Complete genome sequencing of Pseudomonas syringae pv. actinidiae Biovar 3, P155, kiwifruit pathogen originating from China / Sequenciamento completo do genoma Pseudomonas syringae pv. actinidiae Biovar 3, P155, agente patogênico do kiwi, originário da China

ABSTRACT

Pseudomonas syringae pv. actinidiae is a bacterial pathogen of kiwifruit. Based on the results of the pathogenicity assay, we sequenced the strain Pseudomonas syringae (Psa3) P155 which possesses a series of virulence and resistance genes, CRISPR candidate elements, prophage related sequences, methylation modifications, genomic islands as well as one plasmid. Most importantly, the copper resistance genes copA, copB, copC, copD, and copZ as well as aminoglycoside resistance gene ksgA were identified in strain P155, which would pose a threat to kiwifruit production. The complete sequence we reported here will provide valuable information for a better understanding of the genetic structure and pathogenic characteristics of the genome of P155.

RESUMO

Pseudomonas syringae pv. actinidiae agente causal do cancro bacteriano do kiwi. Com base nos resultados do teste de patogenicidade, foi sequenciado um isolado de Pseudomonas syringae (Psa3) P155, que abriga a uma série de genes de virulência e resistência, elementos candidatos CRISPR, sequências relacionadas a profagos, modificações na metilação, ilhas genômicas, e também um plasmídeo. O mais importante foram os genes de resistência ao cobre, copA, copB, copC, copD e copZ, bem como, o gene de resistência aminoglicosídea ksgA identificados na estirpe P155, os quais representariam uma ameaça à produção de kiwi. A sequência completa relatada fornecerá informações valiosas para uma melhor compreensão da estrutura genética e as características patogênicas do genoma de P155.