Diversidade de Escherichia coli e enterococcus isolados de praias da região costeira do Rio de Janeiro / Diversity of Escherichia coli and enterococcus isolated beaches of the coastal region of Rio de Janeiro

RESUMO

Escherichia coli e Enterococcus são grupos heterogêneos de microrganismos queincluem linhagens comensais e patogênicas. A presença desses microrganismos em ecossistemas aquáticos, como as praias da região costeira, emergiu como uma preocupação relevante com impacto significativo na saúde pública, por serem considerados indicadores de contaminação fecal. O objetivo do presente estudo foi avaliar a ocorrência e a diversidade das espécies de enterococos e E. coli em praias localizadas na região costeira da cidade do Rio de Janeiro (Botafogo, Copacabana,Flamengo, Ipanema e Leblon), no período de 2013 a 2014. Para E. coli, a técnica de espectrometria de massa (MALDI-TOF MS) foi concordante com os métodos convencionais quanto a identificação dos 100 isolados da espécie. A filo grupagem revelou que 79 por cento dos isolados era do grupo A, seguido por B1 (15 por cento) e D (6 por cento). Marcadores de patotipos diarreiogênicos foram detectados em um único isolado para Escherichia coli enteroagregativa (EAEC). A susceptibilidade aos 16 antimicrobianos testados foi observada em 12 por cento das amostras, enquanto 88 por cento exibiu o fenótipo de resistência, a pelo menos um deles. Foram detectados 21 resistotipos e 9 isolados exibiram o fenótipo MDR. (...) O conjunto dos resultados obtidos revelou a ampla circulação de microrganismos patogênicos e resistentes nas praias localizadas na região costeira da cidade do Rio de Janeiro. Tais observações vêm reforçar a necessidade de reforçar as ações de vigilância nessa localidades e reconhecer o papel desses ambientes como reservatórios de resistência aos antimicrobianos e virulência bacteriana...

ABSTRACT

Escherichia coli and Enterococcus are heterogeneous groups of microorganisms including commensal and pathogenic strains. The presence of these microorganisms inaquatic ecosystems, such as coastal beaches, can have significant impact on human health since they are indicators of fecal contamination. The aim of the present study wasto assess the occurrence and diversity of enterococci and E.coli in coastal beaches of the city of Rio de Janeiro (Botafogo, Copacabana, Flamengo, Ipanema and Leblon) between 2013 and 2014. For the identification of 100 E. coli isolates, MALDI-TOF MS was completely congruent with the conventional method. The phylogenetic grouping method revealed that 79 percent of the isolates belonged to group A, followed by B1 (15 percent) and D (6 percent). Pathogenic markers were detected in a single isolate of enteroaggregative E. coli (EAEC). Susceptibility to 16 antimicrobial agents tested was observed in 12 percent of the isolates, while 88 percent showed resistance to at least one antibiotic. Twenty-one antibiotypes were detected and 9 isolates exhibited the MDR phenotype. (...) The overall results reveal the wide circulation of pathogenic and antimicrobial resistant microorganisms in beaches located on the coast of the city of Rio de Janeiro. Such observations reinforcethe needing for robust surveillance in such beaches and highlight the role of these environments as reservoirs of antimicrobial resistance and bacterial virulence...