Analysis of the expression and clinical significance of ATM in gastric cancer tissues based on bioinformatics data / 中国肿瘤生物治疗杂志

ABSTRACT

@#[摘 要] 目的：探讨幽门螺杆菌（Helicobacter pylori, Hp）感染对胃癌细胞共济失调毛细血管扩张突变（ataxia-telangiectasia mutated，ATM）基因表达的影响及其临床意义。方法：从TCGA数据库中获取胃癌相关RNAseq数据，比较ATM基因的表达差异，分析ATM表达与患者临床病理参数的相关性及预后价值，用Kaplan-Meier法进行生存分析，LinkedOmics数据库分析ATM相关基因，用R语言进行GO、KEGG富集分析。选用2019年3月至2019年12月贵州医科大学附属医院12例手术切除的胃癌及癌旁组织标本，以及胃癌细胞系AGS和BGC823，用感染复数40∶1的Hp GZ7菌感染细胞，用免疫组织化学染色法检测胃癌组织中ATM蛋白的表达，qPCR法检测胃癌组织和细胞中ATM mRNA的表达。结果：TCGA数据显示胃癌和Hp感染胃癌组织中ATM miRNA表达水平均显著高于癌旁组织（均P<0.01）；胃癌组织中ATM miRNA表达与患者的T分期、AJCC分期等病理参数呈正相关（均P<0.05），ATM高表达时生存率显著降低（P<0.05）。实验检测显示，胃癌组织标本中ATM蛋白的表达水平明显高于癌旁组织（P<0.01）；Hp感染胃癌细胞中ATM miRNA表达水平显著高于未感染胃癌细胞（P<0.01）。胃癌中ATM基因与NPAT等12 461个基因呈正相关（P<0.05），与MIF等7 764个基因呈负相关（P<0.05）。GO、KEGG富集分析显示，ATM富集到DNA修复复合体、癌症中的转录失调等信号通路。结论：ATM基因在胃癌组织中高表达，患者生存率随表达水平的增高而降低，其与患者的T分期、AJCC分期等病理参数相关，且Hp感染引起ATM表达水平升高可能是Hp引起胃癌的原因之一。