Null expectation of spatial correlograms under a stochastic process of genetic divergence with small sample sizes
Genet. mol. biol
;
23(4): 739-743, Dec. 2000. ilus, graf
Article
in English
| LILACS
| ID: lil-303640
RESUMO
Nesse artigo, um processo estocástico Ornstein-Uhlenbeck foi utilizado para simular a relaçäo exponencial entre divergência genética e distância geográfica, conforme é esperado em modelos de isolamento-por-distância, alpondras ou coalescência. As simulaçöes foram realizadas a partir de um dendrograma UPGMA estimado a partir das distâncias geográficas entre 13 populaçöes locais. As superfícies espaciais de freqüências alélicas simuladas foram analisadas através de autocorrelaçäo espacial e construçäo de distâncias genéticas de Nei, com base em diferentes números de alelos. A divergência entre populaçöes locais produziu padröes espaciais significativos, tanto em nível univariado (correlogramas espaciais) quanto em nível multivariado (teste de Mantel entre distâncias de Nei e distâncias geográficas). Entretanto, se as análises säo baseadas em um pequeno número de populaçöes locais, os perfis dos correlogramas variam consideravelmente e as distâncias Manhattan calculadas entre eles podem ser maiores do que as previamente estabelecidas em outros estudos de simulaçäo. O método proposto permite assim estabelecer uma amplitude de perfis que podem ser obtidos pelo mesmo processo estocástico de divergência genética. A comparaçäo de correlogramas observados com esses perfis permite assim evitar o uso de outros mecanismos microevolutivos para explicar essa divergência genética.
Full text:
Available
Index:
LILACS (Americas)
Main subject:
Residence Characteristics
/
Stochastic Processes
/
Gene Frequency
Type of study:
Prognostic study
Language:
English
Journal:
Genet. mol. biol
Journal subject:
Genetics
Year:
2000
Type:
Article
Affiliation country:
Brazil
Institution/Affiliation country:
Universidade Federal de Goiás/BR
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