármacos asistido por computadora (in silico approach) para la generación de nuevas moléculas con posibilidad de ser activas contra COVID-19 y presenta las principales dianas moleculares sobre la que actúan estos agentes con potencial antiviral.

ABSTRACT

The search of new applications for approved drugs by the regulatory authorities around the world, as well as their chemical derivatization in the search for new and effective drugs against SARS-CoV-2 depends of the viral life cycle, action of the drug and a receptor-based design. We performed a deep bibliographic research in peer reviewed scientific journals, data bases RSCB-Protein Data Bank, ZINC, NCBI (PubMed, PMC), PubChem, Science Direct and institutions (CDC, NIH) in the search of new molecules tested in silico against the novel coronavirus. As a result, we found more than 40,000 research papers related to SARS-CoV-2 and nearby 200 look on in silico studies, taking into consideration for this work all the more relevant for us, evidenced the accelerated advance and strength of the drug design assisted by computer (in silico approach) to develop new molecules that can be effective against COVID-19 and, at the same time, it exposes the main molecular targets.