Detection of Mycoplasma hyopneumoniae in lungs and nasal swabs of pigs by nested PCR / Detecção de Mycoplasma hyopneumoniae em pulmões e suabes nasais de suínos por nested PCR

ABSTRACT

Fifty-four samples were collected from growing and finishing pigs for the molecular diagnosis of enzootic porcine pneumonia. Nineteen lung fragments were obtained from pigs that showed signs of respiratory disease and 35 nasal swabs were obtained from clinically healthy pigs. For the detection of the bacterial genome in the samples, the nested PCR technique was used to amplify a fragment of 706bp. This fragment was subsequently cloned and sequenced. The sequence of obtained nucleotides was compared with six other sequences of Mycoplasma hyopneumoniae and 11 sequences of other bacteria available in the Genbank. To measure the sensitivity of the nested PCR, serial dilutions (10-1 to 10-15) of cloned fragments were conducted based on the concentration of 300ng. Ten lung fragments and eight nasal swabs showed positive for M. hyopneumoniae and the limit of detection was estimated to be 0.3fg DNA cloned. The sequence of nucleotides obtained showed 99.1 percent homology with the other sequences of M. hyopneumoniae, demonstrating that the nested PCR used in this study may provide an important diagnostic tool for the detection of this agent.

RESUMO

Foram coletadas 54 amostras de animais em fase de crescimento e terminação para o diagnóstico molecular da pneumonia enzoótica suína. Dezenove fragmentos de pulmão foram obtidos de suínos que apresentavam sinais de doença respiratória e 35 suabes nasais foram obtidas de suínos clinicamente saudáveis. Para a detecção do genoma bacteriano nas amostras, foi utilizada a técnica de nested PCR que originou um fragmento de 706pb, o qual foi, posteriormente, clonado e sequenciado. A sequência de nucleotídeos obtida foi comparada com outras seis sequências de Mycoplasma hyopneumoniae e 11 sequências de outras bactérias disponíveis no Genbank. Para medir a sensibilidade da nested PCR, foram realizadas diluições seriadas (10-1 a 10-15) do fragmento clonado, partindo da concentração de 300ng. Dez fragmentos de pulmões e oito suabes nasais apresentaram resultado positivo para M. hyopneumoniae e o limite de detecção foi estimado em 0,3fg de DNA clonado. A sequência de nucleotídeos obtida foi de 99.1 por cento de homologia com as outras sequências de M. hyopneumoniae, demonstrando que a nested PCR utilizada neste estudo pode ser uma importante ferramenta de diagnóstico para a detecção desse agente.