Reverse-Transcription Loop-Mediated Isothermal Amplification and alternative protocols for lower cost, large-scale COVID-19 testing: lessons from an emerging economy / Amplificación isotérmica mediada por bucle de transcripción inversa y protocolos alternativos para pruebas COVID-19 a gran escala y de bajo costo: lecciones de una economía emergente
Rev. biol. trop
;
70(1)dic. 2022.
Article
in English
| LILACS, SaludCR
| ID: biblio-1387718
ABSTRACT
Abstract Introduction:
Most successful cases of COVID-19 pandemic mitigation and handling have relied on extensive reverse-transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). However, many emerging economies have struggled with current molecular testing demands due to economic, technical and technological constraints.Objective:
To define a potential diagnostic protocol to increase testing capacity in current and post-pandemic conditions.Methods:
We reviewed the literature, patents and commercial applications, for alternatives.Results:
We found a good potential in saliva samples, viral inactivation and quick RNA extraction by heating; the use of an isothermal technology such as loop mediated isothermal amplification (LAMP) and naked eye test-result visualization by in-tube colorimetry or turbidity.Conclusions:
Saliva samples with quick RNA extraction by heating and colorimetric LAMP are promising options for countries with economic and infrastructure limitations.RESUMEN
Resumen Introducción:
La mayoría de los casos exitosos de mitigación y manejo de la pandemia de COVID-19 se han dado mediante pruebas basadas en la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (RT-qPCR por sus siglas en inglés). Sin embargo, muchas economías emergentes han tenido problemas con las demandas actuales de pruebas moleculares debido a limitaciones económicas, técnicas y tecnológicas.Objetivo:
Definir un protocolo de diagnóstico potencial para aumentar la capacidad de prueba en las condiciones actuales y posteriores a la pandemia.Métodos:
Revisamos la literatura, las patentes y las aplicaciones comerciales, en busca de alternativas.Resultados:
Encontramos un buen potencial en muestras de saliva, inactivación viral y extracción rápida de ARN por calentamiento; el uso de una tecnología isotérmica como la amplificación isotérmica mediada por horquillas (LAMP, por sus siglas en inglés) y la visualización del resultado de la prueba a simple vista mediante colorimetría o turbidez en el tubo.Conclusiones:
Las muestras de saliva con extracción rápida de ARN por calentamiento y LAMP colorimétrico son opciones prometedoras para países con limitaciones económicas y de infraestructura.
Full text:
Available
Index:
LILACS (Americas)
Main subject:
Molecular Diagnostic Techniques
Type of study:
Diagnostic study
/
Practice guideline
/
Health economic evaluation
Language:
English
Journal:
Rev. biol. trop
Year:
2022
Type:
Article
Institution/Affiliation country:
Universidad de Costa Rica/CR
/
University of Illinois/US
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