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Patrones de frecuencias en 100 marcadores informativos de ancestría entre dos etnias indígenas y dos poblaciones mestizas de Colombia / Frequency pattern analysis of 100 ancestry informative markers between two ethnics groups and two populations of Colombia
Ángel, Criollo-Rayo; Carlos, Puentes; Mabel, Bohórquez; Ángel, Carracedo; Luis, Carvajal; Ian, Tomlinson; María Magdalena, Echeverry.
  • Ángel, Criollo-Rayo; Facultades de Ciencias y Facultad de Ciencias de la Salud-Universidad del Tolima. Ibagué. CO
  • Carlos, Puentes; Facultades de Ciencias y Facultad de Ciencias de la Salud-Universidad del Tolima. Ibagué. CO
  • Mabel, Bohórquez; Facultades de Ciencias y Facultad de Ciencias de la Salud-Universidad del Tolima. Ibagué. CO
  • Ángel, Carracedo; Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica (SERGAS)-CIBERER, Universidade de Santiago de Compostela. Santiago de Compostela. ES
  • Luis, Carvajal; Genome Center, Department of Biochemistry and Molecular Medicine, School of Medicine- University of California. California. US
  • Ian, Tomlinson; The Wellcome Trust Centre for Human Genetics, University of Oxford. Oxford. GB
  • María Magdalena, Echeverry; Facultades de Ciencias y Facultad de Ciencias de la Salud-Universidad del Tolima. Ibagué. CO
Rev. Asoc. Colomb. Cien. Biol. (En línea) ; 1(31): 118-126, 2019. graf, ilus
Article in Spanish | LILACS, COLNAL | ID: biblio-1379094
RESUMEN
Colombia es el segundo país con mayor cantidad de etnias Amerindias del continente gracias a su ubicación geográfica y a que se encuentra en el Noroccidente del continente Sur Americano tuvo que haber sido un corredor para las migraciones de los Amerindios. Pero debido a la mezcla amerindia, europea y africana, ocurrida en diferentes proporciones a lo largo del país hubo cambios en las dinámicas poblacionales. Ojetivo se caracterizó molecularmente una muestra indígena proveniente de dos etnias ­ Pijao y Nasa Paez, - y otra muestra de individuos mestizos no relacionados del Tolima; con el fin de identificar heterocigocidad, frecuencias alélicas y distancias Fst, mediante el análisis de 100 marcadores informativos de ancestría (SNPs autosómicos).

Metodología:

Para la realización de este estudio se obtuvo ADN a partir de muestras de sangre tomadas en personas indígenas y mestizas de las regiones ya mencionadas, para tipificar 100 SNPs autosómicos o Marcadores de informativos de Ancestría (AIMs).

Resultados:

los análisis de la Heterocigocidad (Het) mostraron que los valores bajos se presentaban en las etnias indígenas Nasa (0,181) y Pijaos (0,250), mientras que los de Planadas (0,402) e Ibagué (0,415) presentaron los valores altos. Los análisis realizados de manera global mostraron que las poblaciones del Tolima son menos heterocigotas que las poblaciones ancestrales.

Conclusiones:

La población nativa Nasa, es la de mayor conservación de la variación nativa ancestral reflejada con los análisis de heterocigocidad y posee una mayor distancia genética con respecto a las poblaciones mestizas.
ABSTRACT
Colombia is the second country with the largest number of amerindian ethnic groups on the continent thanks to its geographical location and that it is located in the Northwest of the South American continent, it had to have been a corridor for the Amerindian migrations. But due to the Amerindian, European and African mix, which occurred in different proportions throughout the country, there were changes in population dynamics.

Objective:

an indigenous sample from two ethnic groups - Pijao and Nasa Paez, was molecularly characterized - and another sample of unrelated mestizo individuals from Tolima; to identify heterozygosity, allelic frequencies and Fst distances, by analyzing 100 informative markers of ancestry (autosomal SNPs).

Methodology:

To carry out this study, DNA was obtained from blood samples taken in indigenous and mestizo people from the aforementioned regions, to typify 100 autosomal SNPs or ancestry informative markers (AIMs).

Results:

Heterozygous (Het) analyzes showed that low values were presented in the Nasa (0,181) and Pijaos (0,250) indigenous ethnic groups, while those of Planadas (0,402) and Ibagué (0,415) presented high values. Analyzes performed globally showed that Tolima populations are less heterozygous than ancestral populations.

Conclusions:

The Nasa native population is the one with the greatest conservation of the ancestral native variation reflected with the heterozygous analyzes and has a greater genetic distance concerning the mestizo populations.

Subject(s)


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Genetic Phenomena Type of study: Prognostic study Limits: Humans Country/Region as subject: South America / Colombia Language: Spanish Journal: Rev. Asoc. Colomb. Cien. Biol. (En línea) Journal subject: Ciˆncia Ambiental / Desenvolvimento Sustent vel / Disciplinas das Ciˆncias Biol¢gicas Year: 2019 Type: Article Affiliation country: Colombia / Spain / United States / United kingdom Institution/Affiliation country: Facultades de Ciencias y Facultad de Ciencias de la Salud-Universidad del Tolima/CO / Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica (SERGAS)-CIBERER, Universidade de Santiago de Compostela/ES / Genome Center, Department of Biochemistry and Molecular Medicine, School of Medicine- University of California/US / The Wellcome Trust Centre for Human Genetics, University of Oxford/GB

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LILACS

LIS


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