Klebsiella variicola and Klebsiella quasipneumoniae with capacity to adapt to clinical and plant settings / Klebsiella variicola y Klebsiella quasipneumoniae con capacidad para adaptarse al ambiente clínico y a las plantas

ABSTRACT

Abstract Objective: To compare the genetic determinants involved in plant colonization or virulence in the reported genomes of K. variicola, K. quasipneumoniae and K. pneumoniae. Materials and methods: In silico comparisons and Jaccard analysis of genomic data were used. Fimbrial genes were detected by PCR. Biological assays were performed with plant and clinical isolates. Results: Plant colonization genes such as cellulases, catalases and hemagglutinins were mainly present in K. variicola genomes. Chromosomal β-lactamases were characteristic of this species and had been previously misclassified. K. variicola and K. pneumoniae isolates produced plant hormones. Conclusions: A mosaic distribution of different virulence- and plant-associated genes was found in K. variicola and in K. quasipneumoniae genomes. Some plant colonizing genes were found mainly in K. variicola genomes. The term plantanosis is proposed for plant-borne human infections.

RESUMEN

Resumen Objetivo: Comparar genes de colonización de plantas o de virulencia en los genomas reportados de K. variicola, K. quasipneumoniae y K. pneumoniae. Material y métodos: Se utilizaron análisis in silico y de Jaccard. Por PCR se detectaron genes de fimbrias. Se realizaron ensayos biológicos con aislados de plantas y clínicos. Resultados: Los genes de colonización de plantas como celulasas, catalasas y hemaglutininas se encontraron principalmente en genomas de K. variicola. Las β-lactamasas cromosómicas son características de la especie y en algunos casos estaban mal clasificadas. K. variicola y K. pneumoniae producen hormonas vegetales. Conclusiones: Se encontró una distribución en mosaico de los genes de asociación con plantas y de virulencia en K. variicola y K. quasipneumoniae. Principalmente en K. variicola se encontraron algunos genes involucrados en la colonización de plantas. Se propone el término plantanosis para las infecciones humanas de origen vegetal.