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Determinación de mutaciones de un solo nucleótido en el gen 23S rRNA de Helicobacter pylori relacionadas con resistencia a claritromicina en una población del departamento del Cauca, Colombia / Determination of single nucleotide mutations in the 23S rRNA gene of Helicobacter pylori related to clarithromycin resistance in a population from Cauca, Colombia
Acosta, Claudia Patricia; Hurtado, Fabián Andrés; Trespalacios, Alba Alicia.
  • Acosta, Claudia Patricia; Universidad del Cauca. Facultad de Ciencias de la Salud. Grupo de Investigación en Genética Humana Aplicada. Popayán. CO
  • Hurtado, Fabián Andrés; Universidad del Cauca. Facultad de Ciencias de la Salud. Grupo de Investigación en Genética Humana Aplicada. Popayán. CO
  • Trespalacios, Alba Alicia; Universidad del Cauca. Facultad de Ciencias de la Salud. Grupo de Investigación en Genética Humana Aplicada. Popayán. CO
Biomédica (Bogotá) ; 34(supl.1): 156-162, abr. 2014. graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-712432
RESUMEN
Introducción. La terapia antibiótica combinada para la erradicación de Helicobacter pylori debería basarse en los patrones locales de resistencia. Objetivo. Determinar la resistencia de H. pylori a claritromicina en una población del departamento del Cauca mediante la identificación de mutaciones en el gen 23S r RNA en ADN obtenido de biopsias gástricas. Materiales y métodos. Se incluyeron en el estudio 162 pacientes con dispepsia funcional. El gen 23S rRNA se amplificó por PCR y el patrón de mutaciones se identificó por secuenciación directa. Resultados. La frecuencia de resistencia a claritromicina fue de 4 %. La mutación A2143G del gen se encontró en cuatro pacientes (2,46 %) y la mutación A2142G, en tres pacientes (1,85 %). Conclusiones. El estudio encontró que el genotipo más frecuente en los especímenes positivos para H. pylori fue 2143G, seguido por A2142G. La prevalencia observada de resistencia de H. pylori fue baja; por lo tanto, se considera que el tratamiento con claritromicina es una opción válida para la erradicación de H. pylori en la población objeto de estudio.
ABSTRACT

Introduction:

Antibiotic combination therapy for the eradication of Helicobacter pylori should be based on local resistance patterns.

Objective:

To d etermine the resistance of H. pylori to clarithromycin in a population from Cauca province, through the identification of mutations in the 23S rRNA gene in DNA from gastric biopsies. Materials and

methods:

A total of 162 patients with functional dyspepsia were included in the study. The 23S rRNA gene and the DNA from 162 gastric specimens were amplified by PCR, and the mutation pattern was identified by direct sequencing.

Results:

The frequency of clarithromycin resistance was 4%. A2143G mutation was found in four patients (2.46%) and A2142G mutation was found in three patients (1.85%).

Conclusions:

Our study shows that the most frequent genotype in H. pylori -positive specimens was A2143G, followed by A2142G. The observed resistance prevalence of H. pylori was low; thus, we consider that clarithromycin treatment is a valid option for H. pylori eradication in the study population.
Subject(s)


Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: DNA, Bacterial / DNA, Ribosomal / RNA, Bacterial / Helicobacter pylori / Helicobacter Infections / Clarithromycin / Polymorphism, Single Nucleotide / Drug Resistance, Bacterial / Gastritis Type of study: Observational study / Risk factors Limits: Adolescent / Adult / Aged / Female / Humans / Male Country/Region as subject: South America / Colombia Language: Spanish Journal: Biomédica (Bogotá) Journal subject: Medicine Year: 2014 Type: Article Affiliation country: Colombia Institution/Affiliation country: Universidad del Cauca/CO

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Full text: Available Index: LILACS (Americas) Main subject: DNA, Bacterial / DNA, Ribosomal / RNA, Bacterial / Helicobacter pylori / Helicobacter Infections / Clarithromycin / Polymorphism, Single Nucleotide / Drug Resistance, Bacterial / Gastritis Type of study: Observational study / Risk factors Limits: Adolescent / Adult / Aged / Female / Humans / Male Country/Region as subject: South America / Colombia Language: Spanish Journal: Biomédica (Bogotá) Journal subject: Medicine Year: 2014 Type: Article Affiliation country: Colombia Institution/Affiliation country: Universidad del Cauca/CO