Identification and differentiation of Candida species from pediatric patients by random amplified polymorphic DNA

ABSTRACT

Thirty-four Candida isolates were analyzed by random amplified polymorphic DNA using the primer OPG-10:24 Candida albicans; 4 Candida tropicalis; 2 Candida parapsilosis; 2 Candida dubliniensis; 1 Candida glabrata and 1 Candida krusei. The UPGMA-Pearson correlation coefficient was used to calculate the genetic distance between the different Candida groupings. Samples were classified as identical (correlation of 100 percent); highly related samples (90 percent); moderately related samples (80 percent) and unrelated samples (< 70 percent). The results showed that the RAPD proposed was capable of classifying the isolates coherently (such that same species were in the same dendrogram), except for two isolates of Candida parapsilosis and the positive control (Netherlands, 1973), probably because they are now recognized as three different species. Concerning the only fluconazole-resistant Candida tropicalis isolate with a genotype that was different to the others, the data were insufficient to affirm that the only difference was the sensitivity to fluconazole. We concluded that the Random Amplified Polymorphic DNA proposed might be used to confirm Candida species identified by microbiological methods.

RESUMO

Trinta e quatro isolados de Candida foram analisados por amplificação aleatória de DNA polimórfico (primer OPG-10): 24 Candida albicans, 4 Candida tropicalis, 2 Candida parapsilosis, 2 Candida dubliniensis, 1 Candida glabrata e 1 Candida krusei. O coeficiente de correlação de Pearson-UPGMA calculou a distância genética entre os diferentes agrupamentos de Candida: amostras idênticas (100 por cento de correlação), amostras muito relacionadas (90 por cento), moderadamente relacionadas (80 por cento), e não relacionadas (< 70 por cento). Os resultados demonstram que a amplificação aleatória de DNA polimórfico proposta é capaz de classificar os isolados de forma coerente, ficando os de mesma espécie em um mesmo dendograma, com exceção dos dois isolados de Candida parapsilosis e o controle positivo (Holanda, 1973), provavelmente por serem atualmente classificadas em três espécies diferentes. Quanto ao único isolado de Candida tropicalis resistente ao fluconazol com genótipo diferente dos outros, os dados não são suficientes para afirmar que a única característica distinta fosse a sensibilidade ao fluconazol. Concluímos que a amplificação aleatória de DNA polimórfico proposta poderia ser usada para a confirmação das espécies de Candida identificadas nos testes microbiológicos.