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Sequence analysis of the rDNA intergenic spacer of Metarhizium strains isolated in Brazil
Yanaka-Schäfer, Fabiana Y; Dall'Onder, Leonara P; Panichi, Mariana C; Mendes, Roberta G; Fagundes, Nelson J. R; Bandinelli, Josiane B; Bogo, Maurício R.
  • Yanaka-Schäfer, Fabiana Y; Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. Faculdade de Biociências. Laboratório de Biologia Genômica e Molecular. Porto Alegre. BR
  • Dall'Onder, Leonara P; Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. Faculdade de Biociências. Laboratório de Biologia Genômica e Molecular. Porto Alegre. BR
  • Panichi, Mariana C; Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. Faculdade de Biociências. Laboratório de Biologia Genômica e Molecular. Porto Alegre. BR
  • Mendes, Roberta G; Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. Faculdade de Biociências. Laboratório de Biologia Genômica e Molecular. Porto Alegre. BR
  • Fagundes, Nelson J. R; Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. Faculdade de Biociências. Laboratório de Biologia Genômica e Molecular. Porto Alegre. BR
  • Bandinelli, Josiane B; Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. Faculdade de Biociências. Laboratório de Biologia Genômica e Molecular. Porto Alegre. BR
  • Bogo, Maurício R; Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. Faculdade de Biociências. Laboratório de Biologia Genômica e Molecular. Porto Alegre. BR
Genet. mol. biol ; 31(1): 116-121, 2008. ilus, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-476160
ABSTRACT
To assess the extent of genetic variability of rDNA intergenic spacer (IGS) in Metarhizium sp., 34 strains (27 isolated in Brazil) were sequenced and analyzed together with an additional 20 Metarhizium anisopliae var. anisopliae sequences retrieved from GenBank. Overall, the global nucleotide diversity for the region under study was of 0.090, while for the Brazilian isolates it was only 0.016. Phylogenetic analyses showed four well-supported groups (A, B, C, and D), one of which (D) has not been previously identified. All but one of the Brazilian strains cluster in this novel D phylogroup, suggesting that the genetic variation found in Brazil is a subset of the worldwide M. anisopiliae var. anisopliae variation.
Subject(s)

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Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: DNA, Ribosomal / Sequence Analysis, DNA / Fungi Country/Region as subject: South America / Brazil Language: English Journal: Genet. mol. biol Journal subject: Genetics Year: 2008 Type: Article Affiliation country: Brazil Institution/Affiliation country: Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul/BR

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