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Molecular characterization and expression pattern of tobacco (Nicotiana tabacum) apoplastic invertase gene / Caracterização molecular e padrão de expressão do gene da invertase do apoplasto em Nicotiana tabacum
Fuzhao, Nian; Leifeng, Zhao.
  • Fuzhao, Nian; Yunnan Agricultural University. Kunming. CN
  • Leifeng, Zhao; Yunnan Agricultural University. Kunming. CN
Biosci. j. (Online) ; 31(3): 730-736, may./jun. 2015.
Article in English | LILACS | ID: biblio-963875
ABSTRACT
The complete mRNA sequence of one tobacco (Nicotiana tabacum) gene- apoplastic invertase, was amplified using the rapid amplification of cDNA ends methods based on some tobacco ESTs. The full-length tobacco apoplastic invertase gene mRNA was 1,985bp containing an 1,740 bp open reading frame, which encodes a protein of 579 amino acids. Sequence analysis revealed that the apoplastic invertase of tobacco shares high homology with the apoplastic invertase of potato (82%), Lycopersicon esculentum (81%) and Lycopersicon pennellii (78%). Results also showed that tobacco apoplastic invertase gene has a closer genetic relationship with the apoplastic invertase gene of Lycopersicon esculentum. The prediction of transmembrane helices showed that tobacco apoplastic invertase might be a transmembrane protein. The expression profile was studied and the results indicated that tobacco apoplastic invertase gene was differentially expressed in detected tobacco tissues including leaf, stem, root and flower. Our experiment established the foundation for further research on this tobacco gene.
RESUMO
A sequência complete do mRNA em fumo (Nicotiana tabacum) do gene da invertase apoplástica que foi amplificado usando a amplificação rápida da sua terminação pelo método usando cDNA. A sequência completa do mRNA foi de 1.985bp compreendo uma ORF ("open reading frame") de 1.740 pb que codificou 579 aminoácidos. Foi demonstrado uma homologia de 82 % nas sequências obtidas com a invertase apoplástica da batateira, 81 % com o tomateiro da espécie Lycopersicon esculentum e 78 % com Lycopersicon pennellii. Os resultados demonstraram uma homologia e relacionamento genético entre as espécies estudadas.A análise das hélices das transmembranas da invertase do apoplasto demosntraram que a mesma pode ser uma proteína da transmembrana. O padrão da expressão gênica estudado indicou que a invertase apoplástica dos tecidos do fumo incluindo, folha, caule, raiz e flor foi diferente. Novas pesquisas serão realizadas deste gene do fumo bem como sua fundamentação biológica.
Subject(s)


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Nicotiana / RNA, Messenger / Beta-Fructofuranosidase Language: English Journal: Biosci. j. (Online) Journal subject: Agricultura / Disciplinas das Ciˆncias Biol¢gicas / Pesquisa Interdisciplinar Year: 2015 Type: Article Affiliation country: China Institution/Affiliation country: Yunnan Agricultural University/CN

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