Detecção e análise filogenética do bocavírus humano em crianças com infecção respiratória aguda no ano de 2010 em São Paulo, Brasil / Detection and phylogenetic analysis of human bocavirus in children with acute respiratory infection in the year 2010 in São Paulo, Brazil

RESUMO

O bocavírus humano (HBoV), gênero Bocavírus, família Parvoviridae está relacionado a doenças respiratórias, predominantemente na infância. Recebeu esta nomenclatura, devido a estrutura genômica apresentar similaridade aos gêneros parvovírus bovino e canino. Foram detectados 4 grupos HBoV-1, HBoV-2, HBoV-3 e HBoV-4. Foi realizado um estudo retrospectivo, no ano de 2010, utilizando-se 300 amostras de secreção nasofaringe, coletadas de crianças de 0 a 5 anos de idade, com sintomas respiratórios agudo. As amostras foram registradas e processadas no Núcleo de Doenças Respiratórias do Instituto Adolfo Lutz. O objetivo foi detectar o vírus HboV e caracterizar filogeneticamente as cepas de HboV, nestas amostras e comparar com as sequencias depositadas no GenBank. Das 300 amostras analisadas através do teste de PCR em tempo real, 49 amostras (15,75%) foram positivas para HBoV. Todas estas amostras foram processadas por PCR, para a região do gene da VP1/VP2 do Bocavírus. Foram amplificadas 12 amostras e sequenciadas. As sequências de nucleotídeos obtidas em nosso estudo, foram comparadas com as sequências do Banco de gene e identificadas como do grupo HBoV 1. Os resultados mostraram que a ocorrência do HBoV é um fator importante, para a realização do diagnóstico diferencial que pode se manifestar associado, ou como visto neste estudo, como único agente causador da infecção. Este agravo é um fator que possibilita estabelecer medidas de controle para a vigilância epidemiológica, no auxilio clinico para a conduta no tratamento da doença. Estaremos introduzindo, no laboratório do Instituto Adolfo Lutz, a metodologia para identificação deste agente, para melhor atender à comunidade e a pesquisa científica. A caracterização molecular demonstrou ser do grupo HBoV1 que está circulando na da cidade de São Paulo o que poderá contribuir, para outros estudos na vigilância molecular desse vírus. (AU)

ABSTRACT

The human bocavírus (HBoV) genus Bocavírus Parvoviridae Family relates predominantly respiratory diseases in childhood. Received this nomenclature due to genomic structure present similarities to bovine and canine Parvovirus genres. Four groups were detected HBoV-1, HBoV-2, HBoV-3 and HBoV-4. A retrospective study was carried out in the year 2010 using 300 nasopharyngeal secretion samples collected from children from 0 to 5 years of age with acute respiratory symptoms. The samples were recorded and processed in Respiratory Disease Center of the Adolfo Lutz Institute. Our goal was to detect the virus HboV and characterize HboV strains phylogenetically, in these samples and compare with the sequences deposited in GenBank. Of the 300 samples analysed by testing real-time PCR, 49 (15.75%) samples were positive for HBoV. All these samples were processed by PCR for gene region of VP1/VP2 of Bocavírus. 12 samples were amplified and sequenced. The nucleotide sequences obtained in our study were compared with the sequences of the gene Bank and identified as HBoV Group 1. The results showed that the occurrence of HBoV is an important factor for the differential diagnosis that can manifest associated or as seen in this study as single causative agent of infection. This interlocutory appeal is a factor that makes it possible to establish control measures for epidemiological surveillance in clinical assistance for conduct in the treatment of the disease. Clinical assistance in conduct for the treatment of the disease. We will be introducing in the Instituto Adolfo Lutz Laboratory methodology for identification of this agent to better serve the community and scientific research. The molecular characterization proved to be HBoV1 group that is circulating in the city of São Paulo which may contribute to other studies on molecular surveillance of this virus. (AU)