Genotipos de Echinococcus granulosus en hidatidosis humana alrededor del mundo: revisión sistemática / Echinococcus granulosus genotypes verified in human hydatid disease around the world: systematic review

RESUMEN

Resumen Introducción: La evidencia sobre las características genotípicas de la infección por Echinococcus granulosus en humanos es escasa. Objetivo: Desarrollar un resumen de la evidencia disponible respecto a genotipos de E. granulosus verificados en hidatidosis humana en el mundo. Material y Métodos: Revisión sistemática. Se incluyeron artículos relacionados con genotipos de E. granulosus, en humanos, sin restricción de lenguaje ni método de secuenciación; publicados entre 1990-2019. Se realizó una búsqueda sistemática en WoS, EMBASE, MEDLINE, SCOPUS, Trip Database, BIREME, SciELO, LILACS, IBECS y OPS-OMS. Las variables en estudio fueron año de publicación, país de origen, número de muestras, órganos parasitados, marcador molecular utilizado y genotipo identificado. Se aplicó estadística descriptiva. Resultados: Se identificaron 701 artículos relacionados; 62 cumplieron los criterios de selección, representando 1.511 muestras. La evidencia existente fue publicada entre 1994 y 2019 y proviene principalmente de Irán (45,2%). El método de secuenciación más utilizado fue amplificación por reacción de polimerasa en cadena más secuenciación tipo Sanger con genotipificación del gen cox1 (79,0%). Los genotipos identificados con mayor frecuencia fueron G1 (49,1%) y el complejo G1/G3 (32,2%). Conclusión: Las publicaciones relacionadas con genotipos de E. granulosus en humanos son escasas y heterogéneas. Eg G1 representa la mayor parte de la carga global mundial.

ABSTRACT

Abstract Background: The evidence regarding genotypic characteristics of Echinococcus granulosus infection in humans worldwide is scarce. Aim: To develop a synthesis of the available evidence regarding genotypes of E. granulosus verified in humans worldwide. Methods: Systematic review. Articles related with genotypes of E. granulosus, in humans, without language neither genotyped method restriction, published between 1990-2019 were included. A systematic in WoS, EMBASE, MEDLINE, SCOPUS, Trip Database, BIREME, SciELO, LILACS, IBECS, and PAHO-WHO was carried out. In study variables were year of publication, country, number of samples, host and parasite organs, genotype identified, molecular marker and genes. Descriptive statistics were applied. Results: 701 related articles were identified; 62 fulfilled selection criteria, representing 1,511 samples. The existing evidence was published between 1994 and 2019; and mainly comes from Iran (45.2%). The most commonly used sequencing method was PCR amplification and Sanger type sequencing with partial or total genotyping of the cox1 gene. Genotyped method most frequently used was cox1 (79,0%). Genotypes most frequently identified were G1 and G1/G3 complex (49.1% and 32.2%). Conclusions: Publications related to genotypes of Eg in humans are scarce, heterogeneous, and presenting differing results. Eg G1/G3 accounts for most of the global burden worldwide.