Patterns of expression of cell wall related genes in sugarcane

RESUMO

A busca por genes relacionados ao metabolismo da parede celular no banco de dados SUCEST-FAPESP resultou em 459 potenciais genes ("clusters") que correspondem a 3283 clones ("reads"), o que corresponde a cerca de 1.1 por cento do número total de clones. Foram construídos mapas de superfície para correlacionar os genes com as bibliotecas dos diferentes tecidos. Foram encontradas correlações positivas ou neutras entre os genes em uma mesma biblioteca. Os genes relacionados à síntese de celulose (família CesA) foram os de maior expressäo na planta, embora a maior expressäo esteja associada à raiz e colmo. Entre as hidrolases, ß-1,3-glucanases, xiloglucano endo-ß-transglicosilase, ß-glucosidase e endo-ß-mananase foram os genes com o maior número de clones. Análise de correlaçäo (por mapas de superfície) revelou que a expressäo dos genes relacionados à biossíntese parece estar associada à hidrólise de hemicelulose, enquanto as hidrolases de pectina estäo relacionadas principalmente às hidrolases de xiloglucano. O padräo de expressäo de genes relacionados à parede celular, baseado no número de "reads" por "cluster" refletiu bem as características fisiológicas esperadas para cada tecido. Este é o primeiro trabalho que fornece uma visäo geral do metabolismo de parede celular através da expressäo dos genes em vários tecidos ao mesmo tempo. Por exemplo, inflorescências em desenvolvimento se comportaram de forma semelhante a tecidos meristemáticos e à regiäo de transiçäo folha-raiz. Estes dados serviräo tanto para pesquisas em fisiologia e desenvolvimento de cana, como também para o desenvolvimento de processos industriais.