Desenvolvimento de abordagens computacionais e ferramentas para a análise comparativa de genomas microbianos / Development of computational approaches and tools for comparative analysis of microbial genomes
Rio de Janeiro; s.n; 2005. ix,88 p. ilus, tab.
Thesis
in Portuguese
| LILACS
| ID: lil-736942
RESUMO
Esta dissertação trata do desenvolvimento de abordagens computacionais e ferramentas para a análise comparativa de genomas microbianos em larga escala. Três sistemas independentes, porém complementares, desenvolvidos para a análise comparativa de genomas microbianos em geral e micobacterianos em particular são apresentados LocalCOG, sistema composto por um banco de dados relacional que permite o uso local das informações disponíveis no banco de dados COG (Cluster of Orthologous Groups); BioParser, programa que oferece interfaces gráficas para a manipulação e análise de resultados obtidos com o uso de programas de busca por similaridade de seqüência; GenoMycDB, banco de dados relacional construído para a análise comparativa de genomas micobacterianos ao nível de suas proteínas preditas...
ABSTRACT
This dissertations deals with the development of computational approaches and tools for large-scale comparative analysis of microbial genomes. We present three complementary, yet independent systems designed for comparative analyses of microbial genomes in general and mycobacterial genomes particulary LocalCOG, a relational database system built for local use of data from COG (Clusters of Orthologous Groups); BioParser, a program that offers graphical interfaces for parsing and analysing reports of sequence similarity searches; GenoMycDB, a relational database built for comparative analyses of mycrobacterial genomes based on their predicted protein content...
Full text:
Available
Index:
LILACS (Americas)
Main subject:
Genome
/
Computational Biology
/
Mycobacterium
Limits:
Humans
Language:
Portuguese
Year:
2005
Type:
Thesis
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