Diagnostic characteristics of Xpert MTB/RIF assay for the diagnosis of tuberculous meningitis and rifampicin resistance in Southern Brazil / Características diagnósticas do Xpert MTB/RIF para o diagnóstico de meningite tuberculosa e resistência à rifampicina no Sul do Brasil

ABSTRACT

ABSTRACT Background: The timely diagnosis of tuberculous meningitis (TBM) is challenging. Molecular diagnostic tools are necessary for TBM, particularly in low- and middle-income countries. Objectives: We aimed to calculate the diagnostics characteristics of Xpert MTB/RIF for the detection of Mycobacterium tuberculosis in the cerebrospinal fluid (CSF) and the frequency of rifampicin (RIF)-resistance in the CSF samples. Methods: A total of 313 consecutive CSF samples were studied and categorized into TBM definite, probable, possible, or not TBM cases based on the clinical, laboratory, and imaging data. Results: For the definite TBM cases (n=7), the sensitivity, specificity, efficiency, and positive likelihood ratio were 100, 97, 97, and 38%, respectively. However, for the TBM definite associated with the probable cases (n=24), the sensitivity decreased to 46%. All CSF samples that were Xpert MTB/RIF-positive were RIF susceptible. Conclusion: Xpert MTB/RIF showed high discriminating value among the microbiology-proven TBM cases, although the values for the probable and possible TBM cases were reduced. Xpert MTB/RIF contributes significantly to the diagnosis of TBM, mainly when coupled with the conventional microbiological tests and clinical algorithms.

RESUMO

RESUMO Introdução: O diagnóstico da meningite tuberculosa (TBM) é desafiador. Ferramentas de diagnóstico molecular são necessárias para esse diagnóstico, particularmente em países de baixa e média renda. Objetivos: Calcular as características diagnósticas do Xpert MTB/RIF para a detecção de Mycobacterium tuberculosis no líquido cefalorraquidiano (LCR) e a frequência de resistência à rifampicina (RIF) nas amostras do LCR. Métodos: Um total de 313 amostras consecutivas de LCR foram estudadas e categorizadas em casos de TBM definida, provável, possível ou não TBM, com base nos dados clínicos, laboratoriais e de imagem. Resultados: Para os casos definidos de TBM (n=7), sensibilidade, especificidade, eficiência e razão de verossimilhança positiva foram de 100, 97, 97 e 38%, respectivamente. No entanto, para os casos de TBM definidos associados aos prováveis (n=24), a sensibilidade diminuiu para 46%. Todas as amostras de LCR que foram positivas para Xpert MTB/RIF foram suscetíveis a RIF. Conclusão: O Xpert MTB/RIF mostrou alto valor discriminante entre os casos TBM comprovados por microbiologia, porém o valor nos casos prováveis e possíveis de TBM foram reduzidos. O Xpert MTB/RIF contribui significativamente para o diagnóstico de TBM, principalmente quando associado aos testes microbiológicos convencionais e algoritmos clínicos.