Caracterização molecular de cepas do vírus da encefalite de St. Louis (Flavivirus) isoladas no Estado de São Paulo, Brasil

RESUMO

O Vírus da Encefalite de St. Louis (SLEV), um membro da família Flaviviridae, é o agente etiológico da Encefalite de St. Louis, doença de importância epidemiológica na América do Norte. O ciclo de transmissão do SLEV inclui pássaros silvestres, principalmente Passeriformes e Columbiformes, e mosquitos Culex sp. No Brasil, as diferentes manifestações clínicas observadas em pacientes acometidos por SLEV podem explicar a dificuldade do diagnóstico correto dessas infecções. Com a finalidade de proceder a caracterização molecular de cepas de SLEV isoladas do Estado de São Paulo, provenientes de camundongo sentinela, mosquitos e um caso humano, as seqüências nucleotídicas completas dos genes do capsídeo (C), pré-membrana (prM), membrana (M) e envelope (E), além das regiões 5’ e 3’ não codificadoras, foram determinadas e analisadas neste estudo. O RNA viral foi extraído do cérebro de camundongo ou de cultura de células C6/36 infectados com SLEV e as diversas regiões genômicas foram amplificadas por RT-PCR e diretamente seqüenciadas. A análise comparativa das seqüências incluiu dados de SLEV do Continente Americano, provenientes do GenBank. A análise filogenética foi efetuada em função das seqüências do gene E, identificando-se os genótipos II na cepa oriunda de camundongo sentinela, III na cepa isoladado caso humano e V nos vírus isolados de mosquitos. Foram detectadas diferenças de nucleotídeos em todos os genes analisados e os valores de similaridade dos nucleotídeos e dos aminoácidos situaram-se entre 98,3% e 100%, respectivamente. Observaram-se substituições de aminoácidos que conferiram modificação no caráter e a alteração E 369 (H/N), no domínio III (Cterminal), foi específica para o vírus isolado do caso humano. As seqüências parciais da região 5’ não-codificadora demonstraram que há uma associação entre a estrutura secundária de RNA apresentada ...