Your browser doesn't support javascript.
loading
Genomic analysis on Brazilian strains of Anaplasma marginale / Análise genômica de cepas Brasileiras de Anaplasma marginale
DallAgnol, Bruno; Webster, Anelise; Souza, Ugo Araújo; Barbieri, Antonela; Mayer, Fabiana Quoos; Cardoso, Gisele Antoniazzi; Torres, Tatiana Teixeira; Machado, Rosangela Zacarias; Ferreira, Carlos Alexandre Sanchez; Reck, José.
  • DallAgnol, Bruno; Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor. Centro de Pesquisa em Saúde Animal. Eldorado do Sul. BR
  • Webster, Anelise; Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor. Centro de Pesquisa em Saúde Animal. Eldorado do Sul. BR
  • Souza, Ugo Araújo; Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor. Centro de Pesquisa em Saúde Animal. Eldorado do Sul. BR
  • Barbieri, Antonela; Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor. Centro de Pesquisa em Saúde Animal. Eldorado do Sul. BR
  • Mayer, Fabiana Quoos; Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor. Centro de Pesquisa em Saúde Animal. Eldorado do Sul. BR
  • Cardoso, Gisele Antoniazzi; Universidade de São Paulo. Instituto de Biociências. São Paulo. BR
  • Torres, Tatiana Teixeira; Universidade de São Paulo. Instituto de Biociências. São Paulo. BR
  • Machado, Rosangela Zacarias; Universidade Estadual Paulista. Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Jaboticabal. BR
  • Ferreira, Carlos Alexandre Sanchez; Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. Escola de Ciências da Saúde e da Vida. Porto Alegre. BR
  • Reck, José; Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor. Centro de Pesquisa em Saúde Animal. Eldorado do Sul. BR
Rev. bras. parasitol. vet ; 30(2): e000421, 2021. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1251386
ABSTRACT
Abstract Anaplasma marginale is a vector-borne pathogen that causes a disease known as anaplasmosis. No sequenced genomes of Brazilian strains are yet available. The aim of this work was to compare whole genomes of Brazilian strains of A. marginale (Palmeira and Jaboticabal) with genomes of strains from other regions (USA and Australia strains). Genome sequencing of Brazilian strains was performed by means of next-generation sequencing. Reads were mapped using the genome of the Florida strain of A. marginale as a reference sequence. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) and insertions/deletions (INDELs) were identified. The data showed that two Brazilian strains grouped together in one particular clade, which grouped in a larger American group together with North American strains. Moreover, some important differences in surface proteins between the two Brazilian isolates can be discerned. These results shed light on the evolutionary history of A. marginale and provide the first genome information on South American isolates. Assessing the genome sequences of strains from different regions is essential for increasing knowledge of the pan-genome of this bacteria.
RESUMO
Resumo Anaplasma marginale é um patógeno transmitido por vetores que causam uma doença conhecida como anaplasmose. Até a presente data, não há genomas sequenciados de cepas brasileiras. O objetivo deste estudo foi comparar o genoma completo das cepas brasileiras de A. marginale (Palmeira e Jaboticabal) com os genomas de cepas de outras regiões (cepas dos EUA e Austrália). As sequências dos genomas das cepas brasileiras foram obtidas mediante sequenciamento de nova geração. As "reads" foram mapeadas usando-se como referência o genoma de A. marginale da cepa Florida. Foram identificados polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e analisadas inserções/deleções (INDELs). As duas linhagens brasileiras se agruparam em um clado particular que, por sua vez, agrupou-se em um grupo maior junto com as linhagens norte-americanas. Além disso, foram identificadas diferenças significativas nas proteínas de superfície entre os dois isolados brasileiros. Esses resultados lançam luz sobre a história evolutiva de A. marginale e fornecem as primeiras informações de genomas de isolados sul-americanos. Avaliar as sequências de genomas de cepas de diferentes regiões é essencial para aumentar o conhecimento do pan-genoma dessa bactéria.
Subject(s)


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Cattle Diseases / Anaplasma marginale / Anaplasmosis Type of study: Prognostic study Limits: Animals Country/Region as subject: South America / Brazil Language: English Journal: Rev. bras. parasitol. vet Journal subject: Veterinary Medicine / Parasitology Year: 2021 Type: Article Affiliation country: Brazil Institution/Affiliation country: Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor/BR / Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul/BR / Universidade Estadual Paulista/BR / Universidade de São Paulo/BR

Similar

MEDLINE

...
LILACS

LIS


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Cattle Diseases / Anaplasma marginale / Anaplasmosis Type of study: Prognostic study Limits: Animals Country/Region as subject: South America / Brazil Language: English Journal: Rev. bras. parasitol. vet Journal subject: Veterinary Medicine / Parasitology Year: 2021 Type: Article Affiliation country: Brazil Institution/Affiliation country: Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor/BR / Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul/BR / Universidade Estadual Paulista/BR / Universidade de São Paulo/BR