Estudo de linhagens genética do vírus da raiva específicas aos morcegos desmodus rotundus e artibeus lituratus / Study of rabies virus genetic lines specific to desmodus rotundus and artibeus lituratus bats

RESUMO

No Estado de São Paulo, a linhagem Desmodus rotundus/Artibeus lituratus é prevalente em bovinos e equídeos na área rural, transmitida por D. rotundus, enquanto na área urbana ela é prevalente em cães e gatos, transmitida principalmente A. lituratus. Estudo baseado no gene N e G do RABV evidenciou uma possível diferenciação dessa linhagem. Com o objetivo de diferenciar a linhagem Desmodus rotundus/Artibeus lituratus utilizando todos os genes, foram utilizadas 90 amostras positivas para a raiva, 46 relacionadas epidemiologicamente à D. rotundus e 44 A. lituratus, todas do Estado de São Paulo. Essas amostras foram submetidas a síntese de DNAs randômicos dupla fita, NGS, as sequências foram montadas com software CLCBio e as árvores filogenéticas foram elaboradas por ML utilizando o programa GARLI v.0.96. Os resultados monstraram que os isolados da linhagem Desmodus rotundus/Artibeus lituratus foram agrupados em quatro sublinhagens filogenéticas, duas associadas ao D. rotundus e duas ao A. lituratus. A árvore filogenética com todos os genes concatenados mostra que a sublinhagem Artibeus 1 foi a primeira a se diferenciar, seguida da linhagem Desmodus 1. Desmodus 2 e Artibeus 2 são sublinhagens irmãs, sendo as últimas a se diferenciarem. Na análise filogenética do gene N com isolados da América Latina, todas as sublinhagens desse estudo tinham a mesma origem, mas diversos isolados de bovinos e D.