DNA fingerprinting by ERIC-PCR for comparing Listeria spp. strains isolated from different sources in San Luis: Argentina / Caracterización molecular por ERIC-PCR de cepas de Listeria spp. aisladas de diversos orígenes en San Luis: Argentina

ABSTRACT

In this study, a total of 24 Listeria spp. strains were analyzed. Twenty-two isolates were obtained in San Luis (Argentina) from human, animal, and food samples. Two types of strains, Listeria monocytogenes CLIP 22762 and Listeria innocua CLIP 74915, were included as reference strains. All isolates were biochemically identified and characterized by serotyping, phage typing, and amplification of the flaA gene by polymerase chain reaction (PCR). Repetitive intergenic consensus (ERIC) sequence-based PCR was used to generate DNA fingerprints. On the basis of ERIC-PCR fingerprints, Listeria spp. strains were divided into three major clusters matching origin of isolation. ERIC-PCR fingerprints of human and animal isolates were different from those of food isolates. In addition, groups I and II included ten L. monocytogenes strains, and only one Listeria seeligeri strain. Group III included nine L. innocua strains and four L. monocytogenes strains. Computer evaluation of ERIC-PCR fingerprints allowed discrimination between the tested serotypes 1/2b, 4b, 6a, and 6b within each major cluster. The index of discrimination calculated was 0.94. This study suggests that the ERIC-PCR technique provides an alternative method for the identification of Listeria species and the discrimination of strains within one species.

RESUMEN

En este estudio se analizaron 24 cepas de Listeria spp. De ellas, 22 fueron obtenidas en San Luis (Argentina), a partir de muestras humanas, de animales y alimentos. Se incluyeron 2 cepas de referencia Listeria monocytogenes CLIP 22762 y Listeria innocua CLIP 74915. Todos los aislamientos fueron identificados bioquímicamente y caracterizados por serotipificación, fagotipificación y detección del gen flaA por reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Se generaron perfiles de bandas de ADN mediante la amplificación de secuencias repetitivas de consenso intergénico de enterobacterias (ERIC-PCR). De acuerdo a los resultados obtenidos por ERIC-PCR, las cepas de Listeria spp. fueron divididas en 3 grupos según su origen. Los perfiles de los aislamientos humanos y animales fueron distintos de los correspondientes a alimentos. Por otra parte, dentro de los grupos I y II se incluyeron 10 cepas de L. monocytogenes y solamente una de Listeria seeligeri. Dentro del grupo III no sólo estuvieron incluidas las 9 cepas de L. innocua sino también 4 de L. monocytogenes. La evaluación de los perfiles de bandas obtenidos por ERIC-PCR permitió la discriminación entre los serotipos ensayados 1/2b, 4b, 6a y 6b dentro de cada grupo. El índice de discriminación calculado para ERIC-PCR fue de 0,94. Los resultados sugieren que la técnica de ERIC-PCR provee un método alternativo válido para la identificación de especies de Listeria y, asimismo, permite la diferenciación de cepas dentro de una misma especie.