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The genomic identification of Colombian Acinetobacter baumannii clinical isolates by RFLP-PCR analysis of the 16S-23S rRNA gene spacer region / Identificación genómica de aislamientos colombianos de Acinetobacter baumannii mediante RFLP-PCR de la región intergénica espaciadora de los genes 16S y 23S rRNA
Hernández, María Andrea; Valenzuela, Emilia María; Pulido, Ingrid Yamile; Reguero, María Teresa; Restrepo, Silvia; Gualtero Trujillo, Sandra; Santofimio Sierra, Dagoberto; Ramirez Plazas, Martha; Quintero, Luz Eneida; Mantilla, José Ramón.
  • Hernández, María Andrea; Universidad de los Andes. Mycology and Phytopathology Laboratory. Bogotá. CO
  • Valenzuela, Emilia María; Universidad Nacional. Instituto de Biotecnología. Bogotá. CO
  • Pulido, Ingrid Yamile; Universidad Nacional. Instituto de Biotecnología. Bogotá. CO
  • Reguero, María Teresa; Universidad Nacional. Instituto de Biotecnología. Bogotá. CO
  • Restrepo, Silvia; Universidad de los Andes. Mycology and Phytopathology Laboratory. Bogotá. CO
  • Gualtero Trujillo, Sandra; Fundación Clínica Abbod Shaio. Bogotá. CO
  • Santofimio Sierra, Dagoberto; Universidad Surcolombiana. Facultad de Salud Pública. CO
  • Ramirez Plazas, Martha; Universidad Surcolombiana. Facultad de Salud Pública. CO
  • Quintero, Luz Eneida; Hernando Moncaleano Perdomo Teaching Hospital. CO
  • Mantilla, José Ramón; Universidad Nacional. Instituto de Biotecnología. Bogotá. CO
Rev. colomb. biotecnol ; 13(1): 110-114, jul. 2011.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-600581
ABSTRACT
The 16S-23S rRNA gene intergenic spacer (ITS) was analysed by RFLP in this study to identify A. baumannii from 139 isolates from four hospitals (identified as A, B, C and D). One hundred and twenty of these isolates (86.3%) belonged to the A. baumannii species; those identified as being A. baumannii were found to be polyclonal (19 clone groups) when determining the genetic relationships, 16 of them being found in hospital C. Hospitals A, B and D shared two clone groups isolated during different years. This study describes a rapid and easy method for genospecies identification of Acinetobacter baumannii.
RESUMEN
Con el objeto de identificar la genomoespecie Acinetobacter baumannii, se estudiaron 189 aislamientos pertenecientes al Complejo Acinetobacter baumannii-Acinetobacter calcoaceticus provenientes de cuatro hospitales colombianos (denominados A,B,C,D) mediante el análisis por RFLP-PCR de la región intergénica espaciador (ITS) de los genes 16S y 23S rRNA. Se encontraron 120 aislamientos (86.3%) pertenecientes a la especie A. baumannii. La estructura de la población fue policlonal, con 19 grupos clonales, 16 de los cuales se hallaron en el hospital C. En los hospitales A,B y D se encontraron 2 grupos clonales aislados durante diferentes años. En este estudio se propone un método rápido y fácil para la identificación de Acinetobacter baumannii.
Subject(s)

Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Acinetobacter baumannii Type of study: Diagnostic study Country/Region as subject: South America / Colombia Language: Spanish Journal: Rev. colomb. biotecnol Journal subject: Biotechnology Year: 2011 Type: Article Affiliation country: Colombia Institution/Affiliation country: Fundación Clínica Abbod Shaio/CO / Hernando Moncaleano Perdomo Teaching Hospital/CO / Universidad Nacional/CO / Universidad Surcolombiana/CO / Universidad de los Andes/CO

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LILACS

LIS

Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: Acinetobacter baumannii Type of study: Diagnostic study Country/Region as subject: South America / Colombia Language: Spanish Journal: Rev. colomb. biotecnol Journal subject: Biotechnology Year: 2011 Type: Article Affiliation country: Colombia Institution/Affiliation country: Fundación Clínica Abbod Shaio/CO / Hernando Moncaleano Perdomo Teaching Hospital/CO / Universidad Nacional/CO / Universidad Surcolombiana/CO / Universidad de los Andes/CO