Your browser doesn't support javascript.
loading
DNA barcoding confirms the occurrence of Rhamdia branneri and Rhamdia voulezi (Siluriformes: Heptapteridae) in the Iguaçu River Basin
Ribolli, Josiane; Scaranto, Bianca Maria; Shibatta, Oscar Akio; Bombardelli, Robie Allan; Zaniboni-Filho, Evoy.
  • Ribolli, Josiane; Universidade Federal de Santa Catarina. Laboratório de Biologia e Cultivo de Peixes de Água Doce. Florianópolis. BR
  • Scaranto, Bianca Maria; Universidade Federal de Santa Catarina. Laboratório de Biologia e Cultivo de Peixes de Água Doce. Florianópolis. BR
  • Shibatta, Oscar Akio; Universidade Estadual de Londrina. Centro de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Animal e Vegetal. Londrina. BR
  • Bombardelli, Robie Allan; Universidade Estadual do Oeste do Paraná. Toledo. BR
  • Zaniboni-Filho, Evoy; Universidade Federal de Santa Catarina. Laboratório de Biologia e Cultivo de Peixes de Água Doce. Florianópolis. BR
Neotrop. ichthyol ; 15(1): e160147, 2017. tab, ilus
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-841881
ABSTRACT
DNA barcoding is a widely utilized molecular-based identification of species and taxonomic resolutions. Until recently, Rhamdia voulezi and Rhamdia branneri were considered species synonyms of Rhamdia quelen; however, morphological and cytogenetic analyses have suggested the validity of distinct species. Due to the absence of molecular taxonomy of R. voulezi and R. branneri, the objective of this study was to test its validity through traditional DNA barcoding and the GMYC (General Mixed Yule Coalescent) COI-based analyses in 19 specimens from the Iguaçu River Basin. In both methodologies, three MOTUs (Molecular Operational Taxonomic Units) were identified based on the estimated optimum threshold (OT = 0.77). The average inter-MOTU distance (NJ, K2P) between R. branneri and R. voulezi was 1.4%, and 0% intra-MOTU distance in both species. The two species identified as R. branneri and R. voulezi showed correspondence with taxonomic and morphological identifications. With regard to R. quelen, the average intra-MOTU distance was greater than OT (2.7%), indicating that this species can be formed by different MOTUs. We suggest that molecular and taxonomic studies should be employed concurrently in R. quelen, to prevent contamination of wild species by hybridizations.(AU)
RESUMO
O DNA barcoding é uma ferramenta molecular precisa para a identificação de espécies e resoluções taxonômicas. Até recentemente, Rhamdia voulezi e Rhamdia branneri eram consideradas sinônimas de Rhamdia quelen, contudo caracteres morfológicos e citogenéticos têm apontado à validade de ambas. Devido à escassez de informações sobre a taxonomia molecular de R. voulezi e R. branneri, o objetivo do presente estudo foi testar a validade das mesmas através do método de DNA barcoding tradicional e GMYC (General Mixed Yule Coalescent), por meio da análise do gene COI em 19 espécimes do rio Iguaçu. Em ambos os métodos, três MOTUs (Unidades Taxonômicas Operacionais Moleculares) foram identificadas com base no ótimo threshold (OT = 0,77). A média inter-MOTU (NJ, K2P) entre R. branneri e R. voulezi foi 1,4%, com valores de 0% intra-MOTUs em ambas espécies. As duas espécies identificadas como R. voulezi e R. branneri apresentaram correspondência com a identificação taxonômica e morfológica dos respectivos vouchers. No que se refere a R. quelen, os resultados intra-MOTU foram superiores ao OT (2,7%), evidenciando a possibilidade de existirem diferentes MOTUs denominadas como R. quelen. Sugerimos que estudos moleculares e taxonômicos sejam empregados em R. quelen, para evitar a contaminação de espécies selvagens por hibridizações.(AU)
Subject(s)


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Catfishes / DNA Barcoding, Taxonomic Limits: Animals Language: English Journal: Neotrop. ichthyol Year: 2017 Type: Article / Project document Institution/Affiliation country: Universidade Estadual de Londrina/BR / Universidade Estadual do Oeste do Paraná/BR / Universidade Federal de Santa Catarina/BR

Similar

MEDLINE

...
LILACS

LIS


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Catfishes / DNA Barcoding, Taxonomic Limits: Animals Language: English Journal: Neotrop. ichthyol Year: 2017 Type: Article / Project document Institution/Affiliation country: Universidade Estadual de Londrina/BR / Universidade Estadual do Oeste do Paraná/BR / Universidade Federal de Santa Catarina/BR