Using ontologies to retrieve health evidence information from clinical notes / Uso de ontologias para recuperar informação de evidência em saúde a partir de notas clínicas / El uso de ontologías para recuperar información de evidencia em salud a partir de las notas clínicas

ABSTRACT

Objective: To present a strategy to search evidence databases directly from clinical notes, thus relieving health professionals from performing searches. Method: An ontology related to health domain, specifically for the domain of adult asthma, was developed to illustrate how to extract search terms from clinical notes. Another ontology was developed to describe evidence databases. Results: Synthetic notes, simulating clinical conditions for patients with respiratory diseases, were used to search information from two evidence databases, PubMed and PEDro. SPARQL queries were automatically generated to connect both ontologies. Conclusion: This scenario demonstrated how to search for evidence from electronic health records notes, helping health professionals to receive relevant information while they assist patients.

RESUMO

Objetivo: Apresentar uma estratégia para pesquisar bases de evidências a partir de notas clínicas, aliviando os profissionais de saúde da tarefa de elaborar buscas. Método: Uma ontologia no domínio da saúde, especificamente sobre asma em adultos, foi desenvolvida para ilustrar como obter informação para a estratégia de busca a partir das notas clínicas. Outra ontologia captura informações sobre as bases de evidências. Resultados: Notas sintéticas, simulando condições clínicas de pacientes com doenças respiratórias, foram utilizadas para buscar informação em duas bases de evidências distintas, PubMed e PEDro. Consultas em SPARQL foram automaticamente geradas para conectar as ontologias. Conclusão: Este cenário demonstrou a viabilidade de procurar por evidências a partir de registros eletrônicos de saúde, ajudando os profissionais de saúde a obter informações relevantes enquanto atendem pacientes.

RESUMEN

Objetivo: Presentar una estrategia para buscar bases de evidencia directamente de las notas clínicas, creadas en los registros electrónicos de salud, con ontologías para capturar conocimiento relacionado a la salud y a las bases de evidencia. Método: Una ontología, que se define para el dominio de la salud de asma del adulto, se utiliza para extraer información relevante de notas clínicas. Otra ontología captura información sobre bases de evidencia. Resultados: Notas simulando las condiciones clínicas para pacientes con enfermedades respiratorias se utilizaron para buscar información de dos bases de evidencia, PubMed y Pedro. Consultas SPARQL se generan automáticamente para conectar ambas ontologías. Conclusión: En este escenario se ha demostrado la viabilidad de la búsqueda de evidencia desde los registros electrónicos de salud, ayudando a los profesionales de salud para obtener información relevante al reunirse con pacientes.