The sugarcane signal transduction (SUCAST) catalogue: prospecting signal transduction in sugarcane

RESUMO

O sequenciamento de ESTs (etiquetas de seqüências transcritas) tem possibilitado a descoberta de muitos novos genes em uma ampla variedade de organismos. Um aumento do aproveitamento desta informaçäo pela comunidade científica tem sido possível graças ao desenvolvimento de base de dados contendo seqüências completamente anotadas. O trabalho aqui relatado teve como objetivo a identiflcaçäo de ESTs de cana de açúcar seqüenciadas através do projeto SUCEST (http//sucest.lad.ic.unicamp.br) que codificam para proteínas envolvidas em mecanismos de transduçäo de sinal. Nós também preparamos um catálogo dos componentes de transduçäo de sinal da cana de açúcar (SUCAST) englobando as principais categorias e vias conhecidas (http//sucest.lad.ic.unicamp.br/private/mining-reports/QG/QG-mining.htm). ESTs codificadoras de enzimas envolvidas nas rotas de biossíntese de hormônios (giberelinas, etileno, auxinas, ácido abscíssico, ácido jasmônico) foram encontradas e sua expressäo específica nos tecidos foi inferida a partir de seu enriquecimento nas diferentes bibliotecas. Quando possível, transmissores do sinal hormonal e da resposta a peptídeos produzidos pela planta foram associados a suas respectivas vias. Mais de 100 receptores foram encontrados na cana de açúcar, entre os quais uma grande família de receptores Ser/Thr quinase e também de fotoreceptores, receptores do tipo histidina quinase e seus respectivos reguladores da resposta. Proteínas G e GTPases pequenas foram também analisadas e comparadas com membros destas famílias já conhecidos em mamíferos e plantas. As vias principais que envolvem a participaçäo de proteínas quinases e fosfatases foram mapeadas, em especial as vias da quinase MAP quinase e do inositol que säo bem estudadas em plantas.