Geraçäo de ®etiquetas de sequências expressas¼ dirigidas para porçöes codificadoras dos genes (Orestes): identificaçäo de novos genes humanos expressos em câncer de mama / Generation of ®expressed sequence tags¼ directed to genes coders portions (Orestes): identification of new human genes expressed in breast tumor

RESUMO

Etiquetas de sequências expressas (ESTs) são fundamentais para a identificação de genes no genoma humano e para definir características de expressão gênica. Neste trabalho, descrevemos uma nova abordagem para a geração de bibliotecas de cDNA, utilizando iniciadores arbitrários para a produção, por PCR, de mini-bibliotecas a partir de mRNA derivado de câncer de mama. Clones destas bibliotecas foram sequenciadas para gerar 6029 ESTs. Utilizando esta abordagem, foi possível observar uma significante normalização das diferentes sub-populações de mRNA e amplificação preferencial de porções centrais dos genes. Análise bioinformática destas sequências mostra que 3.350 ESTs (56 por cento) tem similaridade significante a sequências de DNA e/ou cDNA já conhecidas (sequências anotadas) descritas em diferentes organismos, e 1509 ESTs (25 por cento) não possuem qualquer similaridade a diferentes bancos de dados...