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Evaluation of the design of the influenza-like illness sentinel surveillance system in Brazil / Evaluación del diseño de la vigilancia centinela de la enfermedad tipo influenza en Brasil / Avaliação do desenho da vigilância sentinela de síndrome gripal no Brasil
Freitas, Laís Picinini; Codeço, Cláudia Torres; Bastos, Leonardo Soares; Villela, Daniel Antunes Maciel; Cruz, Oswaldo Gonçalves; Pacheco, Antonio Guilherme; Coelho, Flavio Codeço; Lana, Raquel Martins; Carvalho, Luiz Max Fagundes de; Niquini, Roberta Pereira; Almeida, Walquiria Aparecida Ferreira de; Silva, Daiana Araújo da; Carvalho, Felipe Cotrim de; Gomes, Marcelo Ferreira da Costa.
  • Freitas, Laís Picinini; Fundação Oswaldo Cruz. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro. BR
  • Codeço, Cláudia Torres; Fundação Oswaldo Cruz. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro. BR
  • Bastos, Leonardo Soares; Fundação Oswaldo Cruz. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro. BR
  • Villela, Daniel Antunes Maciel; Fundação Oswaldo Cruz. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro. BR
  • Cruz, Oswaldo Gonçalves; Fundação Oswaldo Cruz. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro. BR
  • Pacheco, Antonio Guilherme; Fundação Oswaldo Cruz. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro. BR
  • Coelho, Flavio Codeço; Fundação Getulio Vargas. Escola de Matemática Aplicada. Rio de Janeiro. BR
  • Lana, Raquel Martins; Fundação Oswaldo Cruz. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro. BR
  • Carvalho, Luiz Max Fagundes de; Fundação Getulio Vargas. Escola de Matemática Aplicada. Rio de Janeiro. BR
  • Niquini, Roberta Pereira; Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro. BR
  • Almeida, Walquiria Aparecida Ferreira de; Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília. BR
  • Silva, Daiana Araújo da; Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília. BR
  • Carvalho, Felipe Cotrim de; Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília. BR
  • Gomes, Marcelo Ferreira da Costa; Fundação Oswaldo Cruz. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro. BR
Cad. Saúde Pública (Online) ; 40(6): e00028823, 2024. graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1564234
ABSTRACT
Abstract The influenza-like illness (ILI) sentinel surveillance operates in Brazil to identify respiratory viruses of public health relevance circulating in the country and was first implemented in 2000. Recently, the COVID-19 pandemic reinforced the importance of early detection of the circulation of new viruses in Brazil. Therefore, an analysis of the design of the ILI sentinel surveillance is timely. To this end, we simulated a sentinel surveillance network, identifying the municipalities that would be part of the network according to the criteria defined in the design of the ILI sentinel surveillance and, based on data from tested cases of severe acute respiratory illness (SARI) from 2014 to 2019, we drew samples for each sentinel municipality per epidemiological week. The draw was performed 1,000 times, obtaining the median and 95% quantile interval (95%QI) of virus positivity by Federative Unit and epidemiological week. According to the ILI sentinel surveillance design criteria, sentinel units would be in 64 municipalities, distributed mainly in capitals and their metropolitan areas, recommending 690 weekly samples. The design showed good sensitivity (91.65% considering the 95%QI) for qualitatively detecting respiratory viruses, even those with low circulation. However, there was important uncertainty in the quantitative estimate of positivity, reaching at least 20% in 11.34% of estimates. The results presented here aim to assist in evaluating and updating the ILI sentinel surveillance design. Strategies to reduce uncertainty in positivity estimates need to be evaluated, as does the need for greater spatial coverage.
RESUMEN
Resumen La vigilancia centinela de la enfermedad tipo infuenza (ETI) funciona en Brasil para identificar los virus respiratorios de importancia para la salud pública que circulan en el país y comenzó a ser implementada en 2000. Recientemente, la pandemia de COVID-19 ha reforzado la importancia de la detección temprana de la circulación de nuevos virus en el territorio brasileño. Así, se hace oportuno un análisis del diseño de la vigilancia centinela de la ETI. Para ello, simulamos una red centinela identificando los municipios que formarían parte de la red según los criterios definidos en el diseño de la vigilancia centinela de la ETI y, a partir de los datos de casos testados de infección respiratoria aguda grave (IRAG) de 2014 a 2019, se extrajeron muestras para cada municipio centinela por semana epidemiológica. El sorteo se repitió 1.000 veces y se obtuvo la mediana y el intervalo cuantílico del 95% (IC95%) de la positividad por virus, por Unidad Federativa y semana epidemiológica. Según los criterios del diseño de la vigilancia centinela de la ETI, unidades centinelas estarían en 64 municipios, distribuidas principalmente en capitales y zonas metropolitanas de las capitales, preconizando 690 muestras semanales. El diseño presentó una buena sensibilidad (total de 91,65% considerando el IC95%) para la detección cualitativa de los virus respiratorios, incluso los de baja circulación. Sin embargo, hubo una importante incertidumbre en la estimación cuantitativa de la positividad, alcanzando al menos el 20% en el 11,34% de las estimaciones. Los resultados presentados aquí tienen como objetivo ayudar en la evaluación y actualización del diseño de la red centinela. Es necesario evaluar las estrategias para reducir la incertidumbre en las estimaciones de positividad, al igual que la necesidad de una mayor cobertura espacial.
RESUMO
Resumo A vigilância sentinela de síndrome gripal atua no Brasil identificando os vírus respiratórios de importância para a saúde pública circulantes no país, e começou a ser implementada em 2000. Recentemente, a pandemia de COVID-19 reforçou a importância da detecção precoce de novos vírus em circulação no território brasileiro. Assim, se faz oportuna uma análise do desenho da vigilância sentinela de síndrome gripal. Para tal, simulamos uma rede sentinela, identificando os municípios que fariam parte da rede segundo os critérios definidos no desenho da vigilância sentinela de síndrome gripal, e, a partir dos dados de casos testados de síndrome respiratória aguda grave (SRAG) de 2014 a 2019, sorteamos amostras para cada município sentinela por semana epidemiológica. O sorteio foi repetido mil vezes, obtendo-se a mediana e intervalo quantílico de 95% (IQ95%) da positividade para cada vírus por Unidade Federativa e semana epidemiológica. Segundo os critérios do desenho da vigilância sentinela de síndrome gripal, unidades sentinelas estariam em 64 municípios, distribuídas principalmente em capitais e suas zonas metropolitanas, o que preconizou 690 amostras semanais. O desenho apresentou boa sensibilidade (total de 91,65%, considerando o IQ95%) para a detecção qualitativa dos vírus respiratórios, mesmo os de baixa circulação. Porém, houve importante incerteza na estimativa quantitativa de positividade, chegando a, pelo menos, 20% em 11,34% das estimativas. Os resultados aqui apresentados visam auxiliar a avaliação e a atualização do desenho da rede sentinela. Estratégias para reduzir a incerteza nas estimativas de positividade precisam ser avaliadas, assim como a necessidade de maior cobertura espacial.


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Country/Region as subject: South America / Brazil Language: English Journal: Cad. Saúde Pública (Online) Journal subject: Sa£de P£blica / Toxicologia Year: 2024 Type: Article Affiliation country: Brazil Institution/Affiliation country: Fundação Getulio Vargas/BR / Fundação Oswaldo Cruz/BR / Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Rio de Janeiro/BR / Ministério da Saúde/BR

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Full text: Available Index: LILACS (Americas) Country/Region as subject: South America / Brazil Language: English Journal: Cad. Saúde Pública (Online) Journal subject: Sa£de P£blica / Toxicologia Year: 2024 Type: Article Affiliation country: Brazil Institution/Affiliation country: Fundação Getulio Vargas/BR / Fundação Oswaldo Cruz/BR / Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Rio de Janeiro/BR / Ministério da Saúde/BR