The relationship between PM20D1 gene and hypoxia and prognosis in diffuse large B-cell lymphoma was analyzed by integrating multiple databases / 中国肿瘤生物治疗杂志

ABSTRACT

@#[摘 要] 目的：探讨肽酶M20结构域1（peptidase M20 domain containing 1，PM20D1）在人弥漫大B细胞淋巴瘤（diffuse large B-cell lymphomas，DLBCL）细胞中的表达及其与缺氧相关性和预后的关系。方法：通过GDC、TCGA、GTEx公共数据库分析PM20D1表达对DLBCL细胞增殖、迁移和凋亡的影响及其与患者预后的关系。通过对不同分组患者的富集分析及PM20D1与CD274相关性分析验证PM20D1是否为DLBCL的缺氧相关基因；采用ChEA、ENCODE和hTFtarget数据库分析上游调控PM20D1表达的转录因子（TF）和miRNA，以及差异表达PM20D1与化疗药物敏感性的关系。采用WB法检测PM20D1在正常淋巴细胞和DLBCL细胞中的表达水平，通过设计PM20D1的siRNA序列敲减目的基因，并采用qPCR和WB法检测验证SUDHL2和SUDHL10细胞中PM20D1的敲减效率，采用CCK-8法和Transwell实验分别检测敲减PM20D1对细胞增殖和迁移能力的影响，流式细胞术检测细胞凋亡水平。结果：PM20D1在DLBCL组织中高表达且患者预后差（P<0.05或P<0.01）；富集分析显示，PM20D1高表达组与ssGSEA高分组主要涉及细胞电耦合通讯、甘油三酯代谢过程调节和细胞质翻译起始复合物过程，且PM20D1表达与免疫检查点CD274表达呈正相关（P<0.01，r=0.757）。在SUDHL2和SUDHL10细胞中敲减PM20D1后，细胞的增殖和迁移均显著降低（均P<0.05），细胞凋亡明显增加（P<0.05）。结论：PM20D1基因在DLBCL组织和细胞中高表达且与患者预后密切相关；PM20D1可能通过促进DLBCL细胞的增殖、迁移并抑制凋亡，从而促进DLBCL的发生发展。