Diversity of tunisian bread wheat genotypes revealed by morpho-agronomical and microsatellite markers / Diversidade de genótipos de trigo tunisiano para panificação obtida por marcadores morfo-agonômicos e microsatélites

ABSTRACT

The genetic diversity of a set of 21 hexaploid wheat germplasm from the National Agronomic Institute of Tunisia were investigated by applying 26 agro morphological traits and 10 wheat microsatellites molecular markers (Simple Sequence Repeat). The morphological variability was analyzed using the Principal Component Analysis (PCA) and the cluster analysis based on ward's method and square Euclidean distance. Eighteen microsatellites primer pairs were tested for all genotypes, among them 10 primers generated polymorphic and reproducible profiles. They revealed a total of 414 reducible bands among which 373 were polymorphic. The polymorphic information content (PIC) values per locus varied from 0,33 to 0,94 with an average of 0,72. Genetic similarity values between genotypes, calculated by the molecular derived data, were used to produce a dendrogram. The genotypes were clustered in four clear groups according to their origin, pedigree and in some cases to phenotypic characters similarities.

RESUMO

A diversidade genética de um conjunto de 21 hexaplóides em germoplasma de trigo oriundo do Instituto Nacional da Tunísia foi investigada pela aplicação de 26 caracteres morfológicos e 10 marcadores de microsatélites (Sequências simples repetidas). A variabilidade morfológica foi analisada pelo uso da análise de componentes principais (ACP) e análise de agrupamento baseada no método de Ward e o quadrado da distância Euclidiana. Dezoito primers de microsatélites foram testados para todos os genótipos, entre os quais 10 geraram polimorfismo e grupos distintos. Eles demonstraram um total de 414 bandas entre as quais 373 foram polimórficas. Os valores de polimorfismo encontrados por locus (VPL) variaram entre 0,33 a 0,94 com uma média de 0,72. Os valores da similaridade genética calculada para os dados moleculares originaram um dendograma. Os genótipos foram agrupados em quatro grupos de acordo com sua origem, pedigree (descendência) e em alguns casos pelos caracteres da similaridade fenotípica.