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Trimming and clustering sugarcane ESTs
Telles, Guilherme P; Silva, Felipe R. da.
  • Telles, Guilherme P; UNICAMP. Bioinformatics Laboratory. Institute of Computing. Campinas. BR
  • Silva, Felipe R. da; UNICAMP. Center for Molecular Biology and Genetic Engineering. Campinas. BR
Genet. mol. biol ; 24(1/4): 17-23, 2001. ilus, tab, graf
Article in English | LILACS | ID: lil-313868
RESUMO
O método de clustering adotado no Projeto SUCEST (Sugarcane EST Project) tinha vários problemas (muitos clusters, presença de seqüências de ribossomo etc.). Nós assumimos a tarefa de reprojetar todo o processo de clustering, propondo uma "limpeza" inicial mais cuidadosa das seqüências. Neste artigo as estratégias de limpeza das seqüências e de clustering säo descritas em detalhe, incluindo os números oficiais do projeto (237,954 ESTs e 43,141 clusters).
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Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Cluster Analysis / Expressed Sequence Tags Language: English Journal: Genet. mol. biol Journal subject: Genetics Year: 2001 Type: Article Affiliation country: Brazil Institution/Affiliation country: UNICAMP/BR

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