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Using the FORESTS and KEGG databases to investigate the metabolic network of Eucalyptus
Mombach, José C. M; Lemke, Ney; Silva, Norma M. da; Ferreira, Rejane A; Isaia Filho, Eduardo; Barcellos, Cláudia K; Ormazabal, Rodrigo J.
  • Mombach, José C. M; Universidade do Vale do Rio dos Sinos. Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional. São Leopoldo. BR
  • Lemke, Ney; Universidade do Vale do Rio dos Sinos. Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional. São Leopoldo. BR
  • Silva, Norma M. da; Universidade do Vale do Rio dos Sinos. Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional. São Leopoldo. BR
  • Ferreira, Rejane A; Universidade do Vale do Rio dos Sinos. Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional. São Leopoldo. BR
  • Isaia Filho, Eduardo; Universidade do Vale do Rio dos Sinos. Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional. São Leopoldo. BR
  • Barcellos, Cláudia K; Universidade do Vale do Rio dos Sinos. Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional. São Leopoldo. BR
  • Ormazabal, Rodrigo J; Universidade do Vale do Rio dos Sinos. Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional. São Leopoldo. BR
Genet. mol. biol ; 28(3,suppl): 630-633, Nov. 2005. tab
Article in English | LILACS | ID: lil-440446
ABSTRACT
In this work we apply a bioinformatics approach to determine the most important enzymes of the metabolic network of Eucalyptus to determine the coverage of the genome in the FORESTS library. We conclude that the library does not cover completely the metabolism of the organism. However, some important pathways could be analyzed, especially the lignin synthesis. We found that four of the most important enzymes predicted are involved in this pathway
Subject(s)
Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Genome, Plant / Eucalyptus Language: English Journal: Genet. mol. biol Journal subject: Genetics Year: 2005 Type: Article Affiliation country: Brazil Institution/Affiliation country: Universidade do Vale do Rio dos Sinos/BR

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